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我正在使用 imageJ（斐济）版本：2.0.0-rc-43/1.50e 我安装了 IHC_Profiler（https://sourceforge.net/projects/ihcprofiler/）当我运行它时，它会显示一个控制台：

当我使用 imageJ 1.48 版本时，没关系。请问这个问题能解决吗？

我在 Ubuntu 上运行。调用 SimpleITK 的 Show 方法时，我无法在我的 FIJI (ImageJ2) 窗口中查看此类图像。

鉴于 FIJI 是一个可移植的应用程序，是否有必要执行更多过程才能正确链接 Show 方法？

提前致谢

我写了一个我想在斐济运行的 R 脚本（在 R 上完美运行）。我看到斐济可以理解 R 语言，但是当我点击“运行”时，我的似乎没有做任何事情。

在斐济的脚本开头是否有要指定的行代码，或者是否有要下载的 Java 包？如果 Fiji 表明该脚本可以在 R 中，那就是它必须工作，但我还没有找到方法。

我正在尝试编写一个 imageJ 宏，它将

1) 打开图像并将其拆分为两个通道 2) 对每个图像进行粒子分析并保存测量值 3) 保存原始图像并覆盖粒子轮廓

到目前为止，我已经意识到我需要先复制原始图像，以便以后可以将 ROI 保存在此之上。但是我现在不知道如何重命名这个重复的图像，所以我可以稍后选择它进行展平：

如果这是非常简单的事情，请提前抱歉，这对我来说都是全新的，并且从谷歌搜索中学到了！

我正在处理具有黑线“网”的显微镜样品。我想将图像转换为二进制，所以只显示暗部分，但我不确定如何标准化这个过程。图像具有不同的亮度和对比度，因此仅选择一个数字阈值是行不通的。我可以标准化整个图像的亮度和对比度，但有些样本的暗线比其他样本多，所以在我理想的标准化方案中，这些样本实际上应该具有较低的整体亮度。我正在考虑在每个样本上选择没有线条的区域，并对这些区域的亮度和对比度进行标准化，但我不确定如何最好地实现这一点，无论如何我希望有一个完全自动化的过程没有人为矛盾的余地。有什么建议吗？到目前为止，我一直在与 Fiji / ImageJ 合作。

Matplotlib 的颜色图不提供图像的 HiLo 颜色图，这在显微镜中经常使用。HiLo 显示了从低值到高值的灰度梯度，但低端的值以蓝色显示，高端的值以红色显示。

如何获得 matplotlib 图像的颜色图？

我正在尝试在 Eclipse 中运行 imageJ 项目，但是在运行项目时，我在控制台中打印此“System.getProperty(“plugins.dir”)”时得到“null”值，我已经包含了 imageJ jar(ij.jar)但仍然收到此错误。

我正在尝试在 ImageJ 中对文件夹中的所有文件运行 Thunderstorm 插件。执行本地化并获得结果后，我想将结果导出到 csv 文件中，以便 csv 文件的第一部分包含图像名称。这是我的脚本：

我确定我在“导出结果”、“filepath=[”+datapaths[i]+“data.csv] 部分中犯了一些错误。即使浏览了有关该主题的 8 个帖子，我也无法修复这个错误。请指教。

谢谢，

我在我的 Ubuntu 16.04 机器上安装了 fiji（imagej 的发行版），双击桌面图标打开了应用程序一秒钟，或者更确切地说，它试图打开，然后死了。我在网上寻找答案，并在此页面http://imagej.1557.x6.nabble.com/Fiji-crashes-UI-on-Ubuntu-all-recent-versions-td5005603.html上找到了可以尝试的

这将打印出程序使用的运行命令。它调用系统java。所以我复制了命令，并切换到使用包含的java（fiji和imagej带有他们自己的java）并修复了它。我用命令创建了一个 shell 脚本（引用包含的 java 可执行文件），这个脚本可以启动斐济。

我正在使用 jdk1.8 在 Windows 10 上工作，但出现以下错误。我尝试了很多但无法找到出现此错误的原因，错误快照如下。

这是我的 pom.xml

我也使用最新的斐济罐子。

我认为这一定是Opencv和Fiji之间的兼容性问题，因为我同时使用两者时都会出现错误。

你知道如何解决它吗？谢谢