问题标签 [proc-r-package]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - pROC 中的 ROC 特异性

我尝试使用 pROC 包绘制 ROC 曲线,代码如下:

特异性的范围默认为1.5到-0.5,而我希望是0.0到1的范围。敏感性也有类似的问题。 在此处输入图像描述

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r - pROC R 封装 AUC 置信区间

我正在尝试使用 pROC 包计算 ROC 曲线下面积的 95% 置信区间。该区域的估计值为 0.9092,看起来不错。但是,置信区间的估计值是“0.95% CI:0-0 (DeLong)”,我不明白。

我想知道什么可能导致这种情况发生。我只是使用一个响应向量和一个带有 ci 函数的预测变量向量。响应编码为 0-1(数字,而不是因子),预测变量是单个浮点数。

我有大约 115,000 个控件和 34,000 个案例,以防万一。

更新:这似乎是一个大小或多个重复观察问题

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r - 如何为 R 中具有三个类的 randomForest 模型绘制 ROC 曲线?

我正在使用 R 包 randomForest 创建一个可分为三组的模型。

我试过几个库。例如,使用 ROCR,您不能进行三个分类,只能进行两个分类。看哪:

来自 model$votes 的数据如下所示:

我可以使用 pROC 包以这种方式获得一些非常丑陋的 ROC 图:

这些图如下所示: 图 1:丑陋的 ROC 曲线

但是没有办法平滑这些线条,因为它们不是曲线,因为它们每个有 4 个左右的点。

我需要一种方法来为这个模型绘制一条漂亮的平滑 ROC 曲线,但我似乎找不到。有谁知道一个好的方法?首先十分感谢!

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proc-r-package - pROC 默认 DeLong 或引导程序

对于是否将 DeLong 方法或 2000 引导程序用作默认 ROC 曲线方法的建议,我将不胜感激。我已经阅读了 pROC pdf 指南,但不确定哪个是默认方法。pdf 的不同部分,特别是在有关 AUC 计算的置信区间的部分中提到 DeLong 或 2000 引导程序是默认值。

我使用的代码包括以下内容:

非常感谢您在这里的任何建议。

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r - 闪亮的 ROC 曲线

我正在尝试使用闪亮来渲染 roc 曲线。我尝试同时使用 pROC 和 ROCR 包,并使用 renderPlot,但输出图显示为 NULL。有没有办法在闪亮的应用程序中渲染 ROC 曲线?

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r - pROC库(R)的ci.se的置信区间公式

我在库的文档中进行了搜索,但没有找到哪种类型的 CI 公式使用函数 ci.se 来计算间隔。在这篇文章https://ncss-wpengine.netdna-ssl.com/wp-content/themes/ncss/pdf/Procedures/PASS/Confidence_Intervals_for_One-Sample_Sensitivity_and_Specificity.pdf我看到至少有 5 个计算 CI 的公式灵敏度。有人知道这个功能吗?我需要知道公式的类型,因为我在研究中使用它。谢谢。

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r - R中带有pROC包的face_wrap图(几个变量)

我有三个自变量和一个二元结果变量。我正在使用pROC包进行分析,并希望将所有三个 ROC 图彼此相邻呈现,类似于face_wrap功能。例如,使用以下代码,

我可以为单个自变量生成一张图片s100b,而我需要另外两张(对于其他 ind. Var 2 和 ind. Var 3)并彼此相邻绘制,例如:

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r - pROC 包中的 roc() 函数:控件和案例及其上下文的使用

有人可以解释R 中 pROC 包中的函数controlscases参数的含义roc(),以及如何使用它们吗?如何检查数据集中可用的控件和案例的数量?

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r - R - ROC 曲线/AUC 特异性与 1-特异性

在此处输入图像描述我已经创建了一些预测模型,并且正在通过查看 ROC 曲线和 AUC 来评估它们。

目前,我在 X 轴上有特异性,但是,当我研究 ROC 曲线时,我看到 1 - X 轴上的特异性。

有什么区别,我应该使用哪个来验证我的预测模型?如果特异性在 X 轴上,我是否仍想最大化 AUC(根据经验,答案是肯定的,但我想确认)?

这是我绘制它的方式:

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plot - 使用 pROC 包的特异性/敏感性与截止点

我需要绘制下图,以便为逻辑回归模型选择最佳阈值。

作为截止值函数的灵敏度和特异性图

但是我不能使用在我所做的许多研究中使用的包(epi 和 roc)。我确实有包 pROC。反正有没有使用这个包来绘制图表。另外我还能如何选择最佳阈值?仅使用 ROC 曲线如何工作?