问题标签 [ggpubr]

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r - 使用 ggpubr 在箱线图上添加平均值

我正在尝试使用 ggpubr 包在 boxplot 上添加标签。这是我使用的代码:

以及样本数据(ToothGrowth)

有什么方法可以将平均值作为文本添加(除了点使用:add="mean")

如果可能的话,我想将平均值文本放在来自“stat_compare_means”代码的“p=0.000”下方。

另外,有没有办法删除分组情节时自动生成的图例?

我想要制作的最终情节如下所示:

https://i.stack.imgur.com/qudMy.png

  1. 在箱线图上添加平均值作为文本
  2. 删除顶部的图例

提前致谢!

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r - 向 ggballoonplot() 添加轴标签和标题

我使用的代码和结果如下图所示。主要问题是标题没有出现在中心,x 和 y 标签根本没有出现。我该如何解决?

图表和代码

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r - FactoExtra 包中函数 fviz_pca 中点形状的自定义

我一直在努力对fviz_pca来自 R 包的函数中的输出图中的默认点形状进行更改FactoExtra

该图以我要自定义的点形状的特定顺序*出现。

*对应的形状分别是16,17,15,12,0,8

我尝试添加到该功能:

它给我返回了一条错误消息:

geom [1] 中的错误:“环境”类型的对象不是子集

在函数 fviz_pca 中管理和自定义点形状有什么建议吗?

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r - ggplot2/ggpubr 可视化分组数据子集的全局 kruskal-wallis 的显着性水平

我想使用显示 kruskal-wallis 检验的 p 值的条形图来可视化我的数据。

问题是我想比较显示的数据的子集,即我想比较 vs=0 的汽车的比例,具体取决于汽车的档位数。

这是我第一次使用 ggpubr(),我不知道如何为此目的使用 stat_compare_means()(如果它真的可能的话??)。

谢谢你的帮助!

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r - 多面和对齐图的多页输出

我正在尝试将多面箱线图与等面线图结合起来,两者都应该正确对齐,以便清楚哪些图属于一起。我实际上可以像这样实现我想要ggpubr::ggarrange()的(我称之为 2x4 布局,即 2 行乘 4 列):

实际上,虽然我有比 4 更多的类(例如n_classes = 21,但数量可能会根据基础数据而变化),所以我最终会得到一个不可读的 2x21 绘图。现在我想将整个 2x21 绘图拆分为 2x4 绘图的页面,理想情况下,同时保留常见的图例,以便点大小在页面之间保持可比性。这样做的最佳方法是什么?

[我看到ggarrange()确实有多页支持(见http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/81-ggplot2-easy-way-to-mix-multiple-graphs -on-the-same-page/#annotate-the-arranged-figure)但我认为这在我的情况下不起作用,因为我正在使用分面。似乎没有办法说明ggarrange()这一点p_topp_bottom每列由 4 列组成。]

使用的代码

reprex 包(v0.2.0)于 2018 年 7 月 2 日创建。

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r - r:在 ggplot 图中插入 ggtexttable()

我正在尝试在我的 ggplot 图的绘图边界内插入我使用 ggpubr 包中的 ggtexttable() 函数创建的表。但是,我不断收到此错误:

我不明白为什么我会出错,但我觉得这与我的 x 轴上有日期有关?我将不胜感激任何反馈以解决此问题!谢谢!

数据:

代码:

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r - 使用 R 中的 ggscatter 按组着色

我正在使用 ggpubr 库中的 ggscatter 函数制作散点图。我的数据框看起来像这样

这是我正在使用的命令

我想使用第12列为点non_sig着色signon_sigblacksigred

当我使用上面的代码时,它会做我想要的,但是我如何才能在这里专门为

谢谢您的帮助!!

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r - 在 ggpairs 中添加 ylabel 和点形状变化

ggpairs提供带有两个箱形图连接点的图表,以显示干预前后的情况。

  1. 想要更改 y 轴标签“Resist”“Suscept”而不是“3GCr”和“3GCs”。

  2. 并希望使用 r 默认形状更改数据点,例如 Resist= circle (1) & Suscept= Diamond(5)

搜索了几个网站,但没有得到想要的结果。还要添加代码和输出:

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r - 在 ggplot2/ggpubr 中显示成对箱线图之间的 Spearman 相关性

我有一个包含三个箱线图的图,我需要使用 ggplot2 或 ggpubr 显示成对箱线图之间的 Spearman 相关性。

制作类似的图很容易,但需要成对的 p 值。例如,

在此处输入图像描述

如何制作类似的图,但使用 Spearman 相关而不是 p 值?

任何帮助表示赞赏

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r - 比较ggplot中的相关比例

我的问题

我想使用mcnemar.test ggplot2ggalluvial

我的测试数据:

我的情节:

给我:

桑基图

我试图得到什么:

现在我想添加括号来显示mcnemar.test比较基线与方法 A 和 B 之间的依赖比例的结果(例如 p 值)。

我试图得到什么

stat_compare_means我从ggpubrhttp://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/76-add-p-values-and-significance-levels-to-ggplots/)想到了类似的东西. 但是,stat_compare_means仅涵盖比较方法的方法,我如何比较比例?由于我的真实数据集非常大,我尝试找到一种方法将测试结果自动添加到 ggplot 中。