问题标签 [fiji]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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weka - weka.classifiers.neural.lvq 未找到

我在哪里可以找到 weka dev 3.7.11 jar 中的 lvq?在导入这个 weka.classifiers.neural.lvq 时,它向我显示了一个未找到的错误。

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imagej - imageJ/FIJI:我可以在 ROI 管理器的 ROI 列表中间添加一个新的 ROI

我有一些代码可以按特定顺序处理保存的 ROI 列表。我正在尝试返回并添加缺少的 ROI,但似乎只能将它们添加到 ROI 管理器中 ROI 列表的末尾。有没有办法将它们添加到特定位置?

谢谢

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imagej - 如何使用指定的坐标在斐济(imagej)中进行选线

如何通过设置起点和终点使用 ImageJ/Fiji 在图像中选择一条线?就像不在图像上绘制它一样,而是直接在某处输入坐标。

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image-processing - 在 ImageJ 中将两个图像相乘

我想在 FIJI / ImageJ 中进行一些图像处理,但不知道如何去做。我有第一张图像,称之为“imageA”,并想对其执行几个操作。我知道您可以转到 Process->Math 并有一些操作选项(加减乘法等),并且有一个用于编写宏的工具,以便您可以将一些操作合并到一个步骤中,但我不确定如何接近它以添加我想包含在操作中的第二张图像。

我想获取 imageA 并将其乘以相同大小的第二个图像 imageB,以及以下函数中概述的其他一些步骤:

输出图像 = sqrt((constant*constant) + (constant2*constant2) + (imageB*imageB))

图像 A * 输出图像。

常量是非常简单的输入,我可以简单地添加,但我不确定如何制作它,因此 imageB 也包含在函数中以生成最终输出,然后我将应用于 imageA。

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python - ImageJ 脚本:如何将一个图像添加到现有图像

在斐济 (ImageJ) 我打开了两个图像(Img1 和 Img2)。我想运行一个添加两个图像并将结果存储在 Img1 中的脚本。我打算在一系列图像中执行此操作,因此我想尽量避免创建和关闭许多图像。

这可能吗?我尝试了下面的代码,但是当我Sum3and50.show()在第一次AddSlice()调用后调用第二个时它崩溃了。基本上我很想能够Sum3and50+=imp[Slice]

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arrays - 在 ImageJ(斐济)中按索引号打印数组项

我试图弄清楚如何通过索引号访问数组中的项目。我编写了一个脚本,它将生成一个带有一些变量的数组。imageJ 邮件列表存档中有一个旧脚本(如下所示),它能够为数组中的已知值打印给定的索引值,但是有没有办法在数组本身中找到该值?即,如果我让用户输入应该在数组中的值的数量,我可以让宏从中调用数组中的值吗?

我的数组生成器:

读数可能类似于:

从数组数值调用索引示例代码:

谢谢!

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imagej - 超大图像集的查看器

我正在寻找可以有选择地查看数千张图像的查看器。例如,我有一组 1-1000 的照片。由于照片的大小(每张图片 8MB),我只希望查看 20-40 的照片。这是通过选择照片的特定坐标来完成的。

我所做的: - 在 ImageJ (FIJI) 上尝试了插件 BigDataViewer,但是,这不起作用,因为它只能查看拼接图像,但我希望在拼接之前提取所选图像。但是,是否有另一种方法可以使用 BigDataViewer 来完成这项任务?

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image-processing - 如何在 ImageJ 中创建所有二进制点的凸包

我有一个分离点的二进制图像。

运动的源二进制图像

是否有任何 ImageJ 插件可以构建所有点的凸包?

或者你能推荐另一个可以做到这一点的程序,而不是 ImageJ?

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imagej - 将插件合并到 ImageJ/FIJI 宏 (bUnwarpJ)

我正在尝试将插件 bUnwarpJ 集成到我一直在编写的 ImageJ 宏中。目的是调用这个插件,允许用户定义参数并运行它。这个插件有一个选项来保存用户定义的参数,即“保存地标”。我也希望通过在我的插件中调用: call("bunwarpj.bUnwarpJ_.saveLandmarks", output folder) 来执行此操作。

目前,代码为:

问题是一旦 bUnwarpJ 完成,你就不能调用 'save landmarks' 方法,并且也会丢失用户输入的数据。你会如何解决这个问题?

一个想法是有一个弹出窗口(在运行命令之前),它不会暂停用户交互,当用户完成定义地标时,他们可以在执行 call() 的这个窗口上单击确定,从而在保存地标的同时bUnwarpJ 正在运行。我遇到的问题是大多数弹出窗口会暂停其余代码。理想情况下,它会像:

#执行:调用(“bunwarpj.bUnwarpJ_.saveLandmarks”,输出文件夹);

任何帮助表示赞赏。谢谢!

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python - GenericDialogPlus - 将 FileField 保存为新变量?

新手在这里编写脚本。

我想创建一个对话框窗口,提示用户选择 2 个文件(“pos”和“neg”)。我还想将这些文件路径存储为变量以供以后使用。

我无法存储文件路径。我只能收集默认路径,而不是存储用户选择的路径。

但这只是回报:

你的文件 C:/Users/ C:/Users/

即使用户选择了一个新文件,即:C:/Users/test.tiff

我希望输出基于用户选择的任何内容:

你的文件 C:/Users/test.tiff C:/Users/negative.tiff

我错过了什么命令?谢谢!