问题标签 [heatmaply]

我希望重新排序行但不显示带有热图的树状图，此代码运行但不这样做：

我认为 Rowv=TRUE 应该有效

我正在尝试在 spearman 相关性的基础上创建一个热图，并使用与 spearman 相关值相对应的树状图。我的输入文件组成如下：

我能够制作一个简单的相关图，但我想创建一个独特的热图，其中包含基于 spearman 相关性的蛋白质和受试者树状图。有谁知道该怎么做？提前致谢

我想在 value=NA 的单元格中填充 gray50 并在 value!=NA 的单元格中显示 dark2 中的值，如Palpacuer 等人的热图中所示。有人可以帮我吗？

这是我的数据和代码：

我在 Rstudio 中绘制了一些基因表达的热图，但是行名称（应该是样本或基因名称）被数字替换。我检查了一些帖子，但没有机会。抱歉，如果这是一个简单的问题或重复的问题，我是 R 新手。

这是我的 R 脚本：

笔记：

笔记2：

我想使用 R 中的 heatmaply 包为我的数据集（3109 行和 12 列）创建一个交互式热图图，但出现以下错误：如果我删除行名，我不会收到错误，但我至少需要查看名称在图中的每个位置！那么你能帮帮我吗？谢谢你。

简单的例子

我们得到了这个图 我们看到观察结果被划分为 3 个集群

我们还看到技术参数（变量）分为两类

我如何在数据框中输出这些观察的名称（或数量），一方面，它们在第一个集群（第一个集群的汽车）中，并且它们位于第一个技术变量集群的区域。换句话说，我在下面的屏幕上确定了这个区域

因此，必须对不同技术变量集群中的所有汽车集群的观察进行输出。很容易计算，它将是 6 个区域。

我正在将 heatmaply 包集成到一个闪亮的应用程序中，该应用程序允许用户选择按行、列、两者或无聚类。However when the either row or column is selected, the dendogram shows up with numbers as shown in the figure inside the red box. 有人知道如何阻止这些数字出现吗？

我正在使用 heatmaply 来获取来自多个评估者对使用相同 Leikert 量表（ECOG 绩效状态）评估的一系列问题的响应的集群热图。热图效果很好（尽管像这样对有序数据使用层次聚类可能不是最好的）。我想在热图中显示一个附加的列，其中包含一个附加变量的颜色编码信息，例如年龄。附上我使用包生成的示例热图。蓝色栏有关于患者性别的信息，但同样没有颜色编码。我想知道是否可以这样做。也欢迎有关用于序数数据的正确聚类方法的任何输入。
原始热图链接

使用的代码在这里：

我想使用 R 中的下拉菜单更改 heatmaply 中热图的颜色。我写了下面的代码，但不能正常工作。提前谢谢你的帮助。

编辑：我已经简化了应用程序并使其所有代码都可重现。编辑 2：我刚刚发现，当我使用 navBarPage 时，我必须单击 Additional Parameters -> Colour。然后按预期着色。

我正在开发一个闪亮的应用程序，它过滤我的基因，然后绘制剩余基因的热图。最近，我发现了 shinyHeatmaply 包。我已经下载了他们的全局、UI 和服务器，当我在自己的计算机上尝试时，它们按预期工作。不幸的是，当我尝试使用 navbarPage 组合我的过滤器应用程序和它们的热图时，最后一个没有正确渲染。

我创建了一个极简主义示例，将 shinyheatmap 添加到https://shiny.rstudio.com/gallery/shiny-theme-selector.html应用程序中 navbarPage 的第二个 tabPanel，但无论如何我得到了相同的灰色渲染。

在更简单的应用程序中出现同样的错误

UI：Navbar 1 属于 shinytheme 应用程序，而 Navbar 2 的内容属于 shinyheatmaply

服务器：关于服务器，前两个输出对应shinytheme，其他的属于shinyheatmaply

提前感谢解决这个问题的英雄。最好的奖励，丹尼尔。