问题标签 [ggpubr]

这是一个MWE：

我做了2个图表。第一个在 2 x 2 网格中有 3 个图形。

第二个在 2 x 2 网格中也有 1 个图形。这样，最初的 3 个图和最后 1 个图的大小相同。

如何在 2 x 1 网格中创建最后一个图形，但它应该保持与 2 x 2 网格中相同的大小？

我正在尝试将 ggplot2 图添加到列表中，以便我可以使用 ggpubr 中的 ggarrange 函数将它们组织在多个页面上。

由于有数百个图，我正在使用一个函数来生成和保存图，但我无法让它将图返回到环境或将名称写入列表。

我相当确定这是我遗漏但无法发现的简单事物。

我正在使用的绘图功能是：

我想在我的线性回归中使用R 将显着性水平（***或）显示为标签。这似乎是通过使用此处发布的：https ://www.r-bloggers.com/add-p-values- and-significance-levels-to-ggplots/n.s.ggpubraes(label = ..p.signif..)

但是，当我简单地替换my中的..p.label..by时，即。stat_cor(aes(label = paste(..rr.label.., ..p.signif.., sep = "~ ~"))` 我的情节没有任何变化，只是我得到一个错误：..p.signif..stat_cor(aes(label = paste(..rr.label.., ..p.label.., sep = "~~")),

请问，我怎样才能在我的情节上绘制星星（*、、*）或 ns 值而不是精确的 p 值？非常感谢您。

我的虚拟数据：（借自http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/78-perfect-scatter-plots-with-correlation-and-marginal-histograms/）

我想在一个图中有不同的图形，但是我用于它的命令 ( grid.arrange) 扭曲了我的图表的条形。除此之外，我想将每个图表的标题（A、B、C ..）放在图表的顶部，而不是在它出现的一侧。

在图 1 中，我有一个图（正确的条形图），第二个图是所有图。有人可以帮我重新调整这个命令吗？

谢谢

我的数据：

我正在grouped dotplot用ggplot2绘制 a ，效果很好。但是如果我stat_compare_means从ggpubr包中使用来添加p-value s，它就行不通了。当我compare_means在绘图环境之外使用它时，它工作正常，并且我得到了正确p-values的数据集（使用compare_means(X1 ~ X5, data=titer_lung, method="t.test"）。

我正在使用以下数据：

通过使用以下代码，我得到了我正在寻找的情节：

当我想将 group1 与 group2 和 group3 与 group4 进行比较时，我写道：

但后来我收到以下错误：

删除了 1 行包含非有限值 (stat_signif)。
计算失败stat_signif()：需要 TRUE/FALSE 的缺失值

我想它的值应该没有问题NA，因为compare_means也不会打扰。

我对每一个帮助都很满意，谢谢！！！

问题

我非常喜欢ggpubr包中密度图和 QQ 图的整体呈现方式。我想使用函数ggdensity()和ggqqplot在同一个绘图窗口上绘制三个密度图和三个 QQ 图。

我使用par(mfrow=c(2,3)来创建首选的绘图排列；但是，我无法弄清楚为什么这个函数不会按照指定的方式绘制图形。相反，代码是在每个绘图窗口绘制一个绘图。

有人能伸出援手吗？非常感谢，如果这是可能的。

R代码：

例子

该代码使用 par(mfrow=c(2,3)) 为每个绘图窗口绘制一个绘图，而不是 2 行和 3 列

数据

我有箱线图，我想为两个因素的 4 个比较添加 pvalues。

这是数据集：

这是我目前的图表：

我已经安装了 ggpubr，并阅读了 compare_stat_means，但不知道如何进行涉及这两个因素的比较。那就是我想要4个pvalues

M+/I+ 对比 M-/I+，M+/I- 对比 M-/I-，I+/M+ 对比 I-/M+，以及 I+/M- 对比 I-/M-

任何帮助表示赞赏。谢谢

> 太好了。现在感谢 Jimbou，我有以下情节。

但是，我想重新订购这些盒子，即。首先是所有 I+ （其中首先是 M+）。我尝试重新排序级别，然后手动排列行，但都不起作用。

任何帮助表示赞赏

使用 ggpubr 运行以下命令时，我收到错误

“f(...) 中的错误：只能处理在 x 轴上绘制的组的数据”

stat_compare_means在我的另一个情节中运行，当 x 是项的交互时，这不是其他人遇到的问题。（有关该问题的详细信息：https ://github.com/const-ae/ggsignif/issues/16 ）

的价值

是

所以看起来像是my_comparisons一组现有的术语？（我想在它工作时进行更多比较）

我正在使用 ggpubr::lineplot 绘制线图。我的 x 轴是连续变量。

我的时间标签是等距的。似乎线图将时间视为因子而不是连续变量。

有谁知道如何纠正？我想使用 ggpubr::lineplot 因为它还有许多其他功能。我知道如何只用 ggplot 绘制线条。

ggplot2假设我有三个由包装制成的方形地块 p1 p2 p3 。之后我ggarrange在 package 下应用了命令ggpubr来制作一个 1*3 的图。以下是命令：

rmarkdown 输出（下图）在排列的图下方显示了一个大的空白区域：

有什么办法可以去掉吗？我的想法是改变画布的默认大小..