问题标签 [tukey]

我很想将代表 Tukey 的 HSD 结果的字母放在我在 ggplot 中制作的箱线图上。我知道其他帖子（Tukeys post-hoc on ggplot boxplot， Tukey's results on boxplot in R）但就我而言，我使用的是 facet_grid，但我不确定如何继续。因为我正在创建很多箱线图，所以我希望有一些自动化的东西。任何帮助我入门的提示将不胜感激。非常感谢

我得到了下面的代码，并被要求提取原始 p 值而不是 Tukey 调整后的值（因为我们将在稍后阶段使用 Homes-Bonferroni 调整多重比较），但我不确定要替换什么“ Tukey”与（我是使用 R 的新手）.....

上面显示的错误代码。我正在尝试进行 Tukey 吸烟测试（分为 0、1、2 三个类别（当前吸烟者、以前吸烟者和非吸烟者））和体重（以公斤为单位）。但是，此代码错误不断出现。

请有人可以帮我解决它。

我用我的数据做了一个ggplot。而不是我想标记我的箱线图数据（通过 anova/Tukey）之间的一些交互以显示特殊组之间是否存在显着差异。我正在使用一个名为“test”的csv-sheet，我已经导入了一个名为“final”的表格

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但是当我使用 TukeyHSD 中的标签绘制数据时，我会得到每个带有空格的标签三元组。

我怎样才能删除空格。必须有任何解决方案仅在第一个图中显示带有标签的第一条树线，在中间图中显示带有特定标签的中间树线，以及在第三个带有标签的位置显示最后一条树线。如何删除那些带有字母标签的空行？

这是我的代码：

我的第一个意见是，删除“facet_wrap(~n)”。问题解决了，但显然我错过了这种方式的细分

我想测试一个 2x3 因子设计并像这样对比变量

因此，对于掩码，我想将第一组与其他两组的平均值进行比较，然后在第二步中将第二组与第三组进行比较。

这在我的 LMM 中运行良好

掩码和长度之间存在显着的相互作用，这就是为什么我想看看这种效果并计算这样的事后测试（土耳其）：

这对一个问题也很有效：现在我的对比消失了。文本计算所有掩码的差异，而不仅仅是 1 与 2 和 3 以及 2 与 3。是否有可能在事后测试中保留我的对比？

这是数据的样子：

我在实验中有个人，我希望以图形方式表示属于使用 tukey 测试定义的同一组的人。这是完整数据集的示例：

到目前为止，我已经能够使用agricolae包执行 tukey 测试（在 anova 评估重要性之后），在数据框中提取输出。我的问题是，如果包含 tukeys 字母组的标签以正确的顺序链接到我的个人，则颜色不是。

draw_plot以这种结构结束：

然后我用ggplot2: point 为每个测量值创建了一个绘图，boxplot 和标签+颜色对应于 tukey 的组。

获得的图表正是我想要实现的。事实上，我有一个箱线图，在 x 轴上有单独的名称，在图中有相应的标签。但是，颜色与字母不对应，而是按照draw_plot先前创建的表格中给出的顺序出现。

我不知道如何为字母（即 Tukey 组）正确分配颜色。我在 ggplot boxplot 的R Tukeys post-hoc 中查看了 Tukey 在 boxplot上的这些主题的结果，以尝试自己找到解决方案。我看到我没有像他们那样使用任何函数来“重新创建”标签顺序，但我无法使他们的解决方案适应我的代码。

希望我给出了足够的解释，并提前感谢那些需要一些时间阅读本文的人。

我有一个嵌套列表 (tukey_full)，其中包含我运行的各种 TukeyHSD 测试的结果，并且希望将列表中每个对象的名称作为副标题包含在图中。我已经成功地使用

和

但是，我不知道如何在字幕中添加对象的名称，我可以通过使用 names 函数看到，就像

我尝试使用

和

打印列表让我为每个条目获得以下之一

粘贴（打印（））让我

但这些似乎不起作用。有任何想法吗？谢谢。

我是这里的新手，我的问题是我应该根据广义线性模型的结果使用参数还是非参数事后检验；如果非参数是合适的，如何进行。

因为这是关于概念的，所以我不会发布任何数据（除非有必要）。我在带有 lme4 包（glmer.nb 模型）的 Rstudio 中拟合了具有负二项式函数的广义线性混合效应模型。

我知道 GLM 是针对非参数数据的，但是如果我想根据模型结果进行后续的事后测试，我是使用参数测试还是非参数测试？

我能够使用 emmeans 包（emmeans 命令）和 multcomp 包（cld 命令）对模型结果进行 Tukey 调整参数测试，以分析治疗之间的显着差异。即emmeans（modelX，“治疗”）。

但是，如果这不合适并且应该进行非参数测试，有人可以告诉我如何使用模型结果和/或考虑随机效应吗？

先感谢您！

我正在尝试对我的治疗进行事后比较，但在运行 glht 时我不断收到此错误：“modelparm.default(model, ...) 中的错误：系数和协方差矩阵的维度不匹配”。

有没有更好的方法进行多次成对比较？我也尝试过使用 emmeans abut 我不确定这是否是正确的方法。

这是我的数据的一个子集：

嗨，我正在查看 tukeyHSD 和 HSD.test p.adj，我想在没有调整的情况下获得 p.value。我试图在里面设置一个参数，如：

或其他东西，但根本没有任何作用。包装：agricolae。