问题标签 [survminer]

我正在使用 ggsurvplot 制作生存图，唯一无法实现的是在我的图例上获得彩色标签：图例线根据地层着色，但不根据相关标签着色。我怎样才能做到这一点 ？

我现在拥有的：

你有什么主意吗 ？谢谢 ！奥利维尔

有没有一种简洁的方法来删除由创建的图例中的变量名称ggsurvplot？例子：

我想要的是从图例中删除“性别”一词，如下图所示。我可以通过手动设置图例标签来实现这一点：

但是有更好的方法吗？

编辑：当我手动分配性别（2.情节）时，我不小心交换了男性和女性，这表明这种方法有多么危险。

我试图得到一条显示变量“性别”影响的生存曲线，校正变量“days_to_birth”。

我收到以下错误消息：遵循 ggadjustedcurves 函数：

变量“数据”的类型（列表）无效

然而，“数据”是一个 data.frame：

'data.frame'：408 obs。56531 个变量：

$ ID : 带 408 个级别的因子 "A0C8","A0EZ",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...

$ fustat：int 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 ...

$ futime: int 1219 273 59 89 700 62 200 393 149 460 ...

$ days_to_birth : int -26819 -25202 -22068 -26178 -29951...

$ 性别：因子 w/ 2 个级别“FEMALE”、“MALE”：2 1 2 2 1

关于如何解决这个问题的任何想法？提前非常感谢！

是否可以生成一个空图survminer::ggsurvplot？

这是一个例子。说，根据组的数量，我想创建一个 ggsurvplot。图 1 显示了一个包含 2 个组的示例。如果没有组，则所需的结果将是图 2（此处由 Paint 创建）。

我想使用 survial 和 survminer 包从 R 中的生存分析中绘制数据。我的生存概率从 0% 到 5% 不等。我想要一个将 ylim 设置为 0 到 20 但在轴上也应该有 100% 的图表。看起来像这样：

我正在这样做：

如何解决选择未定义列的错误？我已经加载了 survminer 和生存包。

我有一个生存数据，df如下图：

我在下面安装了一个生存函数：

我不太明白为什么它给出NA了汇总统计数据、中位数和 95% CI

我认为这可能是由于原始数据集中的缺失值，但没有缺失。

中的lung数据集survival工作得很好：

当需要对模型变量之一进行分层时，我正在尝试找到一种方法来从 Cox-PH 模型中制作风险比森林图。对于非分层模型，该ggforest()功能非常出色。运行一些示例代码

生成此图

但是，如果我必须纠正分层的非比例性

出现以下错误消息：

“ [.data.frame(data, , var) 中的错误：选择了未定义的列

另外：警告信息：

在 .get_data(model, data = data) 中：data未提供参数。数据将从模型拟合中提取。”

关于如何从地层模型中获取 ggforest 所需的信息以便生成绘图的任何建议？谢谢你的帮助！

所以我一直试图在森林图中可视化我的 Cox 模型结果，但不断收到错误Error in [.data.frame (data, , var) : undefined columns selected。这对我来说似乎有点奇怪。定义模型并给出摘要，它是正常打印的，似乎没有什么问题。此外，该模型既不包含strata()也不包含tt()对象。经过一番谷歌搜索后，这似乎是一个不时发生的错误，但我找不到任何令人满意的、有效的解决方案来管理它。鉴于所有其他功能都运行良好，我很确定这实际上不是数据本身的问题。

另外，我也很高兴有任何建议可以提供有关结果的信息性概述，尤其是当我的其他一些模型包含分层时，ggforest 似乎不支持。

编辑：我发现了问题：只要我ID在 coxph 函数中指定参数，我就会得到未定义的列选择错误。

eha 包中的可重现样本：

我有一个乳腺癌数据集，并通过生存分析来分析数据。我正在使用 survminer 包来可视化数据。我正在拟合死亡时间作为我数据集中“等级”变量的函数。等级变量有 3 个级别 (1,2,3)。我只想生成一个风险表，但我的图例上出现了一个奇怪的 a、a、a，我无法使用 legend.labs 参数更改它。我将不胜感激任何帮助。我的代码如下：

谢谢