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我正在使用 Python 制作一个脚本来处理我的博士学位中的一些化学结构。我想为 python 安装 openbabel 库。我尽力了，但我无法安装它。它总是给出错误： Error: SWIG failed. Is Open Babel installed? 这是我 PC 上的 Python 路径：C:\Users\malih\AppData\Local\Programs\Python\Python36-32. Openbabel 安装在以下路径C:\Program Files (x86)\OpenBabel-2.3.1。

当我运行时python -m pip install openbabel，它给出了以下错误：

我尝试按照此页面上的说明进行操作，但它们纯粹是针对 linux 的，我无法针对 Windows 进行跟进： 如何在 Travis CI 中使用 python-openbabel？

我还尝试从以下指南安装 pkg-config，但即使在此之后，它也会给出相同的错误： 如何在 Windows 中安装 pkg config？

请帮助我，因为我的工作是基于此的，我被困在这一点上。在此先感谢您的时间。

我正在使用 Python 制作一个脚本来处理我的博士学位中的一些化学结构。我想为 python 安装 openbabel 库。我尽力了，但我无法在 Windows 上安装它。我之前在如何在 Windows 10 中为 Python 3.6 安装 openbabel发布了一个关于在 Windows 上安装它的问题？但找不到解决方案。该解决方案安装了库，但它不起作用并且无法连接到 SWIG。不，我正在尝试将它安装在我的办公室计算机上，这是过去 5 个小时的 mac，但我不知道发生了什么。我尝试从 Opnbabel 的源代码安装它并将其与 python3 链接，但它出现了问题。如果我使用以下命令：

cmake ../ -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

它成功地将它链接到我不想要的 Python 2.7。当我尝试以下选项时，它会给出如下所示的错误：

cmake ../ -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

或者

cmake ../ -DRUN_SWIG=ON -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_INCLUDE_DIR=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/include/python3.5m -DPYTHON_LIBRARY=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/libpython3.5m.dylib -DPYTHON_BINDINGS=ON

在大量成功输出后，最后会出现以下错误：

我不确定为什么它将 Python 检测为 v1.4-- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "1.4")而不是找到 v.3.5。我也用 python 3.6 尝试了所有过程，但发生了同样的错误。我还使用从 github 获得的 openbabel，据说在以下帖子中可以使用这些命令：http ://forums.openbabel.org/OpenBabel-for-Python-3-td4659432.html 但它不起作用也是。请帮助我，因为我需要此模块进行研究。谢谢

我首先通过 brew 安装了 Open Babel。当我尝试运行命令：“obabel -:”CC(=O)Cl”-opng -O mymol.png”时，我收到了以下错误消息：“ Open Babel Error in PNG Format PNG2Format not found. 可能是 Cairo 库未加载。” 然后我继续使用 brew 卸载 Open Babel。然后，我用 brew 安装了 Cairo，然后再次用 brew 安装了 Open Babel。尽管如此，我还是尝试创建一个 PNG 输出，它给了我同样的错误信息。我就是不知道怎么回事？？

我正在尝试为分子列表（SMILES 格式）中的每个元素（分子）调用外部程序（Openbabel）。但是，我不断收到相同的错误：

我的代码有什么问题？

我正在使用 Pybel - OpenBabel API 的 Python 包装器，我正在尝试禁用以下警告：

当从ChEMBL获取指纹分子SMILES时，我的警告一直被提出

与这篇文章类似，但我不想更改日志记录级别，而是将所有日志记录信息重定向到一个文件。我相信相关的 API 调用是：

或者：

但是该SetOutputStream()方法只接受 type 的对象std::ostream *，而不接受 Python 文件流，例如open('/path/to/log.txt', 'w')或sys.stdout.

TL；DR：有没有一种合理的方法可以将日志信息定向到 PyBel 中的文件？

我有一个 SMILES 格式的分子列表，我将其转换为 InChIKey 格式。但是，其中一些正在生成警告。我希望能够生成一个文件，显示在转换每个分子的过程中产生的警告，以便团队成员可以查看它们。是否可以以编程方式捕获这些消息，而不仅仅是记录它们？

一个片段说明了我希望能够做什么：

试图在heroku上安装openbabel。我将这一行放在我的requirements.txt文件中：openbabel==2.4.1. 我通常使用 anaconda 将 openbabel 安装到我的本地计算机上。看起来它有一个名为 SWIG 的依赖项，但在线搜索表明可以使用自制软件安装 SWIG，那么我怎样才能在 heroku 上实现呢？我不知道该怎么办。任何帮助表示赞赏。目前，它给了我这个错误信息：

我正在开发一个网络应用程序 django，当我安装 openbabel 并尝试导入 pybel 时出现错误

我使用的venv是在执行所有这些命令时激活的

我像这样安装openbabel：

sudo apt-get install python-openbabel

我也试过：

sudo apt-get install openbabel libopenbabel-dev swig

然后我做了：

pip install openbabel

之后，我尝试导入 pybel（在导入 openbabel 之后）

这是实际结果：

请问有什么帮助吗？

由于某些情况，我被要求开发一个页面，该页面使用 .Net C# 中的 Process 来通过命令提示符调用该函数。该代码在 Visual Studio 上运行良好，但在 IIS 服务器上部署时。流程似乎不起作用，我已经调试并发现流程本身有效。但是打开的 Babel 命令不起作用，我做了仔细检查，我提供的身份应该没问题，我什至提供了管理员权限，但仍然不起作用。它甚至没有弹出或错误，它只是简单地忽略它并执行命令。我将命令放入 .bat 文件中，并带有一些额外的命令来测试 .bat 是否有效。一切都很好，直到带有打开 babel 的命令，然后进程似乎对命令没有反应。

obabel %1 -O %2 --gen2d

这是我提供给它的命令，%1 是输入文件，而 %2 是输出文件名。一个非常简单的转换。注意：一切都很好，只是在整个文件中忽略了 open babel 命令。并且我尝试为其提供管理员权限，但仍然无法正常工作。如果直接与服务器上的命令提示符一起使用，或者通过Visual Studio可以使用 open babel 。但如果我通过 IIS 服务器部署它，它就不起作用。