问题标签 [openbabel]
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wxwidgets - 为什么编译openbabel时找不到wxWidgets?
我正在尝试在我的 centos 7 系统中安装 openbabel-2.4.1。cmake 命令 (cmake ..) 提供无法找到 wxWidgets 和 Eigen 的信息:
实际上我已经安装了 wxWidgets-3.1.2 和 EIGEN3 并将它们的 lib 路径添加到 LD_LIBRARY_PATH 环境变量中,但是为什么 cmake 找不到它们?以及如何解决问题?先感谢您。
python - 如何通过 pip 安装最新的 python 模块?
我可以看到 openbabel 3.0.0 和pip3 search
. 但是当我安装它时pip3 install
,我只得到 2.4.1。有什么问题吗?如何安装最新版本?谢谢。
当我尝试指定版本时,pip
找不到它。这很奇怪,因为 pypi 上的版本是 3.0.0。https://pypi.org/project/openbabel/
open-babel 3.0.0 由 homebrew 安装。
python-3.x - 用 pip 安装 openbabel3
我试过pip install openbabel --log log_file
了,我得到了以下错误:
这里 pip 是 pip3 的别名。
日志文件在这里(不知道你能不能看懂,这是我第一次分享文件)
注意:几天前我在我的电脑上打开了第二个用户,我不知道它是如何影响事情的,但也许这就是原因。
我正在使用 Mac OS Catalina。
python - 为没有 conda 的 macos 导入 openbabel 包装器 pybel
以前我在这里问过如何为 macos 安装 openbabel 。现在我还需要安装openbabel python wrapper pybel。我试过pip install pybel
了,它被安装了。然后,当我按照教程进行操作时,
我收到以下错误:
事实证明其他人也有类似的问题,事实上我在邮件列表中发现,我引用
'我猜你是通过 pybel 安装的
pip install pybel
,这是“错误的”pybel'
然后他们给出了一个解决方案pip install openbabel
,这对于 macos 是不可能的。
一个解决方案是用来conda
安装 openbabel,但我没有使用 conda,我想保持这种方式,所以我正在寻找一个不需要conda
.
python - 在 venv 中使用 pip for linux 安装 openbabel
我正在尝试在没有 root 访问权限并使用虚拟环境的 linux 计算机上openbabel
安装。pip
我运行以下命令
pip install openbabel --user --log LOG
然后我收到以下错误:
主要问题似乎是
我看到很多人有类似的问题,setup.py
建议他们转到目录并再次运行相同的命令,但我不知道我应该转到哪个目录...
编辑
如果我从 github 下载 openbabel 并给出它的路径,它会起作用吗?
python - 如何安装openbabel
我使用以下方法安装了 Mac 版 OpenBabel:
我尝试使用 pyenv 3.9.0 版并收到以下错误:
我该如何解决这个错误?
当我跑步时,brew config
我得到:
python - 此页面无法正常工作 127.0.0.1 未发送任何数据 Flask 中的错误
我正在构建一个 Flask webapp,它使用 OpenBabel API(化学工具包)为我生成一些文件。当我调用这个特定的函数时,它似乎工作正常并在我想要的目录中生成文件。但是,一旦它回到 Flask 就会崩溃,并且 Flask 不会呈现 html 模板,而是将我重定向到This page isn’t working 127.0.0.1 didn’t send any data
. 我发现在删除函数中的代码时它可以正常工作。所以这可能是 OpenBabel 的问题。Openbabel 函数本身不会输出任何错误,并且基于调试似乎甚至在最后返回。
我从其他 SO 答案中尝试了很多东西,包括将我的主机更改为 0.0.0.0、添加 threaded=True 和其他一些解决方案。一切都无济于事。我尝试调试了很长时间,但现在我迷路了,因为我已经尝试了我所知道的一切。我所能得到的只是来自 Flask 的 SystemExit 异常。有时它能够在它之后运行 print 语句,但更多时候它会立即崩溃。我不知道问题可能出在哪里。感谢我能得到的任何帮助。代码示例(稍微缩短了一点):
调用的函数:
如果需要,我可以将项目上传到 Github。它确实需要安装一些依赖项,我现在正在使用 conda,但我也可以通过 pip 使其可用,因为 OpenBabel 在 pip 中可用。
Ps:崩溃后没有显示任何错误消息
r - 在 R-shiny 服务器上安装“officer”包
我正在尝试在 R-shiny 服务器上为生成 PowerPoint 幻灯片的应用程序安装“officer”包。
我不断收到以下错误消息:致命错误:openbabel/babelconfig.h:没有这样的文件或目录。编译以“错误:包'xml2'的编译失败。我在服务器上安装了“openbabel”。安装'xml2'是否需要另一个包??
如果您知道有关在 R-shiny 服务器上安装“officer”、处理包依赖项或从 R-shiny 应用程序中的 R 代码创建 Microsoft Office 文件的替代方法的任何信息,请提供帮助。
c# - 为什么在运行 OpenBabel hello-world 程序时会产生这个异常?
我正在尝试以64 位模式编译并运行其网页上提供的以下 OpenBabel 测试程序。
程序.cs
预期输出:
OpenBabel 有两个不同的安装程序,用于 PC 上的 32 位和 64 位模式。
在 32 位模式下运行源代码时,我收到以下消息:
在 64 位模式下运行源代码时出现以下异常:
如何解决这些错误/异常?
php - OpenBabel PHP 扩展(版本调用)
有没有办法使用 OpenBabel PHP Extension 来确定它正在使用的 openbabel 版本?