问题标签 [heatmaply]

我创建了一个带有 heatmaply 的树状图，其中包含来自 dendextend 包的树状图对象。我想知道是否有办法更改列的顺序：vs、am、carb、wt、drat、gear 等。例如，我想按字母顺序对它们进行排序。这可能吗？

我想为我的交互式热图返回特定数量的集群，heatmaply就像我可以使用pheatmap的那样和kmeans_k = 参数。有没有办法做到这一点heatmaply？

如果我有一个大矩阵并且没有定义要使用热图返回的集群数量，则计算热图需要很长时间，否则我会收到错误：'向量内存已用尽（达到限制？）'。

我想使用 heatmaply 来生成一些绘图，但是当我运行代码时绘图不显示（见图）- 命令只是无限期地挂起，而终止命令的唯一方法是在我的 mac 上强制退出 Rstudio。我尝试重新安装包，以及重新安装 R、Rstudio 和所有其他包都无济于事。我没有收到错误消息。可能是什么问题以及解决此问题的任何提示？谢谢！！

图片截图

我有一个数据集，我正在绘制一个热图来比较 7 个组。我还在数据 2 列中包含我想在交互式热图中作为悬停文本包含的信息。

我的数据是要比较的 7 列组，以及要添加到绘图中的 2 列悬停文本信息。这些行是我希望比较组之间的显着性的日志 p 值。

目前我正在尝试使用它heatmaply来绘制它，但我无法设置自定义文本 - 有没有办法将数据列设置为custom_textof heatmaply()？我找不到任何专门这样做的例子。

输入示例数据：

我正在尝试使用的代码：

我有一个数据集，我正在绘制一个热图来比较 7 个组。我也有每组 2 列描述该组的数据。我正在尝试创建一个交互式绘图，该绘图显示每个组的每个信息列的信息。

这是一个数据示例，其中 7 个组每个有 2 列相应的信息：

我正在尝试在热图中绘制 groups1-7（也是 1:7 列），然后通过修改另一个问题（如何在 R 中使用自定义文本创建交互式热图图？）中的答案来使用其余列悬停文本热图：

但是尝试这样做会产生错误：

有没有办法让我创建指定热图每列custom_text的heatmaply()悬停文本信息，而不是给每个热图正方形的全局信息？

我想知道当有数百行时是否可以在热图中搜索特定行？当行数很多时，它们的标签通常是折叠的，除非放大，否则无法阅读它们。我想知道是否可以搜索特定的行或键，并找出它在哪里（之后聚类）。

在此示例中，您可以看到标签是如何折叠的：

理想情况下，我可以将我想要的行作为参数添加为：heatmaply(iris, zoom_in_to_row = 51)但我认为这是不可能的，所以也许有人知道解决方法。

谢谢

我正在尝试使用 heatmaply 包来绘制热图并且效果很好。

另一方面，当我尝试在 Shiny 中执行相同的绘图时，它不会出现在界面中（当我单击“运行应用程序”时）。然而，当我突然关闭窗口时，情节出现在 R 查看器中。heatmaply 包是否可能不适用于 Shiny？

这是我的代码，当我在 R 中绘制它时。

这是我在 Shiny 中的代码。

我已经尝试过另一个包来拥有一个交互式热图，但它是唯一一个拥有我想要的东西的包，因此我需要在这里询问是否有人知道如何在 Shiny 中使用它。

提前致谢，

问候

我想知道是否有任何选项可以以 svg 或 pdf 格式导出热图。

我有这个数据框：

我想创建一个热图，x 轴为患者 ID，y 轴为 clas1、clas2 和 clas3。热图中表示的值将是每个“类”的原始值。在这里我贴一张我想要的图

很抱歉，因为我没有更多可用的颜色来表示这一点，但这只是一个示例，可以使用任何色标。重要的是，我想区分零和 NA，因此理想情况下，NA 有自己的颜色或显示为白色（空）。

我希望这是可以理解的。

但任何问题都可以问

非常感谢！

我已经为每组数据单独运行此代码，我有 44 个区域，需要将它们相互关联，但对于 4 个不同的治疗组，每个治疗组有 8-10 个单独的值。

但是，每次运行此程序时，每个热图沿轴具有不同的区域顺序，但我需要它们的顺序相同，以便我可以比较集群。有没有一种方法可以从一个数据集中完成所有 4 个相关热图，以便将所有 4 个相互显示？然后我不必分别做所有 4 组。