问题标签 [kruskal-wallis]

我计划对组间的多个变量进行 kruskal-wallis 检验（例如，out1、out2 和 out3 在序数水平上的疾病差异），并根据递减的 KW 测试结果获得排序的变量 [例如 out2、out3、out1]。但是，收到错误消息：“ValueError: If using all scalar values, you must pass an index”。那么如何解决呢？

我正在尝试将 Kruskal Wallis pvalue 添加到我的箱线图中，虽然我已经看到了很多关于该解决方案的帖子，但我无法让它发挥作用。

这是我的数据和运行箱线图的代码：

在这篇文章中，我看到了一种方法，但是当我尝试做同样的事情时，我得到了这个错误Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'groups_age' not found并且没有显示情节。

编码：

请注意，我手动放置了 x 和 y，只是为了放置值。但是，我想更自动地完成它，这取决于基因的价值是否会发生变化。

有谁知道我为什么会收到该错误以及为什么它不起作用？

首先十分感谢

问候

我正在尝试对效果大小进行成对比较。我可以用 来做到这一点coh_d，但是，它让我重复比较。例如，在以下代码中，setosa vs. versicolor 与 versicolor vs. setosa 相同（除了翻转的负号/正号）。

1.) 这两种组合都需要报告吗？如果没有，有没有办法删除重复的比较？

2.) 有没有办法在每次比较的输出中添加一个识别列。在上面的代码中，这将添加 6 行标记为 Sepal.Length，因此当我找到多列的效果大小时，我知道比较属于哪个变量。我希望最终输出看起来像：

虽然 usingkruskal_effsize给了我想要的输出格式，但它没有显示成对比较，这就是我切换到coh_d.

任何帮助，将不胜感激。

我有一个数据框 90 个观察值和 124306 个变量，名为 KWR 所有数字数据。我想在组之间的每一列中运行 Kruskal Wallis 分析。我在名为“Group”的变量后面添加了一个带有每个不同组的向量。为了测试准确性，我使用以下代码测试了一种肽（名为 x2461）：

结果很好，立即给了我一个结果。但是，我需要分析所有变量。我在阅读这篇文章时使用了 lapply：How to loop Bartlett test and Kruskal tests for multiple columns in a dataframe？

然而，在 R 不停地工作 2 小时后，我辞掉了这份工作。有没有更有效的方法来做到这一点？

提前致谢。

注意：第一次发帖，R 初学者