问题标签 [ggbiplot]

这是一个可重现的示例：

产生以下输出：

可以看到，data.training 和 data.testing 上的 pca 产生了非常相似的双图，但第一个主成分反转了它的符号，它们是镜像的。是否可以强制两个组件旋转 180 度？

我需要一些帮助来修改我的 R 脚本，以便为每个组分配不同的颜色。我总是需要手动指定颜色名称/代码 [例如，scale_fill_manual(values = c("grey", "red", "yellow", "green"))]。

完整的 R 脚本在这里

非常感谢您的帮助。

我使用下面的代码来绘制一年内排名前 20 的公司收入。有没有办法添加一条代表这 20 家公司平均值的水平线？另外，如果有人能告诉我如何将我的标题居中，那就太好了！我尝试了 title_x = 0.5 但出现错误

我在 R 中使用

[PCA 图像][1]

但我需要删除灰色和网格线。我在这里尝试过解决方案，但到目前为止没有任何效果。

我已经尝试过这个和其他各种主题，但没有运气。

有任何想法吗？:) [1]: https://i.stack.imgur.com/ADIn9.png

我对 ggbiplot 函数的 ggarrange 有几个问题。这是我的两个情节

如果我使用 ggpubr 而不是 egg，它可以正常工作，但图表不对齐。不过，用鸡蛋，我收到了这个警告

“egg::ggarrange 中的错误（concen.hemi.graph，content.hemi.graph，ncol = 1）+：二元运算符的非数字参数”

问题 #2 是我似乎无法让矢量在第二张图像上不重叠，即使我输入了 loadings.repel = TRUE 或任何其他应该解决此问题的命令。请参阅下面的示例

"

示例数据集：

我尝试解决问题：

我正在使用ggbiplot. 但在双标图中，我只想要旋转、变量和圆圈，我不想在我的图中得分，我该怎么做。

我使用的代码

但是它给了我这样的图片

我想要这样的图片

用于此分析的数据

我偶然发现了一个问题，我可以将双标图像中的所有文本更改为另一种字体，标签除外。

下面是一个简单的问题示例，标签文本明显不同：

我使用的代码也附上。我找不到解决此问题的方法，希望有人可以提供帮助。

我在 ggBiplot 中运行了一个 PCA，它看起来很棒，除了因子名称重叠并且我无法更改因子名称和箭头的颜色 - 如图所示。它们是情节本身上的栗色箭头和相关标签。

到目前为止，代码非常简单，但在生成情节方面很有效。我尝试使用排斥功能但没有成功。我给我们做了 ggfortify 并让 repel 功能在那里工作，但更愿意使用 ggbiplot。问题似乎是在 ggbiplot 中，这些因素被称为“varname”，而不是被称为加载标签

作为参考，这里是 ggfortiy 的代码

数据集 1 -> 外显子：

数据集2-> SNP：

我正在尝试使用 trackViewer 的棒棒糖包（https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/trackViewer/inst/doc/lollipopPlot.html）来绘制它

目前我正在使用实际的外显子开始和长度：

然后针对此绘制突变：

给我：

这真的很压缩。我真的只想绘制外显子和突变，忽略它们之间的空白。

但是，正如您从外显子数据集中看到的那样，我尝试创建一个“adjusted_start”并在我减去基因总长度 (1510427) 的位置结束。然后，我想将它们首尾相连，但还要通过对第一个表所做的调整量来调整 SNP 数据集，以使其全部融合在一起。下面是一个非常粗略的示例图：

任何帮助将非常感激。