问题标签 [cytoscape]

I'm trying to build tiles using Cytoscape. Basically, each rectangle (tile) has a title and I want it to be written within the limits of that rectangle.

My code is:

And:

But it seems the text-wrap value isn't being read. I get:

Can anyone help with this?

Thanks in advance!

我想使用 python（或者可能是 R）将 ARACNE 的邻接矩阵输出转换为 csv 文件。

adj 文件设置为显示一个基因的右侧以及它与其他基因的每个相互作用。例如：

所以上面，A 和 B 相互交互，交互的值为 0.4。A 和 C 相互作用，取值为 0.3，以此类推。

我想改变布局，所以我得到......

基本上我想要一个所有交互节点的列表和相应的值，以便我可以将文件上传到 Cytoscape 并绘制一个网络。

当您在 cytoscape JS 中删除节点时（使用cy.remove()），连接到这些节点的边也会从图中删除。cy.remove() 的描述说它从图中删除元素并返回它们。但是，返回的数据不包括已删除的边。

因此，以下操作序列

一定要修改图表，因为它们可能会导致一些边缘消失。

您应该如何在 Cytoscape JS 中执行可逆删除操作？

我正在尝试在 ext 窗口中显示 cytoscape 图。一切运行良好，直到我添加 ext-all.css，图表不再显示。

这是应该显示图表的面板（#cy div）

问题出在哪里 ？

在下面的代码中，我向图中添加了一个节点，setTimout但它没有被渲染。当我将代码移出时，setTimeout它会被绘制。任何原因 ？

在 Cytoscape 中，我有来自参考节点的双向边。如何仅选择具有特定方向性的边缘。例如，从参考节点中选择所有向外的边。

我正在寻找一个在拖动节点时触发的事件。我认为 tapdrag 看起来像我想要的，但是当鼠标移动到节点上时，只有当鼠标按钮没有按下时才会触发 tapdrag（所以节点没有被拖动，基本上是鼠标悬停）。我尝试了其他几个事件，但似乎没有一个能满足我的需要。

如何在拖动节点时触发事件？具体来说，我想在拖动第一个节点时移动另一个节点，我宁愿在不使用复合节点的情况下这样做。

我正在使用 Cytoscape 2.5.0。

这是基本的工作代码：

如您所见，我们有三种不同类型的节点：foo、bar和biz。

我们分配了选择器以不同的颜色，并根据节点类型显示自定义标签。

此代码工作正常：

但是现在我想抽象样式的分配，以避免在分配选择器和样式时重复代码。

为此，我创建了一个Config对象。

代码现在停止工作。颜色样式工作正常，但所有标签功能都相同。

我认为这可能是 Javascript 闭包的问题，​​所以我将函数包装在 IIFE 中，但这也不能解决它。

有什么解决这个问题的建议吗？

我正在尝试使用 cytoscape.js 和cytoscope-cola.js扩展来实现这种效果。

我想让我的图形的边缘直接向下，如下图所示：

而不是默认显示的无约束图。我正在使用可乐布局，因为我希望能够输入自定义边缘权重。

我已经构建了一个 codepen 来演示我所看到的；但这是我构建图表的方式：

任何关于我如何将图形限制为上图中的行为的输入或方向都会很棒:)

我希望用户能够单击节点内的一些文本并执行一些操作，例如显示一些对话框或打开一些其他窗口。这可能吗？

在文档中有类似的东西：

text-events：如果标签收到事件，是否应在元素上发生事件；可能是或不是。您可能希望将样式应用于 :active 上的文本，以便您知道文本是可激活的。

似乎是这样，但没有示例如何在标签级别使用它..

编辑： 图表上的示例

我如何想象它可能在代码中：

或者