问题标签 [kruskal-wallis]

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matlab - 如何处理 Matlab 中 Kruskal-Wallis 测试中的缺失值?

Matlab 文档似乎不清楚如何在使用kruskalwallisKruskal-Wallis(或任何其他相关)测试时忽略丢失的数据。对于不相等的组大小也是如此。

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r - 从 Kruskal-Wallis 输出中提取 p 值

假设我有一个数据框

我已经用我拥有的数据运行了 Kruskal-Wallis 测试df

我想做的是将p值提取到向量中(只有没有标签'p值'的值)。我试过这个:

显然,没有运气。

我从谷歌教授那里得到的初步帮助使我达到了上面所描述的观点。

真诚感谢所有帮助。谢谢!

PS。请注意,数据仅用于提供示例。我没有测试正态分布,也不希望对这些数据进行测试。我的原始工作数据没有正常分发,但由于保密因素,我不会使用它 - 或它的一部分 - 作为示例。示例数据的行为类似于我的原始工作数据。

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r - 如何创建一个表作为 dunn.test 输出(R)?

我正在处理细菌焦磷酸测序数据,并且正在使用 R 进行统计分析。我有 21 个样本和 7 种不同的处理方法。我将数据加载到 R phyloseq 中,获得:

由于我发现治疗(具有阿多尼斯功能)之间存在统计学上的显着差异,因此我想知道哪些 OTU 在不同的治疗中具有不同的丰度。为此,我使用了函数 dunn.test(结合了 Kruskal-Wallis 测试),首先交换 OTU 表中的行和列以应用测试:

这个递归函数的输出很难阅读,尤其是对于所有 7498 OTU。

有没有办法以递归方式应用 Kruskal-Wallis + Dunn 检验,将表格作为输出,最好按重要性顺序,并且不仅包含 OTU 代码,还包含 tax_table(psR) 中包含的分类标识?

非常感谢!

莉迪亚

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r - 在R中发现卡方的意义

我需要从包的函数中提取/复制Kruskal-Wallis卡方的显着性( p-value )变量,但它没有返回。问题是:如果我有卡方和相关的自由度,可以计算p 值,如何计算?dunn.testdunn.test

我的数据:

我的代码:

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r - 显示 Kruskal-Wallis 测试等级

我对多处理数据进行了 kruskal wallis 检验,比较了五种不同的方法。

一位朋友向我展示了 spss 中的计算,结果包括每种方法的平均秩。

在 R 中,我只在应用于我的数据集时得到chi2and 。这些值等于 spss 中的值,但我没有得到任何排名。df valuep-valuekruskal.test

如何打印出计算的等级?我的代码如下所示:

如果我打印比较,我会得到以下信息:

但我想从 spss 获得类似这样的额外输出:

我如何在 r 中完成这项工作?

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r - 使用 Kruskal-Wallis 秩和检验的 kruskalmc 的 R pgirmess 替代方案

作为我对 Kruskal-Wallis 秩和检验的分析的一部分,我在运行 kruskal.test 之后尝试运行 krushkalmc 方法。

但是,我在尝试安装包含 krushkalmc 的 pgirmess 包时遇到了困难。

尝试从 R 内部安装它:

所以我下载了它并尝试手动安装它:

这是我的 sessionInfo()

我试图确定是否有任何其他包有 kruskalmc 但没有看到。

您对我可以使用的替换包有什么建议吗?该包可以通过测试深入了解 Kruskal-Wallis 秩和检验的结果?

install.packages 上是否有调试模式以查看可能是什么问题?

谢谢你的帮助

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r - r中的kruskal-wallis对比测试

全部,

我想在诸如 kruskal wallis 之类的秩中位数移位测试中执行相当于 TukeyHSD

我现在想分析一下对比。请帮忙。谢谢。里克

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python - Python 中 Kruskal-Wallis 测试的输入格式

我正在比较癌症患者和健康人结构断裂的 DNA 区域。我正在尝试对每个区域的中断次数进行 Kruskal-Wallis 测试(SciPy Stats),以查看两个分布之间是否存在差异。我不确定 Kruskal - Wallis 的输入应该是数组(文档)还是数组列表(互联网上的其他地方)。

首先,我尝试了一个用于样本+控制的数组,如下所示:

这给了我所有项目的以下输出:

我还尝试将单个数据点转换为数组,然后运行 ​​KW 测试。

(1.0, 0.31731050786291404)即使我大幅更改了其中一个列表,这也适用于所有比较。

深入挖掘,我读到输入应该是一个数组列表,所以我认为只给出两个数据点(一个样本,一个控件)可能会导致“(0.0,nan)”,所以我也尝试了。

这给了我这个错误:

现在我不确定要使用什么格式/类型,希望任何人都可以帮助我!

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posthoc - 在进行 Kruskal-Wallis 之后,我应该进行哪些事后测试?

我有一个很长的数据集(N=499)。我从中比较了索引在 8 种不同处理中的表现(每种处理中的样本数量不同)。

我已经做过 Kruskal-Wallis,效果显着(p 值 < 2.2e-16)。

现在,对于事后测试,我正在考虑使用 Dunn 测试,但我读到 Wilcoxon 也可能有用,有什么建议吗?

非常感谢大家。

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r - R中多重比较的成对检验(Nemenyi检验)

我正在使用该软件包PMCMR执行博士后 Kruskal-Nemenyi 测试。当我使用默认设置运行测试时:

我得到以下结果和警告:

当我运行测试将分布更改为 Chisq 以对关系应用校正时,我仍然得到相同的结果并且不使用卡方分布。

我想知道包中是否有错误,或者是否有任何我不知道的方法来解决这个问题。