我有两个单独的数据框，其中一个我已经从第一个数据框创建了一个热图，但是我想添加一个侧边栏，指示基因实际上与其相关联的家族类型。

数据框 1

数据框2

热图创建：

我正在寻找这样的东西，其中每种颜色代表一种与特定基因类相关的基因簇：

使用 创建热图时heatmaply::heatmaply()，会对原始数据执行一些转换。这在以下示例中很明显，其中提供了一些 iris 数据集，但将鼠标悬停在热图上会显示一些负值（不在提供给 的原始数据中heatmaply()），并且侧面的颜色栏也显示负值.

https://i.stack.imgur.com/Mt0vGm.png

不同的比例iris[1:20, 1:4]：

https://i.stack.imgur.com/nuMcn.png

问题

如何仅根据提供的原始值（无转换）heatmaply::heatmaply()生成热图？

注意：开放使用其他包/功能/建议

我正在使用 Rheatmaply包来生成交互式热图。我喜欢该软件，但我想从中获得与使用该pheatmap软件包相同的颜色输出。因此，我希望这两个命令产生相同的输出：

有没有办法做到这一点？提前致谢。阿图罗

我正在使用 R heatmaply 包来生成交互式热图。我喜欢该软件，但我想从中获得与使用 pheatmap 包相同的聚类（行和列的排序）。因此，我希望这两个命令产生相同的输出：

有没有办法做到这一点？提前致谢。阿图罗

PS我最近问了另一个关于颜色输出的类似问题，即不是聚类输出，在这里得到了很好的回答：R heatmaply and pheatmap output

有没有办法使用包中使用的树状图聚类方法heatmaply并将其应用于包生成的热图pheatmap？基本上与这里所问的相反：Clustering in pheatmap and heatmaply R packages

heatmaply当我使用over时，我通常会看到更好的数据聚类pheatmap。但是，我并不总是想使用交互式绘图。该heatmaply::ggheatmap功能对我来说不能正常工作，因为我有col_side_colors并且注释妨碍了树状图。它只是看起来很乱。所以我pheatmap改用。

也许有人可以帮助我的问题。谢谢！

我试图用我自己的数据创建一个热图，并且只得到空白。我发现了这个关于如何根据 mtcars 数据进行热图工作的非常基本的说明。重新启动 R（关闭窗口并重新打开，而不是内置重新启动）后，我尝试过但仍然只收到空白。关于如何解决这个问题的任何想法？提前致谢！

我对编程和网站相当陌生，所以如果我搞砸了这个解释，请告诉我。

我有一个相当长的一系列 x，y 坐标代表 2d 空间中的一个字符。假设空间是 200 x 400。我想通过一个漂亮的叶绿素来表示角色在每个 x、y 坐标中的时间量。

我想为此使用 heatmaply，因为我认为输出很漂亮，我希望我的观众能够放大数据。它并不是真的要进行密度估计（我认为？）所以我正在努力解决它。

我想这样做的方法是填充一个 200x400 数据帧，其中计算每个 x, y 坐标在数据中每个 x, y 坐标在帧中出现的次数。本质上，从数据框构建二维地图并对其施加计数

所以，我想我的问题是：

1）。如何获取集合中每个唯一 x、y 坐标的计数

2）。如何轻松地将这些计数传递给我的 200x400 数据帧中的匹配 x, y 单元格？

这似乎应该很容易，但我似乎无法弄清楚！我是 r 的新手，看不到我需要做什么的形状。

我正在使用 heatmaply 包创建带有来自 dendextend 包的树状图的热图。有没有办法识别树状图上的簇号？这是 mtcars 数据集的示例热图。我想要树状图（或图例）上的簇编号，就像我手动放入红色的那样。这是复制的代码：

我看到了这个问题（2018）：

R闪亮错误：html工具错误：：validateCssUnit（高度）；CSS 单位必须是单元素数字或字符向量

应该是有关系的……

• 热图是版本：1.1.1
• flexdashboard 是版本：0.5.2

如何将 Heatmaply 热图的列的平均值添加为它附近的注释？

目前，作为一种不理想的方法，我运行它并得到下图：

然而，这并不理想。我希望将平均值作为另一个独立列添加到热图中，我也可以在其中显示值。

另外，我需要顶部的列标签，我在这里问过：

我打算在闪亮的应用程序中使用这个热图。

谢谢