问题标签 [survminer]
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r - survminer 中的风险表不绘图?RCPP 错误
我正在尝试使用该survminer
软件包绘制生存曲线和相关风险表。我无法绘制风险表,所有其他元素都可以正常工作。RStudio 要么引发以下错误:
bl_make_text_box(token,drawing_context$gp,drawing_context$yoff_pt)中的错误:包'Rcpp'未提供函数'Rcpp_precious_remove'
或卡住并变得没有反应。
我已经安装并加载了Rcpp
包但没有成功,我还重新启动了 R 并清除了工作区。这发生在多个数据集上。一个例子是来自survminer
备忘单的下面的代码,它给了我同样的问题。非常感谢任何建议!我怀疑这与我的环境有关,但我不知道是什么。
按要求编辑
survival - 为什么幸存者会返回两条曲线?
我正在尝试拟合生存曲线,并且发生了其他数据集没有发生的不寻常的事情。当我尝试绘制曲线时,我得到两条曲线,每条曲线都有一个 CI。通常我有以下数据摘要:
对于不同的数据集,我得到两条曲线,摘要看起来完全不同。如何选择仅绘制其中一条曲线?我使用自动绘图来绘制它们。这是摘要:
为什么我不能将 ggsurvplot 用于第二个数据集 (d2)?这是错误消息:
r - 如何使用 panel.labs 和 survminer::ggsurvplot_facet 删除 facet 参数?
我使用以下代码在生存分析中刻面图:
我想修改构面标签文本。使用 panel.labs,名称确实会根据提供的列表进行修改。但是标签仍然显示分面参数,因此对于每个标签,我首先在情节中的名称之前有“地点:”或“年份:”。我怎样才能放下这个?这就像在这些图表上的图中的各个方面删除“sex:” 。
survival-analysis - 使用 ggadjustedcurves() 创建调整后生存曲线的对数对数图
我可以使用 ggadjustedcurves() 轻松创建调整后的生存曲线,但我想使用
fun = "cloglog" 创建对数图,但它似乎不起作用。
有没有办法使用 ggadjustedcurves() 创建对数图?
r - 使用 ggcompetingrisks 将审查形状添加到累积发生率图中
是否可以在情节中绘制审查survminer
ggcompetingrisks()
?
我正在从cmprsk
包装中进行竞争风险分析。该图显示了 4 种不同事件(局部/区域/远处进展或死亡)的累积发生率。如果这些事件均未发生,则使用审查。我希望在情节中显示审查,希望作为一个勾号“|” 或所有 4 行上的“+”。
我知道使用时survminer
ggsurvplot()
,这很容易。累积发病率图也可以吗?
提前致谢
r - 如何在 90% 置信水平的中位数上下置信限估计中位生存期?
我的目标是使用 survfit 对象在 90% 置信水平的中位数置信上限和下限的情况下估计中位存活率。
我找到了类似的函数,即 surv_median() 来执行此操作,但置信度为 95 %
如何在置信水平设置为 90 % 的情况下构建相同的东西
r - 在 ggsurvplot 中显示大于号(unicode 错误)
我正在尝试在ggsurvplot
对象的地层标签中显示大于号。我在不同的情节中生成了类似的东西(下图):
上图中的功能代码
>
通常,我在字符串中显示符号没有问题。但是,当我尝试将">"
其">1 Prior Progressions"
用作标签时,我不断遇到以下警告和错误代码:
下面是导致错误的我的代码的截断示例。
有错误的代码
legend.labs
但是,当我用unicode 和字符串的组合替换向量时,我能够运行代码,这让我得出结论>
是导致错误。我通常使用这个网站快速搜索 unicode 并找到>
标志的 unicode:https ://www.compart.com/en/unicode/U+003E
然而,这个 unicode 似乎对应于错误的符号。代码运行没有任何错误(只有以下警告 x6: Warning in grid.Call(C_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, : font family not found in Windows font database
)。产生错误符号的图像和代码如下:
符号不正确的代码
是否有任何解决方法,以便我可以>
正确显示?我真的不想只使用文字,因为我在其余的情节中使用了符号,它看起来不合适。如果 KM fit 对象的表示会有所帮助,我可以提供。谢谢!
r - R survminer 95%CI 估计方法
与我们合作的供应商正在尝试复制我的 KM 估计/曲线,包括 95% CI。我用 R 编码,而他们用 SAS 编码。我正在使用survminer
R 中的包和surv_median
函数来导出我的 95%CI。他们将使用该PROC LIFETEST
程序。
我尝试搜索包文档(链接:survminer 文档),但找不到任何有用的东西。
非常感谢任何确定 CI 估计方法的帮助。