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我正在使用 Pybel - OpenBabel API 的 Python 包装器，我正在尝试禁用以下警告：

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*** Open Babel Warning  in ParseComplex
  Illegal aromatic element b-

当从ChEMBL获取指纹分子SMILES时，我的警告一直被提出

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3 回答 3

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您可以从模块中获取 openbabel 记录器（类OBMessageHandler）的句柄openbabel。诀窍是首先从 pybel 模块访问 openbabel 模块，获取OBMessageHandler类，然后实例化记录器（文档）：

import pybel

ob_log_handler = pybel.ob.OBMessageHandler()

使用句柄，您可以将 设置log_level为0以禁用除关键消息之外的所有消息（文档）：

ob_log_handler.SetOutputLevel(0)

您可以使用以下枚举（此处的文档）来选择您的日志记录级别。默认值为1，它记录所有警告：

  • 0：严重
  • 1：警告（默认）
  • 2：信息
  • 3：审计（当分子被破坏/感知时）
  • 4：调试
于 2018-05-18T21:15:31.003 回答
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如果您想摆脱所有错误消息：

pybel.ob.obErrorLog.StopLogging()
于 2021-04-04T03:57:28.067 回答
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Aelfinn 的回答对我不起作用，但是以这种方式访问​​ SetOutputLevel 确实：

pybel.ob.obErrorLog.SetOutputLevel(0)

于 2020-06-25T05:46:22.147 回答