问题标签 [circlize]
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r - 将标签放在 circlize 和弦图中的图例颜色条内
我一直在关注R 教程中的循环可视化。
我尝试重新创建第 16 章中弦图的复杂示例中的图形。特别是,我在询问如何为“染色质状态”制作标记图例,即用数字标记颜色图例中的每个框。
文本指的是图例部分(“可以根据第 4 节中讨论的说明添加图例”)。但是,单个图例网格内的标签并未在此处明确描述。
以下是数据的代码:
这是传说中的代码:
而且,这是我能得到的:
我无法找到正确的功能来制作标记的图例。有人知道如何为“染色质状态”制作图例编号 1-15 吗?
非常感谢您提前。
r - Circos:circos.barplot - 不能添加标签;从图中排除的条形图
我正在尝试创建一个具有 4 个扇区的圆形条形图;每个扇区都有不同数量的柱。我希望扇区大小与条的数量成正比,并用特征(表型)和频率值标记每个条。
我有 4 个扇区,“fruit_sector”:“apples”、“pears”、“oranges”、“bananas”;对于每个部门,我都有几个不同的品种,“表型”。对于每个,一个频率。
几个问题:
- 条形标签从每个扇区的文件开头开始,而不是遍历每个扇区(所有扇区都从“苹果”表型开始
- 我无法对齐标签
- 我想将频率添加到每个条形。
- 低频条没有出现(以下错误)
- 我必须添加一条频率 = 0 的线,否则最后一个条将与间隙重叠。
警告:
我有基本的 R 技能,有什么帮助吗?
r - 如何在 R 中创建 Circlize Circos 图或弦图?
很长一段时间以来,我一直在使用circlize
包准备和弦图。R
但是,现在我有一个数据框,我必须以特定方式表示,我需要一些帮助,因为在尝试了许多线程中提供的解决方案之后(R:circlize circos plot - 如何在具有最小重叠的扇区之间绘制未连接区域,R用数据框的circlize制作圆/弦图)我无法画出我的想法。
以下是大型数据框的子集的样子:
我想绘制一个圆形可视化,以便我可以表示 shared COMP
across SEQ
,类似于下面的草图:
这里的外部网格代表列ID
。黑色的内部网格表示SEQ
属于每个ID
。很多时候,一个ID
值可以有多个SEQ
值。灰色的链接代表COMP
之间共享的数量SEQ
。联动的宽度代表数字,即shared越高COMP
,宽度越大。
我无法准备我的数据框来显示这样的图。我也尝试使用函数的directional
参数使用方向关系chordDiagram()
,但我没有达到预期的结果。
r - 如何从R中的数据框中将文本添加到圆环图
我有一个看起来像这样的df
X | 是 |
---|---|
一个 | 3 |
乙 | 6 |
C | 4 |
D | 9 |
我想使用带有 4 个部分的 circlize 将其绘制在 circos 图中。每个部分都应该有 X 轴作为标题,并且在该部分中它应该有 Y 轴值。我只想直接从df中获取数据并将其绘制在circos图上