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有没有办法更改 ImageJ/Fiji 中的默认颜色图？也许这太明显了，但我没有在选项中发现它。或者有没有办法在打开图像后自动运行脚本并且脚本执行例如： run("Fire") ？

干杯

约翰内斯

我正在尝试创建一个 Imagej/Fiji 脚本来分析显微镜图像。作为管道的一部分，我想使用斐济提供的滚球 BackgroundSubtracter。根据 Imagej API，应该是这样的：

但是，如果我尝试在三通道图像的一个通道上运行它：

我收到一个错误：

类型错误：rollingBallBackground()：预期 8 个参数；得到 7

如果我附加另一个参数，让我们说另一个“False”或“1”，我就会得到这个错误：

TypeError: rollingBallBackground(): self arg 不能被强制转换为 ij.plugin.filter.BackgroundSubtracter

我究竟做错了什么？

当我尝试在斐济（ImageJ）运行名为 MicrobeJ 的插件时，我不断收到此错误

有人可以帮帮我吗

阿迪

我想测量图像中树枝的厚度。以下是从斐济获得的输出。

我想计算与每个边缘相关的厚度的平均测量值。我所说的边缘是指存在于任何两个分支点之间的段。

任何有关如何进行的指示都会非常有帮助。

图片来源：参考

编辑：节点是一个连接点或端点。如果不清楚，请告诉我，如果我需要进一步解释。例如，如果我们像这里显示的那样对上面的图像进行骨架化，则连接点或端点将是节点。如果有帮助，我可以分享上图的骨架化版本。

编辑2：

我正在寻找编写一个宏，它需要用户输入通过阈值分割肾脏。我目前正在运行这个：

当阈值颜色出现时，这里没有选项可以作为用户调整阈值。有谁知道我如何让用户能够调整阈值而不必每次都单击“图像->调整->阈值”？

谢谢！

我正在使用 Imagej/Fiji Weka 插件对图像的不同区域进行分类，我想获得这些区域以进行进一步处理……（作为 Rois？带有类的表？）

所以最后我想获得每个分段类的区域。我需要编写这个任务的脚本，因为它是管道的一部分......但不知道如何从 Weka Imagej 插件中提取结果......</p>

实际上这个代码示例只是为了说明这个想法。任何人都有一个关于应用分类器和导出结果的基本示例？先感谢您

所以这是我第二次发布这样的问题。上次我从一个名为@quantixed 的用户那里得到了很多帮助，但我再次需要帮助。

我的代码不起作用，但这与我试图从堆栈中分离图像有关，因为我需要分别分析每一层并寻找重叠（双阳性和三阳性细胞）。它一直运行，直到我尝试命名每一层。我尝试添加“startsWith”，因为无论堆栈如何，每一层都以 c:1/3、c:2/3 或 c:3 开头。这是代码：

我遇到的问题是它达到了x=startsWith("c:1/3")，它不能再进一步了。我知道其余的代码可以工作，只是在选择我希望它分析的堆栈层时遇到问题。每当我点击运行时，我都会收到此错误：

有任何想法吗？

当我更改打开的图像窗口时，它忘记了目录，我该如何检索它以再次保存这就是我在堆栈图像文件夹中创建目录的方式

这是我将活动图像窗口更改为 Montage.tiff 以将其保存到 splitDir 文件夹的地方

错误是未定义的变量。当我更改活动图像窗口时，我是否应该让全局 splitdir 保留它

提前致谢

我有一个合并的图像堆栈（来自两个复合堆栈），此处显示了一个切片的屏幕截图。这是在 ImageJ 中完成的。本质上，水（蓝色）被注入气体扩散层（即主要由碳纤维制成的多孔材料）。黑色区域是空气。如何获取合并的堆栈并在 ImageJ 中创建一个仅包含黑色区域的新图像堆栈？

为了把事情放在上下文中，我最终将采用三个不同的堆栈（气体扩散层、水、空气），从它们创建网格，并找到三个相交的位置（即三相接触线）。经过一些平滑后，我将计算沿所有接触线的顶点法线，以计算气体扩散层中水的平均接触角。

我正在尝试从它的源代码构建斐济软件。这是 github 页面：斐济源代码 我开始使用来自 ubuntu 终端的 maven 构建项目，我遇到了这个错误：