我已经导入了我的整个数据集，大约 6k 个节点和 300k 个交互，设法根据它们的交互类型格式化所有边缘，现在我正在尝试将每个基因的新陈代谢作为节点属性导入网络。然而，有些基因参与不同的新陈代谢，因此想法是将每个节点分成 n 个部分，其中 n 是基因参与的新陈代谢的数量，然后为每个新陈代谢使用每种独特的颜色。

有了这个我遇到了一些问题，特别是当我以某种方式导入属性时，我的节点表会移动并丢失所有原始格式，即一些源节点成为目标节点。在找出为同一基因导入多个属性而不必重复该节点的最佳方法时，我也遇到了一些麻烦。例如，基因 1 涉及 Metab 1、Metab 2 和 Metab 3，有没有办法将这 3 个 Metab 包含在单个行/单元格中，然后使用此信息划分节点，或者我需要为每次新陈代谢？

提前致谢。

我需要计算图上每个节点的度数、接近性和中介中心性。我目前在cy.ready()事件发生后的每个节点上使用 Cytoscape.js 中内置的功能。但是，由于图表非常大（250 多个节点，650 多个连接），因此计算时间太长。任何人都可以提出更有效的方法吗？

我正在尝试使用广度优先布局在 Cytoscape 中创建可折叠树结构，以复制D3 可折叠树。

我正在尝试在节点上复制这种类型的单击操作，但还添加了恢复功能 -图像和广度优先布局

我选择 Cytoscape 的原因是因为我有一个场景，即树的节点有超过 1 个父节点。

我尝试使用以下代码添加点击事件：

但是，这仅在折叠和展开其直接子节点时是成功的（其余节点仍然可见），并且当我点击叶节点时也会导致问题。

如果有人知道扩展和折叠节点的方法，请提供帮助。

编辑：伙计们，如果有人也知道简单多级树的解决方案，那也是一个好的开始......

我正在尝试将用于生成 LesMiserables 网络图的代码集成为起点，以查看 Cytoscape 是否可以与 R Shiny 集成

请在此处找到代码： https ://www.r-bloggers.com/network-visualization-part-5-cytoscape-an-update-rcy3/

虽然我能够在 R 中端到端地运行和执行代码（使用正确的 RCy3 版本并与 Cytoscape 连接）

有人可以帮助我如何使用 Shiny 和 Cytoscape 实现这种集成。

我找到了一个参考

https://github.com/rmflight/shinyCytoscape但对我的帮助较少

我正在尝试突出显示从节点到根的单击所有节点和路径。

我在此链接中找到了一个部分示例 -如何突出显示 CYTOSCAPE JS 中两个节点之间的路径。

上面链接中的代码使用 Dijkstra 算法来找到最短路径。但我需要数据中给出的实际路径。

例如，考虑以下数据：

使用链接中的代码，如果源是 a，目标是 f，则树高亮的工作方式如下。

使用 Dijkstra 算法突出显示树

如果有人可以帮助我跟踪并突出显示数据中给出的路径，那将非常有帮助。

是否可以在边缘或另一个节点上捕获鼠标悬停事件，同时将节点拖动到它上面？想法是，当节点在边缘上被拖拽时 - 边缘/节点可以被突出显示。

我正在 Cytoscape 中创建具有广度优先布局的树。

在布局选项中，我将一个节点设置为根。但是有没有办法让我有 2 个节点作为根节点？我在 cytoscape 参考中看到有以下方式的布局选项：

现在，可以使用其 ID 将单个节点设置为根节点。例如：

我该怎么做所以我有多个根为一棵树，如图所示？

多根树表示

有谁知道如何触发节点重绘？我有一个案例，底层数据对象更新其“标签”属性，我可以触发 cytoscape 重绘标签的唯一方法是；

1. 在节点上调用.selectify()then的某种组合。.unselectify()
2. 替换标签使用.data('label', ...)- 我实际上用它自己替换它。

这两个都感觉有点老套，我想我在 API 中遗漏了一些明显的东西。任何人都可以帮忙吗？

谢谢，瑞安。

我正在使用 cytoscape 生成以下内容。但是当我完全单击节点时，它不起作用但是当我单击偏移量（远离节点或边缘）时，单击事件正在触发。

在下图中，当我完全点击节点或边缘时，点击事件不会触发，但是当我点击远离节点和边缘的红点和黑点时，点击事件会触发。我希望它在我单击节点时触发（用红笔四舍五入）。请帮我。

代码：

Cytoscape js代码：

这里 graphDiv 是我的 div，我在同一个 div 中没有任何其他组件。

这是我的聚合物元素：

运行它会在 cytoscape 中引发异常

因为style.getPropertyValue返回""。如果我document.body用作容器，它将返回一个数字并且 cytoscape 可以工作。我做错了什么，我该如何解决？

我找到了一篇关于类似问题的文章，但我没有得到它（或者它不起作用？）：webcomponentsjs is not compatible with third-party scripts that use window.getComputedStyle