问题标签 [openmpi]

我正在尝试使用 openMPI 设置一个相对较小的集群（36 核），但遇到了一个小问题。我已经安装并正确运行了所有 openMPI 库和任何依赖项（我可以在每台计算机上作为 localhost 运行一个 hello world MPI 程序）。问题是我似乎找不到太多关于如何让计算机一起执行程序的文档。我可以执行 mpirun --hostfile 命令，但我不想每次执行作业时都必须指定主机文件。此外，未来的用户不会一直访问集群上的所有 IP 地址。他们和我希望能够毫无问题地执行 mpirun -np 20 programFile。有人可以就我现在需要做的事情提供一些指导吗？公平地说，我 我在大学里只上过一节课，我们用 MPI 编写并行程序，但他们从未向我们展示如何使用 openMPI 设置新集群。我很感激你们能给的任何建议。我通过搜索找到了本指南MPICH_Cluster_Setup如果是 openMPI 那就太好了。是否有与 openMPI 相关的类似指南？

我想在使用 OpenMPI 的 TCP/IP 网络连接的多台机器上分发数据。任何人都可以指出正确的资源和方向。我是 OpenMPI 的新手。

谢谢

我有一个快速的问题。

我最近尝试使用我学校的服务器运行 mpi 程序，但遇到了以下“奇怪”问题：

为了执行“mpirun”命令，我必须将其路径放入 .bashrc 中的默认路径中，然后输入：

只是得到一个关于缺少库的错误，名为：libmpi.so.0

但是，如果我尝试使用完整的 mpirun 路径运行程序，如下所示

一切都很好。

我检查了 openmpi 的常见问题，它说我需要将以下行放入我的 .bashrc

这实际上为我解决了问题，但我的问题仍未解决：

为什么会这样？

在此先感谢您的时间。

我在一个集群中工作，每个节点都有 16 个处理器。我的 Open MPI 版本是 1.5.3。我在 fortran 中编写了以下简单代码：

然后我编译代码：

并运行它

我的节点文件如下所示：

node1 和 node2 各重复 16 次。

我可以编译成功。当我为 -np 16 （所以只有一个节点）运行它时，它工作正常：每个从站都完成了它的任务，我在终端中得到了提示。但是当我尝试 -np 32 时，并不是所有的奴隶都完成了他们的工作，只有 16 个。

实际上有 32 个节点的程序并没有给我提示，所以我认为程序被堆叠在某个地方并且正在等待执行某些任务。

只要我在这个微不足道的问题上花了一些时间，我想收到你的任何评论。

谢谢。

我正在使用 MPI-2 并行化代码。当我使用 8 个核心处理器时，它成功地加速了。

我只是想知道如果我将 GPU 用于相同目的而不是 CPU 会有什么影响？根据我目前的研究，OpenMPI 与 GPU 兼容，只有在处理器间通信比 CPU 多的情况下，速度才会更好。有没有人尝试过，或者对此有什么看法？

我正在具有 OpenMPI 的服务器上编译我的代码，但我需要知道我使用的是哪个版本，以便阅读正确的文档。是否有一个常量<mpi.h>可以打印以显示我的当前版本？

MPI 中是否存在自定义数据类型之类的东西，或者您是否必须将所有内容展平为文本字符串并作为 MPI_CHAR 传递？如果您需要展平所有内容，是否有我忽略的内置功能？

我注意到所有 MPI 调用都需要一定程度的对称性，否则它们会挂起和/或产生意想不到的结果。您如何处理动态问题或数据集？

我在网上找到的每个示例总是将问题分解成可均匀分割的块，或者在计算中使用代码块的重复。

假设我有 8 个线程可用，但我想做的工作以 57、80、99、64、13 等为单位......

是否有解决此类问题的首选方法？减少似乎需要线程之间对函数的平等调用？（即 57 将需要来自每个线程的 8 次调用，即使最后 7 次毫无意义） Scatter 似乎是相似的。有没有像 Scatter 这样的东西适用于非均匀整除的问题集？

我希望hist(1:1000)使用 OpenMPI 在不同的处理器上调用相同的数组，这样当一个处理器修改hist此修改时，其余处理器中就会更新。

我已经编写了代码并声明hist(1:1000)了但问题是hist在每个处理器上独立更新，然后我所做的是将数据发送到“主节点”以便根据从站的信息更新另一个直方图，但这是我不想要什么。我想在每个处理器上更新相同的直方图。

是否可以使用 OpenMPI 做到这一点？

每个线程读取一个文件的一部分并将其写下来。

在本地机器上工作得很好（mpich）在集群上出错（openmpi）

我的程序在函数 write_result 中的 close(fd) 处终止。

这是错误消息

在搜索了相关问题后，我猜测问题可能来自文件打开和关闭过程。由一个特定线程打开的文件应该由同一个线程关闭。也许 openmpi 无法识别哪个线程打开了它，哪个线程关闭了它。但它在 MPICH 上运行良好。