因此，我使用 agricolae 的HSD.test和TukeyHSD对双向 ANOVA 进行了 Tukey 后测。
HSD.test给了我特征组合、它们的平均 y 值、标准差、最小值、最大值和四分位数。然后，它根据相似性和差异将特征组合分为 A、B、BC 和 C 组。当我绘制这些图时，它会绘制每组的平均值和标准差。
a3=aov(Delta.~Loc*between, data=m3)
tx <- with(m3, interaction(Loc, between))
amod <- aov(Delta.~tx, data=m3)
library(agricolae)
HSD.test(amod, "tx", group=TRUE)
TukeyHSD在每个特征内进行比较，然后比较特征组合。对于每次比较，它给出了下限和上限范围的差异以及调整后的 p 值。如果我绘制这个数据，它会给我每次比较的 95% 置信区间，并且有很多空白。
TukeyHSD(a3)
我如何知道要使用哪个包的 Tukey 测试？还有其他人吗？如果我使用TukeyHSD可以删除所有空白比较吗？