问题标签 [ggbiplot]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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javascript - 从 github 安装 ggbiplot r-package 开发者版本时出错

从 github 安装 r-package (ggbiplot) 时遇到错误。

你对我有什么想法吗?谢谢 !

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r - Installing ggbiplot from github

I'm trying to install development version of ggbiplotfrom Github. During installation I'm getting the following error message:

Any idea to figure out this problem. Thanks in advance for your help and time.

Edit

After downloading from Github, also tried

which produced this error message

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r - 使用 ggbiplot 绘制 FactoMineR 的 PCA 对象时出现扫描警告

我正在尝试调整ggbiplot以使用包PCA生成的数据对象,FactoMineR但我收到了我不理解的警告。

这是我到目前为止所做的,我已经使用我在电子邮件列表中找到的详细信息添加了从else if(inherits(pcobj, 'PCA'))下一个开始和结束的位。我没有在代码的其他地方更改任何内容,此处完全复制:}FactoMineR

它产生一个情节,如下所示:

在此处输入图像描述

但它也会产生这些警告,我不明白(@baptiste 的建议删除了一堆其他警告):

如何修复ggbiplot代码以便在绘制对象时不会产生这些警告PCA?我担心他们可能会导致输出不是我所期望的。

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r - R 数据颜色中的主成分分析

大家好,我有一个简单的问题,但我无法在任何教程中得到答案。我对一组数据进行了简单的主成分分析,然后用双图绘制我的数据。

有了这个,我就第一个和第二个组件得到了我的数据的散点图。我希望按颜色分隔我的数据,指示 R 将我的前 20 个数据绘制为红色,将接下来的 20 个数据绘制为蓝色。我不知道如何告诉 R 为这两组数据着色。任何帮助将不胜感激。谢谢!(我对 R 很陌生)

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r - 在主成分分析 (PCA) 图中添加椭圆

我无法在单个站点 PCA 因子图的顶部添加分组变量椭圆,该图还包括 PCA 变量因子箭头。

我的代码:

我尝试同时使用 dataellipse、plotellipse 和椭圆函数,但无济于事。无知在这一点上胜出。如果我没有提供足够的信息,请告诉我。

数据(log10 转换):

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r - 使用 ggbiplot 进行 PCA 缩放

我正在尝试使用prcompand绘制主成分分析ggbiplot。我在单位圆之外获取数据值,并且无法在调用之前重新调整数据,prcomp以便我可以将数据限制在单位圆内。

在调用之前,我尝试通过减去平均值并除以标准差来进行缩放prcomp

ggbiplot安装包如下:

任一代码块的输出:

在此处输入图像描述

根据下面@Brian Hanson 的评论,我正在添加一个额外的图像,以反映我想要获得的输出。

在此处输入图像描述

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r - 带有 ggbiplot 的凸包

根据下面的帮助,我尝试了这个脚本来绘制带有凸壳的 PCA,但没有成功,知道如何解决它吗?

谢谢。

下面的脚本用省略号绘制 PCA(不推荐使用来自https://github.com/vqv/ggbiplot的稍微修改的示例,因为“opts”已被弃用)

删除椭圆很容易,但我试图用凸包替换它们但没有成功,知道该怎么做吗?

谢谢

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r - 更改 ggbiplot 中的图例标题

我在操作时遇到了麻烦ggbiplot,因此我可以指定图例的标题是什么。使用包数据:

我试过以下

但我也没有运气。我想知道是否有人熟悉这个包并能够就如何更改图例标题提出建议。

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ggbiplot - ggbiplot 将色阶分组为离散的

在葡萄酒数据示例中,散点图具有离散颜色、绿色、红色等的组,但我的数据带有连续的蓝色刻度,这使得很难看到不同的“组”;

数据:

我试过重新编号'sub'不连续,但这不会影响显示

任何建议都非常感谢。

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r - ggbiplot - 改变点的大小

有人知道如何更改点大小并仍然保持下面代码中的组颜色吗?

只需添加将geom_point(size = 8)所有点的颜色更改为黑色。

代码: