我正在尝试在 PETSc 中创建和打印MATDENSE矩阵。我的 MWE 看起来像这样：

问题是，当在多个进程上运行时，程序突然挂在MatView()函数上，而不是写入out.txt文件。我在这里做错了什么？

我做了一个不幸的决定，卸载了我为 petsc/gcc/macports/brew/ 等工作的东西，因为 Valgrind 不适合我。我让 Valgrind 为我工作，重新安装了 Petsc 和 slepc 等，但是在我成功创建可执行文件 ./hello 之后，我遇到了这个问题：

我的程序是一个简单的程序：

当我通过 Valgrind 执行我的程序时，我遇到了分段错误，但是当我在没有 Valgrind 的情况下运行它时，我没有遇到任何问题或分段错误。瓦尔格林问题？添加时出现段错误 11

我该如何解决这个问题？

我有一个在大量处理器上运行的应用程序。在处理器 0 上，我有一个函数可以在套接字打开时将数据写入套接字。此函数在处理器 0 上的单独线程中循环运行，即处理器 0 负责自己的工作负载，并有一个额外的线程在套接字上运行通信。

当客户端套接字关闭时，程序应该忽略错误，据我所知，这是标准行为。

但是，我正在使用一个外部库 (PETSc)，它以某种方式检测管道损坏错误并关闭整个并行 (MPI) 环境：

如果可能的话，我想完全不改变这个库的配置。对任何可能的强大解决方法持开放态度。

我学习如何在 C 中使用 Petsc，我想在 Petsc 中用 KSP 求解线性系统（在 Ax=b 中找到 x，A 是矩阵（nxn），b 是向量（n））。该库提供了一些在 C 中计算并行的工具。但是，我遇到了麻烦并找到了答案，希望得到您的解释。

如果我使用大小为 5000x5000 的 A（A 是对角占优矩阵），当我在没有并行的情况下解决问题时，需要更长的时间来解决。我不明白这个问题。你能给我解释一下，以及如何做一些事情来跑得更快吗？

我在 test.c 中的代码如上所示：

我用命令运行程序：

一）问题

我无法petsc4py在我的 Anaconda 环境中使用pip.

安装conda不起作用，因为它不会在安装过程中检查我预定义的 PETSC_DIR 和 PETSC_ARCH 环境变量。numpy并cython安装。

错误输出pip install显示在下面的第IV节中。

二）版本

我有 Ananconda 2020.02，安装了 Python 3.7。我的操作系统是 Ubuntu 18.04。

III) 重现问题

1) 用户安装OpenMPI 4.0.3

配置使用

然后make和make install。

将.openmpi/bin文件添加到 PATH 并添加.openmpi/lib到 LD_LIBRARY_PATH：

2) 安装PETSc 3.13

配置指示mpicc和下载 blas/ mpifortlapack /home/$USER/.openmpi/bin、scalapack、MUMPS、METIS、PARMETIS 和 PTSCOTCH，使用 -O2 编译器优化（注意：我将 MKL 用于 blas/lapack 和 scalapack）。还要在 中指明PETSC_DIR文件夹位置和PETSC_ARCH名称./configure。我选择了没有 C++ 编译器的选项。

然后make all和make check。我也做了一个make test，花了很长时间。没有失败，只有成功，跳过和去做。

export PETSC_DIR和PETSC_ARCH（对 很重要pets4py）。

3）mpi4py使用安装pip

根据 Iliev在 Stack Overflow 的此链接中提供的对我的问题的回答，我使用 安装了这个pip，因为在指示自定义 mpicc 路径时mpi4py无法安装使用。conda

4）尝试petsc4py使用安装pip

我使用 --no-cache-dir 编写：

构建失败。终端中显示的信息将在下一节中显示。

四）错误

错误如下所示。

（额外的元问题：有没有办法在 Stack Overflow 的代码围栏中设置自动换行符？）

电脑配置：我的电脑是maosx系统，在虚拟机安装ubuntu，原系统安装天梯（VPN），Linux没有安装成功天梯（VPN）。

环境配置：在虚拟机中安装petsc，下载petsc软件包解压，安装GCC，gfortran，之前分别下载MPI和BLAS/LAPACK，但是安装MPI的时候出现错误。.

命令行执行，结果显示无法从网站下载MPI（我试过下载url，安装梯子（VPN）后可以下载。下面是输入命令和结果：

按照提示：提前下载mpich包。我了解存放mpich包的位置，但结果显示我的下载位置无效。是不是我选的位置不对？下面是我的第二条输入命令和结果，请大家帮我看看哪里有问题。

相反，我直接进入配置命令行。/configure 阶段完成。现在构建 PETSc 库

我尝试将 GCC 升级到最新版本，但没有任何改变

我用 python、make 和 diffutils 安装了 cygwin。

当我使用命令时：

我收到错误“检测到 Windows Python。请使用 cygwin-python 重新运行 ./configure ”。

如果我在 cygwin 命令行中使用该命令

我收到以下运行时错误：

欢迎任何帮助。

我正在尝试通过 OpenMDAO 的 pyoptsparse 驱动程序使用 NSGA2 优化器来修改 GA 人口大小。

我尝试使用字典进行访问PopSize，如下所示：pyNSGA2.pyopt_settings

但是，这会导致分段错误，消息如下：

是否有不同的方法来访问应该使用而不是opt_settings字典的 NSGA2 优化器的选项？我对 Python 比较陌生，所以我也怀疑我的语法也可能不正确。

更新： 对于更多的上下文，我尝试在没有 PETSC 的情况下运行。优化在没有尝试更改的情况下成功PopSize，但是Segmentation fault在尝试更改时它崩溃了PopSize。跟踪错误，我相信分段错误的根源在pyoptsparse/pyNSGA2/source/crossover.c，根据下面的消息

我还尝试在新机器上全新安装 PETSC，但这让我又回到了同样的错误。

我正在尝试从 DTU 编译这个项目。该项目需要安装PETSc。

我已将 PETSc 安装到/Users/hornymoose/petsc-3.13.3/

我已经从 GitHub 中提取了 zip 到/Users/hornymoose/dtu

DTU 项目makefile有以下几行：

在这些行中，{PETSC_DIR}被替换为用户的 PETSc 安装目录。因此，我将这些行更改为：

为了编译代码，我make topopt在终端中编写。这样做会产生：

我已经回去手动检查了Users/hornymoose/petsc-3.13.3/lib/petsc/conf/variables, ...rules, 并且...test肯定存在并且没有错误。

为什么我会收到此错误？我是否在我的 中错误地指示了目录makefile？中的语法makefile不正确吗？

我确信有一个简单的解决方案，我对在 MacOS 中使用终端非常陌生。先感谢您！

我正在尝试将PETSc 中的 Vec数组传递给一个函数，在内部对其进行修改并检索结果。伪代码如下：

我确实收到了来自编译器的一条消息，指出variable "y" is used before its value is set，但我看不到如何通过引用传递这些人。VecDuplicateVecs必须在main中初始化吗？