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c++ - GDCM:我想对图像做一个简单的锐化滤镜,但不知道如何更改像素值
我是 GDCM(c++) 的新手。我想做的是为 dicom 图像编写一个非常简单的拉普拉斯滤波器。我已经获得了图像的缓冲区,但是接下来要做什么呢?有没有一种方法可以让我访问具有二维数组中坐标的像素?更改像素值后,如何将缓冲区保存到原始图像?
到目前为止,我只是想学习 DICOM,所以我的代码实际上什么也没做,但我想知道的是如何访问像素数据并对其进行更改。可能我可以将这些像素视为二维数组。我的代码是:
dicom - 阅读来自不同供应商的私有 dicom TAGS - dcm4che2
我想知道哪种是设置和构建 JAVA 应用程序(使用 dcm4che2 工具包)的最有效方法,以便能够以正确的方式识别和解析来自不同供应商的 DICOM。
例如,目前我需要解析西门子、通用电气和飞利浦制造的 MRI 的私有标签。我可以看到,即使对于同一个供应商,相同私有标签的 VR 也存在差异。
目前我正在尝试使用下面列出的代码来解析这些私有标签:
但是,我认为这种解析来自不同供应商的 DICOM 标签的方式在代码/逻辑的一致性和维护方面不是最有效的!
例如,在许多情况下,同一供应商的不同型号之间存在不同的 VR。
有没有人开发过有这种要求的应用程序?有没有其他方法可以尝试和自动化这个过程(例如,通过使用每个供应商/型号的数据字典?)
有人对此有一些粗略的建议或指导方针吗?
谢谢!
image-processing - 使用 FSL 对 fMRI 图像进行下采样
我有一组 fMRI 图像。一组的维度为 90 x 60 x 12 x 350,体素维度为 1 x 1 x 1 mm(350 个体积)。另一组的尺寸为 80 x 35 x 12 x 350,体素尺寸为 0.2 x 0.2 x 0.5 mm。我正在使用其中一张图像作为参考图像进行注册。由于分辨率不同,注册失败(调情)。所以我必须先下采样或上采样。我尝试了以下方法:
调情 -in input_image \ -ref good_size_image \ -out output_image \ -applyxfm \ -init /usr/share/fsl/5.0/etc/flirtsch/ident.mat
这不起作用,不适用于下采样,也不适用于上采样。
我应该如何进行正确的下采样/上采样?
c++ - DICOM 图像 ITK-VTK 的正确显示(图像太暗)
我使用 itk::ImageSeriesReader 和 itk::GDCMImageIO 使用 ITK 读取 dicom 图像,然后使用 itk::FlipImageFilter 翻转图像(以获取图像的正确方向)并使用 itk::ImageToVTKImageFilter 将 itkImageData 转换为 vtkImageData。我在 QVTKWidget2 中使用 vtkResliceImageViewer 使用 VTK 可视化图像。我设置:
我设置了以下黑白 LookUpTable:
我的软件中显示的图像与其他软件中显示的相同图像相比要暗得多,我无法获得与其他 DICOM 查看器相同的效果
我的软件图像是正确的,当我在此示例中使用其他一些 LookUpTable 时,其他软件图像也会留下流我无法获得相同的效果(第 2 行图像),我右侧的图像比其他图像暗得多。
我错过了什么为什么我的图像更暗我该怎么办?我对 dicom 进行了很多研究,但 ikt/vtk 找不到好的解决方案,感谢您的帮助。
dicom - 断层合成图像:确定方向
我正在尝试找到数字乳房断层合成多帧 DICOM 图像的方向(头脚、外侧-内侧)。任何人都可以告诉我如何实现这一目标?基本上我应该检查哪些 DICOM 标签?
mysql - MRREL 上的 NIH UMLS 数据模型
我正在使用 MySQL 本地副本中的统一医学语言系统 (UMLS) 数据库。我目前正在尝试通过此网页了解数据结构:http ://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9685/
我正在尝试识别 CUI2 中的概念。但是,我对这个结果感到困惑:
正好 1 个结果。与其胡乱猜测——是不是我的 sql?这是桌子上的错误吗?我误解了模式吗?——我非常感谢 UMLS 社区的一些反馈。如何正确地将 MRREL.cui2 链接到数据库中的其他表?是否在某处发布了完整的数据模型?
谢谢!
medical - 体绘制中的 Hounsfield 值
我想知道在可视化 CT 数据集时如何处理 hounsfield 值。由于 HU 单元的范围包含可能难以处理的负值(例如在光线投射期间与衰减因子相乘时),我假设它们被转换为范围 [0,1],其中 0 表示空气( -1000 HU)和 1 块骨头(~3000HU)。
我在这个假设中正确吗?不是每个实数都可以用浮点数表示的问题如何处理?
matlab - 具有不同切片数的两个体积的图像配准
我正在尝试注册来自大脑的两个体积图像(PET 和 CT 甚至 PET 和 MR)。这些体积图像中的每一个都包含不同数量的 2D 图像(切片)。例如,CT
有150
切片和PET
有100
切片。我正在考虑使用插值方法来计算 CT 切片的数量并将其减少到 100。这是正确的方法吗?有谁知道任何可能对我有帮助的资源?就像一个伪代码,或者我应该通过注册两个体积图像的步骤。谢谢 :)
html - Schema.org/MedicalWebPage - 专业识别的正确用途是什么?
我正在尝试将 schema.org 标记添加到脊椎治疗网站。我的问题是如何确定要使用的标记,以便我们的网站在患者寻找有关症状/治疗的信息时显示更多有用的 SERP。
我们的网站管理员有一堆疯狂的 HTML,我在现有代码中插入了我想要的模式标记。您必须使用<body>
标签还是可以在标签中显示itemscope
和?itemtype
<p>
我想将此标记用于描述产前脊椎按摩治疗的页面:
这是实现标记的最佳方式吗?我没有看到脊椎按摩疗法的专业,否则我会把它放在那里而不是产科。