weka - 将 Weka Fiji 插件分段导出为 ROI

Question

我正在使用 Imagej/Fiji Weka 插件对图像的不同区域进行分类，我想获得这些区域以进行进一步处理……（作为 Rois？带有类的表？）

所以最后我想获得每个分段类的区域。我需要编写这个任务的脚本，因为它是管道的一部分......但不知道如何从 Weka Imagej 插件中提取结果......</p>

实际上这个代码示例只是为了说明这个想法。任何人都有一个关于应用分类器和导出结果的基本示例？先感谢您

import trainableSegmentation.*;
import ij.IJ;
import ij.ImagePlus;

// input train image
input  = IJ.openImage( someImage.jpg" );

// create Weka Segmentation object
segmentator = new WekaSegmentation( input );

// load classifier from file
segmentator.loadClassifier( "classifier.model" );

result = segmentator.applyClassifier( input );
...

Answer 1

您在 image.sc 论坛中对此有几个答案：https ://forum.image.sc/t/measuring-area-fraction-in-a-weka-classifed-image/7979 https://forum。 image.sc/t/quantifing-weka-output/4660/6

话虽如此，您也可以直接使用生成的标签图像在其他插件中进行测量，例如来自 MorphoLibJ 的插件（安装后，在 Plugins > MorphoLibJ > Analyze 下）。