问题标签 [kruskal-wallis]

我有一个看起来像这样的数据集，我正在尝试对其执行 Kruskal Wallis 测试

它的r代码如下：

但是，我收到此错误：

我在用 R 编写 Kruskal-Wallis 测试时遇到问题。我试图找出它是如何工作的，但找不到任何答案。我有一个包含 89 列的数据集，我必须将每一列与一组其他列进行比较。

例如，我在这 89 列有各种引伸计和其他仪器的数据，但我需要将引伸计相互比较。由于 Kruskal-Wallis 是对三个或更多组的测试，我可以用我的数据集来做这件事吗，我应该对其进行矢量化，列出一个列表还是必须逐个比较它？

我正在尝试以 1 by 1 的方式制作此循环：

并得到所有观察值都在同一组中的错误。

我是 R 编程的新手，在分析代谢组学数据时寻求帮助 - 118 种代谢物，4 个条件（每个条件 3 个重复）。我想知道，对于每种代谢物，哪个条件与哪个条件显着不同。这是我的部分数据

这就是我到目前为止所拥有的。

我从这篇文章中学到了第一行

这就是我遍历过去 KW 测试的代谢物的地方

我不确定如何管理我的output，​​以便更容易管理通过 KW 测试的所有代谢物。也许保存每次迭代的输出附加到excel？我还尝试了 dunn.test 包，因为它具有表格或列表输出选项。但是，它仍然让我停留在同一点上。有点卡在这里。

此外，我是否还应该在 KW 测试之后执行某种调整后的 p 值，即 FWER、FDR、BH - 在执行事后测试之前？

任何建议将不胜感激。

我进行了邓恩检验来比较三个名义变量的因子分数分布。如何解释 Z 统计量的符号？Z统计是否说明了方向？

我设法用我的 2 个定量变量创建了一个多面箱线图；我知道如何运行 kruskal-wallis，然后进行 Wilcoxon 检验，并在箱线图中显示字母的显着差异，但仅在一个简单的箱线图中，有一个变量且没有方面。我能怎么做 ？（如果可能的话，我想用字母表示显着差异，我希望我能够发布我已经做过的照片，但显然我不允许）另外，我还有另一个问题；函数 stat_function_mean 执行哪个测试？我尝试使用此功能，但我不知道如何使用它......这是我的代码没有测试，只有我的两个变量的分面箱线图：

带有 2 个测量变量（FF 和 FM）的方面箱线图的代码

在图表上添加显着差异的代码，带有字母，但只有 1 个测量变量 (FF)，没有刻面

用我的图表图片会更清楚，但显然我还不允许在我的帖子中包含图片，对不起

在此先感谢您的帮助

我正在尝试对 R 中的示例数据框（df）中的多列运行 Kruskal wallis 测试，但我遇到了以下错误：

这是我的示例数据框（df）：

这是我的代码：

当我单独运行每个基因时，此代码运行完美，例如，对于 Gene1：

但是，当我使用 lapply 甚至 for 循环时，它会给我这个错误。我已经多次搜索过这个错误，但以下答案都没有帮助我。

1. 我知道这可能是由于文件中的 NA 造成的。但是，我无法避免 NA，因为我的数据框比这大得多。此外，即使有 NA，该测试也可以完美地针对每个 Gene 单独运行，无需 lapply 或 loops。
2. 'Groups' 变量的可变长度与所有其他变量的长度相同，因此这也不是问题。

我在这里发布我的数据片段：

任何进一步的帮助表示赞赏。感谢您。

这可能听起来有点简单，但我无法得到答案。

我在 R 中有一个数据集，其中行中有 26 个样本，列中有许多变量（> 20）。其中一些是分类的，所以我需要做的是根据每个分类变量对每个数值变量进行 Kruskal Wallis 检验，所以我这样做：

但是这样我只能对数值变量一个一个的做测试，很烦人。

有没有办法一次对所有数值变量进行所有 Kruskal-Wallis 检验？我可以按每个分类变量重复它​​，因为我只有 4 个，但对于数字变量，我有 20 多个！！

非常感谢

我正在处理包含 id、id 国籍（欧盟、美国、其他）、权重（属于某个国籍的概率）和 id 工资的数据集上的 python。根据重量，我可能会重复两次 id。

目的是使用 Kruskal Wallis 测试（关于 id 工资和国籍） 我最大的疑问是：如果 kruskal 的 scipy 函数不允许我处理权重，我怎么能做到这一点？

我知道在 R 中有 wtd_mwd 函数，但我在 Python 中找不到类似的东西

我正在尝试在 python 中进行 Kruskal Wallis 测试，它不仅可以提供 H 统计数据和 p 值，还可以提供效果大小。

我已经尝试过 scipy 的 stats.kruskal() 函数，但只返回了 H 和 p 。使用熊猫数据框，因此我将数据框的两列（将来我可能需要多于两列）转换为数组并运行 scipy.stats.kruskal(L_arr,E_arr)

我首先将感兴趣的两列从 pandas 数据帧转换为两个数组 L_arr 和 E_arr。然后我跑了：

我得到的结果：KruskalResult(statistic=1.2752179327521276, pvalue=0.2587900768563777) 我希望我也有办法获得效果大小？

我有一个包含两列的 CSV 文件：组和权重。我可以进行 Kruskal–Wallis 测试：

我想计算与对照组的成对多重比较（有不同的处理方法）。我试过dunn.test.control了，但我只得到错误。我认为我没有正确使用该命令。

知道我做错了什么吗？随意展示一个例子！