问题标签 [rnotebook]

我正在尝试在 R 笔记本中创建一个增量 HE 图，该图将被编译为 HTML（因此是一个 .R 文件）。我heplot()在heplots包中使用的函数使用一个add = TRUE参数将图形覆盖在前一个图形上，这在您希望比较多个组时很有用。

如果我将其作为 R 笔记本运行，则会收到以下错误：

我相信这是因为 R 笔记本在评估第二个图时没有将前一个图保存在内存中。

这是有问题的 R 笔记本文件的可重现示例（另存为 .R）：

我认为可能使用块选项，例如fig.show="hold"可能有效，但这并没有解决问题。

如果我在 Rmarkdown 文档中编织它，它会按预期工作（另存为 .Rmd）：

所以，我的问题是：我怎样才能让 Rnotebook 编译器的行为类似于 Rmarkdown 编译器？

我正在用 sql 代码运行 R Notebook，但最终的 html 输出文件中没有显示 SQL 代码

R 代码照常显示。

最近我偶尔会遇到这个错误“tibble 1.1 is not available”但我无法安装它。有什么建议吗？

已经有一些关于此的问题，但它们要么不清楚，要么提供了不起作用的解决方案，可能是因为它们已经过时了：

• 正确的 R Markdown 代码组织
• 如何获取 R Markdown 文件，如`source('myfile.r')`？
• http://yihui.name/knitr/demo/externalization/

大型项目的模块化代码结构

R Markdown/Notebook 很好，但它的呈现方式通常只有一个文件，其中包含所有文本和所有代码块。我经常有这样的单个文件结构不是一个好的设置的项目。相反，我使用单个.R主文件按顺序加载其他.R文件。我想使用 R Notebook 复制这个结构，即我有一个.Rmd文件，我从多个文件中调用代码.R。

以这种方式处理项目的好处在于，它允许使用 RStudio 使用文件进行良好的正常工作流程，.R而且还可以在不复制代码的情况下从 R Notebook/Markdown 获得整洁的输出。

最小的例子

这被简化以使示例尽可能小。两个.R文件和一个主.Rmd文件。

start.R

plot.R

然后是笔记本文件：

notebook.Rmd：

期望的输出

start.R所需的输出是通过手动将代码plot.R从notebook.Rmd. 这看起来像这样（由于屏幕空间不足而丢失了一些）：

我尝试过的事情

source

这会加载代码，但不会显示它。它只显示source命令：

knitr::read_chunk

此处提到了此命令，但source据我所知，实际上它的作用相同：它加载代码但不显示任何内容。

如何获得所需的输出？

我想在 Rnotebook 中调整 ggplot 图的大小。

它太大了，上面没有显示任何东西。当我导出它并将大小增加大约 4 倍时，它会显示细节。

我尝试了以下操作： set_plot_options fig.height, fig.width

调整图表的大小，但它不适用。

如果您知道如何调整绘图大小，请分享。

我有一台临时的 Windows 7 笔记本电脑（32 位），上面有 R 3.3.2 和 RStudio 1.0.44。

我正在使用 RStudio 笔记本，当我在其窗口中执行代码时它工作正常。但是，当我编译为 html（按预览）时，data.frames 消失了（有一个没有输出的块）。显示其他所有内容（矢量或图形）。它似乎与笔记本利用的 data.frames 的新可爱打印格式有关。事实上，如果我使用 R-markdown（切换到output: html_document），data.frames 以基本 R 格式显示没有问题。任何帮助表示赞赏。

当我在 R Notebook 中编写挪威语文本并生成 HTML_NOTEBOOK 输出时，它会在文档文本和内联 R 代码中正确显示字符 æøå。但是当相同的文本是 R 代码块的一部分时，字符将无法正确显示。这一切都在 RStudio 的源窗口中正确显示，但不能在预览或外部浏览器（如 Chrome 或 IE）中显示。

这是一个最小的可重现示例：

这最终在预览中看起来像这样：

检查 HTML 源代码，我们发现：

.Rmd 文件以 ISO8859-1 编码保存。使用 UTF-8 保存它会使 æøå 无法正确显示。

一些会话信息：

和

我在 Mac 上使用 R v. 3.3.2 和 RStudio v. 1.0.44。我喜欢使用 RMarkdown 和新的 Markdown Notebook 风格。但是，我最近注意到了一种新行为。我的 R 代码块中的换行符不会反映在 HTML 笔记本文件中。例如，我的 .Rmd 文件中的代码块如下所示：

在 nb.html 文档中呈现如下：

我回去查看我的一些“较旧”的 nb.html 文件，发现以前保留了换行符。有谁知道为什么这种行为会改变，更重要的是，是否有办法将其改回来？

我正在寻找一种方法来调整通常在查看器或浏览器中显示 html 表格的函数，以便在调用时自动将 html 插入 rnotebooks 等 knitr 文档中。

具体来说，我想改变包sjPlot中函数的行为方式。目前他们返回一个$knitr具有必须手动插入的属性的对象，然后在查看器中生成一个 html 表：

这些功能之一是sjt.frq。有没有办法做到这一点？

这个问题的标题是指几年前回答的这个问题。使用 data.table 和 knitr 提出并解决的问题似乎在 RStudio 和 R Markdown 的相对较新的 R Notebooks 中重新出现。

简而言之，如 data.table 常见问题解答 2.21 和 2.22 中所述，在使用 := 时，不应打印 data.table，引用运算符的赋值。打印行为是 R 和 knitr 的一个过去问题，data.table 的人们似乎已经花费了很多精力来修复（例如，请参阅他们的 GitHub 问题 #505）。但现在 R Notebooks 再次出现这种情况，无论是在交互模式下还是使用 Knit to HTML。

上一个问题几乎涵盖了行为的最小、完整和可验证的示例。简而言之，当从 R Notebook 或 R Markdown 文档运行时，将打印此语句：

从控制台或标准 R 脚本文件运行时，它不会打印。

我正在使用可通过 CRAN、v1.10.0 和 RStudio v1.0.44 获得的最新版本的 data.table。

上一个问题中提到的一些解决方法，例如使用 <- 或使用 invisible() 包装操作，确实适用于 R Notebooks。它们使用起来并不过分繁琐，但正如在上一个问题中所指出的那样，它们并不是理想的修复方法。

我非常感谢这款出色软件的用户，但我对内部工作原理仍然相当不成熟。如果我在某处遗漏了一些明显或重复的问题，我深表歉意。也许我应该用 RStudio 而不是在这里发布这个问题。干杯。