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R我使用数据框Diff和邻接矩阵创建了一个 igraph 图，adjacency并希望layout.mds以Cytoscape. 我怎么可能做到这一点？

数据框如下：

差异：

邻接：

以下是用于获取绘图的代码：

我刚开始研究Cytoscape

我在这里查看示例。我的目标是有一个加权有向图（很像一个树状图，除了加权）。我需要让边缘反映重量（无论是在长度方面，还是在颜色方面，但在某种视觉上）。但是，从示例中，无论边缘权重是多少，我都没有看到图表中的任何变化。有谁知道我怎么能做到这一点？

或者，如果有其他 JS 库可以帮助我可视化加权图，我也将不胜感激。

我在 csv 文件中有一个大的（200 列/行）邻接矩阵。这详细说明了个人之间的互动。我想将此文件转换为边缘列表，可以手动完成，但会花费大量时间。

数据的一小部分如下所示（第一个单元格是空格）：

我想把它变成这样：

这只是示例数据。基本上我想要的是绘制这些节点如何交互，并从中绘制这些交互的网络。我在 R 包 PCIT 中尝试了以下代码，但它返回错误：

但我收到以下错误：

我有一个使用 cytoscape.js 来绘制 web 基础图的 web 应用程序。我想从本地机器上的文件中加载 json 数据和样式。互联网上的 url 工作，但 localhost url 和本地文件路径不起作用我能做什么

我无法使用 cytoscapeJS 构建图形网络。我可以添加节点并处理它们，这很容易，但我无法配置细胞空间来禁用拖动/移动节点。

我从某人那里找到了一个 JSbin，您可以在其中尝试：http ://jsbin.com/vasenatimu/2/edit?html,js,output

在“初始化选项”下查看http://js.cytoscape.org，我尝试了所有选项，但它们并没有解决我的问题（我将几乎所有选项都设置为 false，我仍然可以抓取和选择节点）。

你能帮我解决这个问题吗？

我正在读取并循环遍历一个 json 文件，以使用 JavaScript 库 cytoscape 创建一个带有节点和边的图形，但遇到了一些新手问题。这是我的带有伪错误的伪代码。

1）为每个带有标签'x'的节点创建新节点

2) 对于边中的每条边，使用“源”、“目标”创建边。

我遇到的问题是，要创建边缘，我需要将每个节点对象作为参数传递， (sourceNode, targetNode, {weight: 'y'} 所以这样的东西不起作用

我尝试创建一个数组并将每个新节点写入其中，但我最终只是覆盖了变量名的值并最终得到一个长度为 1 的数组。虽然我的所有节点都已创建，但我需要一种方法返回并访问节点以创建边缘（显然不让它们指向自己）。

我猜这将是某种 nodeObject.hasKey[label] 并匹配该标签以检索节点 ID，然后创建新边缘？

我认为自己在这里陷入困境。任何建议表示赞赏。下面是我当前的代码，其中读入了缩写的 json 文件。

我正在使用最新的可乐尝试最新的 cytoscape，但出现以下错误：

未捕获的 TypeError：cola.adaptor 不是函数

对于 cytoscape.js 代码片段：

可乐的 API 是否发生了变化？

假设我在 MySQL 中有以下数据：

我希望返回结果以创建适合在 Cytoscape 中可视化的数据。它要求每个节点都有一条专用于每条边的线。输出如下所示：

我认为 PIVOT 运算符可能会以某种方式工作，但我没有运气。

我看到编译器错误的方式是右键单击我的 pom.xml 并单击“运行为 --> maven install”，控制台输出显示编译器错误。

是否可以让 eclipse 实时检测编译器错误并在问题窗格中显示它们，就像您不使用 Maven 时一样？

在 cytoscape.js 我有一个网络，当我选择一个节点时，通常内圈的颜色，即绿色，应该变成黑色，就像在 Mozilla 浏览器中这样：

但是当我在谷歌浏览器中尝试相同的网络时它不起作用，我只是得到这个，就像我在移动节点，而不是点击它：

Chrome 和 cytoscape.js 之间是否存在兼容性问题？或者任何人对为什么选择不起作用有任何其他想法？

谢谢！