问题标签 [circos]
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perl - 在 MacOSX 10.6 上为 perl 安装 GD 库
我一直在尝试为 perl 安装 GD 库，但现在无济于事。我已经尝试了我在互联网上可以找到的所有小东西，但没有。我正在尝试获取需要 GD 包的 Circos 图。
当我尝试通过 CPAN 安装它时，它给了我这个错误：
我尝试使用 --enable-shared --enable-static 选项重新安装 jpeg 库，但也没有帮助。我还安装了一个 MacPorts 版本的 perl，我想我可能弄乱了我的 mac 附带的 perl 安装。任何人都知道为什么会发生这种情况？
（是的，我对终端世界和所有这一切都比较陌生，并且仍在尝试导航）
谢谢！
visualization - 如何摆脱 Circos 中的直方图网格
我正在使用 Circos 绘制一些直方图。如何摆脱下面示例中的垂直网格？
例如 http://desmond.imageshack.us/Himg843/scaled.php?server=843&filename=21217092.png&res=medium
perl - 如何解决 Circos SVG 放置文本不正确的问题？
我有以下Circos图，我将其渲染为 SVG 文件，然后转换为 PNG，以进行说明：
环绕外缘的文本标签从 12 点钟到 9 点钟方向正确，朝外，远离灰色弧线。
在 9 到 12 之间，文本标签向内，与灰色弧线重叠。这不是预期的。
这是一个特写，以澄清问题：
如果我从 Circos 输出 PNG 而不是 SVG，则标签会正确绘制，但是我无法在 Adobe Illustrator 或 Inkscape 中标记矢量格式的 SVG 图。所以我需要 SVG 输出。
circos.conf这是与添加标签相关的文件片段：
我不确定我可以应用哪些其他选项来尝试解决此问题。我的问题是：我应该在这个或另一个配置文件中尝试什么来修复 SVG 输出？谢谢你的建议。
python - 'circos' 风格的情节与 matplotlib？
有谁知道是否有办法用python 包或任何其他 python 库制作circos 风格的情节？matplotlib它们不必像示例那样漂亮。
circos - 你好世界马戏团的例子？
有人可以为我提供马戏团的“hello world”示例吗？(www.circos.ca)
我知道压缩发行版提供了大量教程，但我学习的方式是采用最低限度的配置，然后从中构建——我找不到。
那么，有人帮我吗？
javascript - D3和弦图有准确的位置
我想在 D3 中创建和弦图，但要指定区间与确切位置的关系，如下面的Circos示例：
。
有没有办法在 D3 中做到这一点？
如果没有，有没有办法在任何其他 javscript 数据可视化库中做到这一点？
perl - 在安装期间尝试为 perl 模块编写 Makefile 时反复失败
我正在尝试安装一些 perl 模块作为Circos设置的一部分。我在终端中使用 cpan 安装模块，虽然初始设置似乎进展顺利，但在安装的最后一步，即编写 Makefile 时，所有模块都失败了。
这是错误的样子：
我认为唯一的选择可能是手动安装模块而不是使用 cpan，但我认为在这里提出问题可能值得一试。
perl - Circos 错误：缺少必需的模块
我的 Perl 模块列表中显然有Clone。为什么我会收到此错误？
我在Mac OS X v10.8 (Mountain Lion) 上运行 Perl 5.16。
我尝试从 .tar 文件重新安装，但出现错误：
dyld：惰性符号绑定失败：找不到符号：_Perl_Gthr_key_ptr
网上有很多关于这个错误的问题，但很少有解决方案......
macos - 在 mac 10.9 中安装 libgd 时出错
我正在尝试按照此处的说明（https://mikewest.org/2007/04/installing-libgd-from-source-on-os-x）在我的 mac OSX 10.9 上安装 libgd 并在此处获取更多信息（在 MacOSX 10.6 上为 perl 安装 GD 库）。
主要目标是能够安装和使用 Circos。
我按照所有步骤安装各种库 libpgn、pibjpeg 和 freetype，主要使用./configure && make && make sudo install...但是 1）./congigure来自 libgd 的命令没有找到我刚刚安装的库，我得到的是以下内容：
我阅读了建议使用等的 README 文件（yeeee）。--with-png=myDirectory --with-freetype=myDir我这样做了（不确定它是否有所不同）但是当我收到make命令时，我收到以下错误
...更广泛的馅饼：http: //pastebin.com/BuvskMPe
所以我被困住了，我正在网上阅读，看起来它与 Xcode 和 gcc 有关，但我不知道如何解决这个问题。
任何帮助都是极好的！！
perl - 让 perl GD 工作
我正在尝试让 GD perl 模块在我的 mac 上工作。我已经安装了 gd 库
然而 GD 未能通过 make 测试
我意识到 GD make 测试是否成功，所以如果我强制安装，我仍然无法让 Circos 程序使用它。通过 circos 测试 GD 时出现以下错误：
不知道出了什么问题...