问题标签 [ggpubr]

我有一个数据框：

并且正在使用以下函数来绘制数据的各种组合

通过使用以下对函数的调用来制作绘图：

这会生成这个图：

我想让该函数创建一个分面包装，可以有效地将 y 轴转换为两个段，以便这两个段的比例可以实现更好的数据可视化。事实上，当我用具有高度不同值的变量绘制图时，比例尺不适用于所有变量。

如果这是不可能的，那么是否有一种简单的方法可以在每个绘图的基础上手动引入一个 facet wrap 来分解 y 轴？

使用以下代码，我根据比较使用 pvalues 制作多面图。

但是，如您所见，p 值在 y 轴上被截断。我希望能够根据给定比较的最大值的高度重新定位它们（​​即，比较条的高度和 pvalue 应该根据每次比较中最高点的高度自动调整）。任何有关如何执行此操作的帮助或指示将不胜感激！

我在 R 中使用来自 gpubr 的 stat_compare_means() 绘图函数，并且试图为 wilcox.test 指定左尾（或替代 =“less”）规范。不幸的是，我无法获得让我能够这样做的功能。

任何人都可以协助指定替代方案吗？

我在 gpubr github 帐户上列出了一个问题，但尚未收到对此的反馈。

任何想法都会很棒。

MWE如下：

ggboxplot我正在使用from创建一个箱线图ggpubr。compare_means但是，由（0.08 如下代码所示）给出的 p 值与我手动计算的（0.1）不同。我使用这个功能有什么问题吗？为什么会出现这种差异？

数据plt2：

编辑

正如 Jimbou 评论的那样，ggpubr设置exact = FALSEwhen do wilcox.text。这导致了上面报告的差异。

我正在使用 ggpubr 包用 ggboxplot 做箱线图。关于如何增加相邻箱线图之间距离的任何建议？

我已经使用 R 几个星期了，我知道我的脚本可能会写得更好。

我的代码：

我是 R 新手，并试图在与 R 相同的页面上显示图形和图像。我尝试使用library(ggpubr)和ggarrange()运行。

导入我使用的图像library(png)并readPNG()导入我的图像。

我想要的最终结果是这样的：

我用来创建面板的代码是：

诅咒我使用power-point手动插入图像。

谢谢，

ggpubr包提供了绘制ggpaired成对数据的功能。它没有这样的add='jitter'选项ggboxplot。

是否可以通过不同的方式达到类似的效果？

文档中的示例：

我正在使用 R Notebooks 并且有一个包含一些用于排列直方图的代码的块。当我使用一个常见的图例时，它会产生一个额外的空图，在渲染的 html 文件中看起来很糟糕。这种现象在没有共同传说的情况下消失了，但情节看起来很糟糕，因为它们的大小不同。有什么办法可以阻止它产生额外的空图？

以及块中使用的代码

How can I change the font size of stat_compare_means on the plot below? I.e, change the "Kruskal-Wallis, p = 1.5e-09" and the other p-values font size? I would like to use a smaller font size than the default one...

Following the data example...

Plot:

我知道已经有很多问题可以在多面图中添加 ggplot2 中的显着性水平。但是，作为 R 初学者，我没有找到适合我的情节的解决方案。我的数据（.txt 文件）可在此链接中找到：

1drv.ms/t/s!AsLAxDXdkA9Mg8oXdJ-qxD5AeB4KAw

有四列：三个因素水平（温度、寄生生物种类和行为）和一个数字水平（寄生数量和宿主杀死）。

我用代码运行情节：

现在我想在每个图中添加显着性水平，分别比较两种温度下寄生和宿主杀死的结果。所以我在每个情节中有6个对比。我使用函数 stat_compare_means 测试了该选项。但是，正如本 Rblogger 教程 ( https://www.r-bloggers.com/add-p-values-and-significance-levels-to-ggplots/ ) 中所建议的，我应该列出我想要比较的内容。但是，在这种情况下，我有两个 25°C 的结果和两个 30°C 的结果。我如何创建这个提到所有对比的列表？如果有人能为我澄清如何解决这个问题，那将对我有很大帮助。谢谢。