问题标签 [ggpubr]

我正在尝试使用 ggpubr 包中的 ggscatter 函数在 R 中绘制散点图。我正在向您展示我的 data.frame 的一个子集

我想在 B1 vs B1、B1 vs B2、B1 vs C1、B2 vs C2 之间制作散点图。

我使用了以下命令

我得到单独的 4 个地块。我想在 1 个地块中拥有所有 4 个地块。我怎样才能做到这一点？

谢谢

我有以下代码：

产生了这个情节

但是，由于今天出现了这种情况，也许是因为一些更新？

知道如何解决此问题并将其与每列的错误栏一起返回吗？

我有一个df包含以下数据的数据框。我想绘制logCPM两组 A 和 B 之间的基因表达。

我尝试使用ggviolin.

我得到了这样的小提琴情节。

1）在这个我看不到小提琴上的任何胡须和任何点。

2）有没有办法显示哪个点是哪个样本？喜欢给点不同的颜色（例如：我对样本 10 感兴趣。我想给那个点不同的颜色，因为我有兴趣看到它的表达）

谢谢

我有一个这样的数据框（显示大数据框的一部分）

我想为 column2 在 cell1 和 cell2 之间创建一个散点图。但是我有 3 个单元格 1 的值，只有 2 个单元格 2 的值，如示例数据框中所示。我还想使用第 4 列为点着色。

我知道如何使用颜色包中的ggscatter函数ggpubr（使用调色板选项），但是如何为不同长度的 x 和 y 创建散点图？

这里x = cell1有 3 个值和y = cell22 个值。
任何帮助，将不胜感激。

我正在按照教程中的代码构建自己的图表：

我想显示每列（底部或顶部）的观察次数，以及误差线和重要性。任何人都可以以 ToothGrowth 为例进行这样的绘图吗？

我正在尝试用ggpubr's可视化显着性水平（星号） stat_compare_means()。我遇到了以下问题：与 相比compare_means()，您不能将分组变量添加到比较中。例子：

如您所见，显着性水平并未显示在所有条形上方，而仅显示在不同剂量上方，因为 ggpubr 不区分不同的 supps。

有什么方法可以与这些（子）集进行比较吗？

谢谢

如何将ggpubr::ggbarplot图形的偏差点从更改0为1. 使用下面的示例，所有值 <1 的条都以蓝色面朝下

我知道以前有人问过这个问题，并且我已经查看了解决方案，但它们不适用于我的情况。我有一个小数据集（BCAAparams），其中包含在不同浓度的抑制剂存在下酶的 Km 和 Vmax 值（变量是 Km、Vmax 和 Conc（抑制剂）），每个 n=6。

我正在寻找分析抑制剂对每个酶参数的影响，例如，

我正在使用 ggpubr，我可以成功比较不同组的平均值（抑制剂的浓度）

问题是我找不到添加 stat_compare_means 命令的方法，该命令会将括号和相关的调整后的 p 值放到我的箱线图中，例如；

我收到错误消息“提供给连续刻度的离散值”。我已经尝试将 stat_compare_means 命令移动到代码中的其他“位置”，并且我还尝试了我在其他帖子中看到的回答类似问题的内容，将箱线图设置为对象，然后将 stat_compare_means 添加到它但沿着这些路线没有任何效果。有没有人知道我做错了什么？

我想计算一个只包括 gr1-gr3 不包括 gr4 的方差分析。这可以使用stat_compare_means()吗？

我尝试使用 R 在箱线图上添加“p”值，但是当我使用 stat_compare_means 时出现错误。我在谷歌上快速查看，但我仍然不明白......

这是我尝试显示的箱线图：

这里提出了错误

我怎样才能解决这个问题？