glm - 从 glm glht 函数中提取原始 p 值（而不是 Tukey 调整后的 p 值）

Question

我得到了下面的代码，并被要求提取原始 p 值而不是 Tukey 调整后的值（因为我们将在稍后阶段使用 Homes-Bonferroni 调整多重比较），但我不确定要替换什么“ Tukey”与（我是使用 R 的新手）.....

        res=glht(x, linfct=mcp(Letter="Tukey")
        out=summary(res)
        out

Answer 1

我找到了答案。对于其他感兴趣的人... multcomp 包中 glht 函数的“Tukey”选项实际上并不使用 Tukey 校正，它只是设置所有成对比较。它不做 p 值；为此，您需要summary.glht。要获取原始 p 值，请使用 test=adjusted("none")。

res=glht(x, linfct=mcp(Letter="Tukey")
   out=summary(res, test = adjusted("none"))
   out