我有一个 numpy 数组，我想将其转换为 nifti 文件。通过文档，PyNIfTI 似乎曾经这样做过：

但是，不再支持 PyNIfTI。PyNIfTI 的继承者 NiBabel 似乎不支持这个功能。我肯定错过了什么。有谁知道如何做到这一点？

我可以使用带有以下代码的 vtkNIFTIImageReader 显示切片图像：https ://github.com/dgobbi/vtk-dicom/blob/master/Examples/TestNIFTIDisplay.cxx

但是，当我尝试将 NIFTI 文件渲染为 3D 对象时，它总是出现空。如何在 VTK 中显示 NIFTI 对象

我有一个 Nifti 文件，大小为 62*62*38。如何将 Nifti 文件传输到 .mat Matlab 文件？

我正在尝试在 matlab 上使用 MyRobustCrust 从 MNI 大脑模板创建线框 3d 模型。我的目标是能够确定皮质表面的 MNI 坐标。

为此，我遵循此站点上列出的说明：http ://soundsfromthenorth.com/?p=3

不幸的是，管理员似乎不再活跃。

按照网站的说明，我已成功从 FSL 中提取数据集（“MNI152_T1_2mm_brain_mask.nii”）。但是，当我去运行 MyRobustCrust 时，使用以下输入（按照站点的指示），我得到一个空白图表。

代码输入

代码输出：

不幸的是，我对神经影像学和 Matlab 非常陌生。有人对我在这里做错了什么有任何建议吗？错误信号是否表示 MyRobustCrust 的代码或数据中存在不平衡或意外的括号？

我有一个明确的问题。nifti 文件中的“发起者”标签是什么？以及如何必须计算这个标签值？

我有两个 fMRI NIFTI (.nii) 文件（一个感兴趣区域 (ROI) 掩码和一个 SPM T 对比度），我可以使用 load_nii 将这两个文件读入 Matlab，给我两个结构。这些结构中的实际图像数据大小不同，并围绕不同的来源：

我需要对齐这两个矩阵，使 ROI 文件对应于对比文件的正确部分。我可以使用几个特定于 NIFTI 的函数（pad_nii 用于添加零，clip_nii 用于从任何/多个边缘删除值），但我不确定如何对齐两个坐标系。

我正在尝试实现基于VTK的 MRT-DTI 实时光纤跟踪可视化工具。因此，我们需要读取存储在 NIFTI 图像(.nii) 中的每个单元格的 DTI张量/矩阵，我真的不知道该怎么做。

从 NIFTI 文件中检索单个标量值不是问题，但我不知道如何获取张量（3x3/4x4 矩阵）。我们非常感谢任何帮助！

由于 NIFTIImageReader 应该将张量 NIFTI 图像作为多分量 vtkImage 读取，因此我们尝试了以下操作：

但它不起作用。也许 GetPoint 方法是错误的选择？请帮忙 ：）

我开始使用 C++ 和 VTK 库，我正在尝试构建本教程：http ://www.vtk.org/Wiki/VTK/Examples/Cxx/Medical/GenerateModelsFromLabels 输入参数（对我来说是一个 NIFTI 文件) 必须是 META 格式，但我不明白如何使用 VTK 库将我的 NIFTI 文件转换为这种 META 格式。有任何想法吗？谢谢！:)

我的 3D 数组的大小是 (20, 33, 20)。我想做的是运行一个循环，例如，如果第一列（20）中有一个 0，那么循环将返回找到一个非零的数字，然后让循环前进到第 2 列 (33) 并执行相同的循环，第 3 行也执行相同的循环。

这就是我得到数组形状的方式。我想要做的是为每一列分配一个变量，这样我就可以编写循环

我是扩散张量成像数据统计分析的新手。以下是我的查询

我有.nii3 个主题（subj_02、subj_03、subj_10）的 NIFTI ( ) 文件并执行 3 个任务（task_1、task_2、task_3）。我选择了 5 个不同的皮质目标区域（target_02、target_04、target_06、target_08、target_10）来研究脑干和皮质之间的神经通路。

我已将结果存储为以下格式

task/subj_*/target_*/fdt_paths.nii.gz

我想对获取的 NIFTI ( .nii) 文件进行一些数据分析，为此我想从生成的结果 ( NIFTI 文件 ) 中读取数据并将结果导出到 excel 表中Task/Subject/Target。

问题：

我目前MATLAB-SPM8用于读取 NIFTI 文件，您能否告诉我一些提示以有效读取 NIFTI 文件并将数据导出到 excel 表格？