问题标签 [ggpubr]
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r - FactoExtra 包中函数 fviz_pca 中点形状的自定义
我一直在努力对fviz_pca
来自 R 包的函数中的输出图中的默认点形状进行更改FactoExtra
。
该图以我要自定义的点形状的特定顺序*出现。
*对应的形状分别是16,17,15,12,0,8
我尝试添加到该功能:
它给我返回了一条错误消息:
geom [1] 中的错误:“环境”类型的对象不是子集
在函数 fviz_pca 中管理和自定义点形状有什么建议吗?
r - 多面和对齐图的多页输出
我正在尝试将多面箱线图与等面线图结合起来,两者都应该正确对齐,以便清楚哪些图属于一起。我实际上可以像这样实现我想要ggpubr::ggarrange()
的(我称之为 2x4 布局,即 2 行乘 4 列):
实际上,虽然我有比 4 更多的类(例如n_classes = 21
,但数量可能会根据基础数据而变化),所以我最终会得到一个不可读的 2x21 绘图。现在我想将整个 2x21 绘图拆分为 2x4 绘图的页面,理想情况下,同时保留常见的图例,以便点大小在页面之间保持可比性。这样做的最佳方法是什么?
[我看到ggarrange()
确实有多页支持(见http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/81-ggplot2-easy-way-to-mix-multiple-graphs -on-the-same-page/#annotate-the-arranged-figure)但我认为这在我的情况下不起作用,因为我正在使用分面。似乎没有办法说明ggarrange()
这一点p_top
,p_bottom
每列由 4 列组成。]
使用的代码
由reprex 包(v0.2.0)于 2018 年 7 月 2 日创建。
r - r:在 ggplot 图中插入 ggtexttable()
我正在尝试在我的 ggplot 图的绘图边界内插入我使用 ggpubr 包中的 ggtexttable() 函数创建的表。但是,我不断收到此错误:
我不明白为什么我会出错,但我觉得这与我的 x 轴上有日期有关?我将不胜感激任何反馈以解决此问题!谢谢!
数据:
代码:
r - 使用 R 中的 ggscatter 按组着色
我正在使用 ggpubr 库中的 ggscatter 函数制作散点图。我的数据框看起来像这样
这是我正在使用的命令
我想使用第12列为点non_sig
着色sig
non_sig
black
sig
red
当我使用上面的代码时,它会做我想要的,但是我如何才能在这里专门为
谢谢您的帮助!!
r - 比较ggplot中的相关比例
我的问题
我想使用mcnemar.test
和ggplot2
ggalluvial
我的测试数据:
我的情节:
给我:
我试图得到什么:
现在我想添加括号来显示mcnemar.test
比较基线与方法 A 和 B 之间的依赖比例的结果(例如 p 值)。
stat_compare_means
我从ggpubr
(http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/76-add-p-values-and-significance-levels-to-ggplots/)想到了类似的东西. 但是,stat_compare_means
仅涵盖比较方法的方法,我如何比较比例?由于我的真实数据集非常大,我尝试找到一种方法将测试结果自动添加到 ggplot 中。