问题标签 [survminer]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - 使用 ggsurvplot() + geom_dl() 时的“二元运算符的非数字参数”

我想将标签附加geom_dl到由ggsurvplot. 如果我使用ggsurvplot.

但是,如果我使用完整的surv_km

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r - 在 R Studio 中,当我添加截距线时,我的风险表会从我的生存图中删除。有没有办法克服这个问题?

在 R Studio 中,当我添加截距线时,我的风险表会从我的生存图中删除。有没有办法克服这个问题?我的初始代码,显示风险表是:

但是当我更改这段代码的最后一行添加截取线时,风险表突然消失了。为了添加 incept 行,我将最后一行代码从 更改p+xlab("Time (days)")

有谁知道在不丢失风险表的情况下添加截距线的方法?

谢谢!

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r - 在 R 中使用 coxph 时出现“未找到对象‘状态’”错误

每当我在代码中使用“coxph”函数时,它都会给我错误“Surv(时间,状态)错误:找不到对象'状态'”。但我在其他地方没有遇到同样的错误。我能做些什么?

这是我当前的代码:

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r - 是否可以在 Survminer 中自定义 p 值文本

我正在生成要在演示文稿中使用的生存曲线,理想情况下我想自定义 p 值文本的颜色。有可能这样做吗?我用示例数据做了一个例子,向你展示我到目前为止所做的事情。剩下的就是 #5A6469 的 p 值文本的颜色,但我已经尝试了几乎所有选项,并且它始终保持黑色!谢谢您的帮助。

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r - 错误变量长度不同 ggsurvplot_facet

我想跑ggsurvplot_facet() 但跑不过去Error in model.frame.default(formula = surv_object2 ~ id, data = list( :variable lengths differ (found for 'id')。任何帮助将不胜感激。

我相信错误在survfit()/surv_fit()组件中,而不是在ggsurvplot_facet()组件中。

数据可以在这里找到。

我的代码如下:

我还使用该surv_fit()功能尝试了上述所有组合。

我在这里这里发现了类似的问题,但我无法解决我的问题。

再次感谢。

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r - 为什么 ggsurvplot_facet 忽略 pval.size?

为什么被pval.size忽略ggsurvplot_facet()

我正在尝试使用 更改生存图中 p 值文本的大小ggsurvplot_facet(),但调用pval.size似乎被忽略了。如果有人可以帮助我更改生存图中的 p 值大小,将不胜感激。

可重现的例子:

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r - 修改 ggsurvplot (font.size) 和置信区间类型

我正在尝试修改并更好地理解函数的ggsurvplot()工作方式(包:)survminer

首先是一些代码:

使用的数据框称为lung. 数据包含在包中survival

基本上我有两个问题:

  1. 该图应打印置信区间,但它们是什么类型的?它们是否与我在survfit()用于创建对象的函数中指定的相同exp_fit,如果不是,则需要更改哪些内容以便使用相同类型的置信区间?

  2. 图例的字体很小。我怎样才能让它更大?我尝试使用theme(),但不幸的是它不起作用。

我会很感激你的回答。提前致谢。

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r - 在 R 图的图例中插入数学符号

我正在使用 survminer 生成具有 2 条生存曲线的生存曲线,一条用于在手术期间接受 4 个包装红细胞 (PRBC) 单位的患者,另一种用于接受超过 4 个 PRBC 单位的患者。不幸的是,我无法使用“表达式”或“bquote”函数将正确的“<=”符号插入到图例中。

我已经阅读了有关此主题的先前帖子,但是我能够使用 expression() 和 bquote() 找到的指导似乎并没有正常工作。

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r - 为生存图指定自定义时间点

我正在使用包中的ggsurvplot函数创建生存/累积事件图survminer。我想为我的情节指定自定义时间点,但我不知道该怎么做。和参数有点帮助xlimbreak.x.by但它们创建了均匀间隔的时间点和比我想要的更多的时间点。具体来说,我只想要 0、30 和 365 天的时间点。是否可以使用该survminer软件包执行此操作?如果几乎可以通过ggsurvplot使用不同的包来复制输出,那也可以 - 我真的希望获得有关风险数量和事件累积数量的信息。非常感谢!

样本数据:

合身:

“错误”尝试使用ggsurvplot

输出: 在此处输入图像描述

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r - 使用 ggsurvplot 中的 facet.by 时无法绘制 p 值。错误消息:“可变长度不同”

我有一个问题,我不知道如何解决。它似乎与我的数据集有关(或者是吗?)。事实上,当我通过“冒号”数据集使用issue#205facet.by中的示例时,我实际上能够绘制不同的 p 值。但是,它不适用于我的 Github 个人资料(https://github.com/CroixJeremy2/Data-frame-for-stack-overflow.git)上提供的数据集。

预期行为

我希望能够使用我的数据集绘制不同的 p 值,如issue#205中所示。

实际行为

我只能通过 绘制曲线facet.by。但我无法绘制应该为对数秩检验自动计算的 p 值。相反,在我的 R 控制台中返回一条错误消息:

重现问题的步骤

评论

请注意,该survdiff()函数在我的数据集上完美运行,以便从对数秩测试中计算 p 值。因此,我不知道我是否做错了ggsurvplot()(很可能是假设)或者ggsurvplot()函数本身是否有问题(不太可能)。

此外,可变长度似乎相等......而且我的数据框中没有任何“NA”值......所以我真的不明白为什么我有这个错误消息......

提前感谢您的回复和帮助,