问题标签 [metafor]

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r - 来自 metafor 的 replmiss 不起作用 - 仍然有 NA

我正在尝试按照以下示例对一些缺失数据进行元分析: http ://www.metafor-project.org/doku.php/tips:assemble_data_smd?s[]=difference&s[]=means

但是 replmiss 命令对我不起作用,我只剩下 NA,因此元分析中省略了具有缺失值的研究。

我可以在链接中的示例和我正在做的事情之间找到的唯一区别是,我自然在创建 tval、dval 和 pval 变量之前拥有 NA,并且在链接中他们首先创建它们然后插入 NA。

这是我的数据:

任何人都对 replmiss 有很好的经验并且知道如何使它工作?

谢谢!

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r - How to add text to forest plots

I am trying to create a forest plot using this dataframe with three columns: studies is the name of the study, n is the number of samples in the study and accuracy is % accuracy:

Here is the code to create the forest plot:

The plot is created but no text (Label on top) shows up for the Dataset column and the Accuracy column.

enter image description here

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r - 在R中的森林图中(metafor包)减少`xlab`和x轴之间的空间

我试图在 R中的包生成的森林图中减少xlab(标题:)"Log Risk Ratio"和 x 轴(见下图metafor)之间的空间,但没有成功。

有没有办法做到这一点?

在此处输入图像描述

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plot - 通过研究在漏斗图中着色点

我正在进行一项荟萃分析,检查三年级阅读理解干预的效果。我正在分析标准化的平均差异。我有 20 项研究,有 54 种影响(多种结果测量或治疗比较/研究)。鉴于样本量小且效果的相关性,我使用以下代码进行初步分析:

我也想做敏感性分析。我知道不建议将漏斗图和修剪和填充程序用于多级数据。但是,我想生成一个漏斗图,其中包含按研究着色的各个点。我有一个包含颜色、study_id 和内部引用的数据框,我已将其合并到我的主数据框中。我尝试使用以下代码来获取漏斗图:

但是,这会产生一个漏斗图,其中所有点都以第一项研究的颜色(海蓝宝石)而不是不同的颜色着色。

关于我能做什么的任何想法?我还想创建一个显示颜色和内部引用的图例。

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r - Shift lines in plot for metafor object

community, I have a problem with a plot for my meta analysis with moderators. Unfortunately my error bars overlap. Which is why I am searching for an opportunity to shift my lines a few inches. I know the dodge.position function in ggplot. Is there a similar function in the "normal" plot function?

This is my code:

Which leads to this output:

enter image description here

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r - 如何合并来自 metafor 和 ggplot 的图?

请在下方q找到我的数据p

我想合并一个library(metafor)用两个计算的森林图ggplots

我用gridArrangeand尝试了多种方法par(),但没有任何成功。我知道关于这个主题有几个主题,但没有一个涉及ggplotmetafor

合并后的图应该这样排列:

在此处输入图像描述

PLOT 1PLOT 2基于以下数据w


PLOT 1 基于此脚本。

看起来像这样:

在此处输入图像描述


PLOT 2基于此脚本

看起来像这样: 在此处输入图像描述


最后,PLOT 3是来自metafor

森林图如下所示:

在此处输入图像描述

有以下数据

和脚本

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r - 我可以在 metafor 的 Forest Plot 中更改从 ilab=cbind 加载的文本的颜色吗?

q在下面找到我的数据。

我制作了这个森林图,我希望圈起来的文字是红色而不是黑色。这可以做到吗?

在此处输入图像描述

我的剧本

我的数据q

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metafor - 使用 metafor 创建带有残差的漏斗图

在 R 中使用 metafor:对于不包含任何调节器的模型,如何在漏斗图的 x 轴上绘制残差?

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r - 在将 byvar 指定为不同的东西之后,我可以使用学习年将我的学习标签安排在森林地块中吗?(元包-R)

在指定我希望子组除以某个变量后,我可以将我的所有研究标签安排在我的森林图中的子组中,并附上出版年份吗?

这是我目前正在使用的代码。

brugia.forest <- metaprop(event = no.positive, n = no.tested, studlab = studylabel, data = brugia, byvar = diagnostics, bylab = c(“直接检测”、“直接和间接检测”、“间接检测"), print.byvar = F, sm = "PLO", method.tau = "REML", title = "", hakn = T)

我希望“诊断”组中的研究按照从最旧到最近的顺序排列,而不是像目前那样按字母顺序排列。我正在使用 R 的meta包,因为它的用户友好性并想继续使用它(因此,metafor 的建议可能没有太大帮助)

谢谢。

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r - Metafor:使用提供的置信区间

我一直在使用 Metafor 进行元分析。我已经能够从 14 篇文章中提取优势比、置信区间和样本量。

这是我一直在使用的代码:

data <- read.csv(file="OR.csv", check.names=F,sep=",") dat=data random = rma(OR,SE_X,data=dat) forest (random) funnel (random)

我的问题: rma 函数生成的置信区间与作者提供的置信区间有很大不同。这显然是一个问题,我想使用文章提供的置信区间,而不是 RMA 生成的置信区间。

任何人都可以帮我解决这个问题吗?

谢谢

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