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我进行了双向 ANOVA 测试并在 R 中运行了事后 Tukey 测试。我还从事后测试中提取了重要的行。

我的问题是：有没有办法只选择可比较的行（两个自变量中至少有一个匹配）？

以我的数据为例，我正在比较月份和站点之间的差异。仅当两个 IV 之一保持不变时，检测到的显着性才有意义。因此，即使在两个不同时间检测到两个站点之间的显着差异，它也没有任何意义（例如，第 6 行、第 9 行、第 9 行、第 11 行等）。

任何帮助都会很棒。谢谢你。

总的来说，我对 R 和编码非常陌生，所以对于任何看起来很愚蠢的事情，我提前道歉。

我执行了方差分析，并想对我的数据进行 TukeyHSD。起初，它工作得很好。然后我创建了两个数据集。在每一个中，我都对我的数据进行了排序，以仅包含两种剂量类型中的一种。然后我继续执行方差分析（有效），但是 Tukey 产生了这个错误

-[.data.frame`(mf, mf.cols[[i]]) ：选择了未定义的列。

这意味着什么？我在新创建的数据集中搜索列的名称，它们都存在。

太感谢了！！

这是我创建的数据集和收到的错误。

[.data.frame(mf, mf.cols[[i]])中的错误：选择了未定义的列

我对每个食谱的简单效果（不是成对比较）感兴趣，所以基于这篇文章

现在我想使用 Tukey 的测试来纠正我的 p 值；这是可能的还是 Tukey 的测试仅适用于治疗之间的差异？

我无法为我的结果生成紧凑型字母显示。我已经运行了一个方差分析，然后是 Tukey 的 HSD 来为每对生成 p 值，但我不知道如何（或者是否可能？）为这些 p 值分配字母以显示哪些对彼此重要。

csa.anova<-aov(rate~temp*light,data=csa.per.chl) summary(csa.anova) TukeyHSD(csa.anova)

这运行了我需要的测试，但我不知道如何为每个 p 值分配字母以显示哪些对是重要的。

我有一个数据框，我对其进行了双向方差分析。

dput(m3)

结构（列表（Delta = c（-40，-40，-40，-40，-31.7，-29.3，-27.8，-26.7，-26.2，-25.4，-24.7，-23.1，-23，-22.9， -22.4，-22.2，-21.4，-21，-20.8，-15.1，-14.9，-14.1，-6.2，-6.2，-6，-5.3，-4.9），位置=结构（c（1L，1L， 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 3L, 2L, 3L, 3L, 3L) , .Label = c("int", "pen + int", "ter + pen"), class = "factor"), Between = c(0L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 0L, 2L, 1L, 0L, 1L, 0L, 2L, 0L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L ), 相对 = 结构 (c(5L, 6L, 6L , 7L, 8L, 3L, 3L, 4L, 5L, 4L, 3L, 5L, 3L, 5L, 7L, 5L, 4L, 6L, 3L, 3L, 6L, 2L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L), .Label = c("1&2", "2&3", "2&4", "2&5", "3&4",“3&5”、“3&6”、“4&6”）、class =“因子”））、class =“data.frame”、row.names = c（NA，-27L））

我想使用HSD.test分析数据，就像使用相同功能的另一个数据帧一样。我遵循包手册中的代码格式，如下所示。

然后我收到以下错误

(x, value = value)中的错误.rowNamesDF<-：不允许重复的“row.names”另外：警告消息：设置“row.names”时的非唯一值：“int.0”、“pen + int.1” , '笔 + int.2', 'te + int.0', 'te + int.1'

经过进一步分析，我发现我的重复行名错误与我的 X.between 功能有关。当我使用以下代码时，我得到相同的重复行名错误：

如何为 HSD.test 选择行名？那我怎样才能改变我的行名呢？或者只是避免这种重复错误？

感谢您的所有帮助。

因此，我使用 agricolae 的HSD.test和TukeyHSD对双向 ANOVA 进行了 Tukey 后测。

HSD.test给了我特征组合、它们的平均 y 值、标准差、最小值、最大值和四分位数。然后，它根据相似性和差异将特征组合分为 A、B、BC 和 C 组。当我绘制这些图时，它会绘制每组的平均值和标准差。

TukeyHSD在每个特征内进行比较，然后比较特征组合。对于每次比较，它给出了下限和上限范围的差异以及调整后的 p 值。如果我绘制这个数据，它会给我每次比较的 95% 置信区间，并且有很多空白。

我如何知道要使用哪个包的 Tukey 测试？还有其他人吗？如果我使用TukeyHSD可以删除所有空白比较吗？

我有一个包含多个变量的大型数据集。我需要使用 Tukey HSD 进行双向方差分析，然后进行事后成对多重比较。

我的前 25 个条目的数据头是这样的：

我做方差分析

然后事后

到目前为止一切都很好，但是我的 posthoc 的输出包括所有成对比较，这给了我们超过 2200 行的大量看跌期权。例如我的输出是这样的：

最后说：

但是我只对每个变量内的比较感兴趣，而不是它们之间的比较。作为上述输出的示例，我只需要 Cell1:W1-Cell2:W1. 都在同一个变量内w1。或例如Cell6:W3-Cell1:W3。我不感兴趣Cell6:W3-Cell6:W1

我该如何指定？ 谢谢

当我查看我的数据集的方差分析时，我得到的 P 值为 0.018，这在 alpha=0.05 时很重要。但是，当我对该 ANOVA 进行 Tukey 的 HSD 测试时，所有内容都归类为 A 组。谁能解释这里发生了什么？

这是我的数据：

我正在使用 agricolae 包进行分析这是给我方差分析的代码：

这是我的 Tukey 的 HSD 测试的代码：

任何帮助将非常感激。谢谢！！

我使用了搜索功能，很惊讶没有找到任何东西。我熟悉在 R 中为 Tukey 的 HSD 编写代码以用于其他实验设计，但如果是用于裂区设计，是否需要更改任何内容？当我键入用于更简单的实验设计的代码时，我得到的响应不是我想要的。

作为参考，这是我的数据头。如果需要，我可以分享更多：

我有兴趣查看不同费率的不同字母类别。我想把它们放在一个图上，其中每个品种（总共六个）都有一个条形图，y 轴上有 totalCWTacCulls，每个 x 轴上有 5 个 Rates

这是我将用于此数据的方差分析：

以下是我如何写出我的 Tukey 的 HSD 测试：

但是，这给了我意想不到的信息：

任何关于我做错了什么以及我可以做些什么不同的帮助将不胜感激。提前致谢！

我有形状为 1000 个观测值的数据框，6 列

前四列是 int，后两列是字符串数据类型。

我需要帮助找到可以帮助我使用 tukey 方法检测异常值并用 nan 值替换异常值而不删除异常值的函数代码。

我尝试了许多代码来检测异常值，但由于我的数据框中的字符串数据类型，我面临错误消息。