问题标签 [medical]
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python - Pyparsing：提取可变长度、可变内容、可变空白子串
我需要从前列腺切除术最终诊断报告的平面文件中提取 Gleason 分数。这些分数总是有 Gleason 这个词和两个数字相加成另一个数字。人类在二十多年内输入了这些。包括各种空格和修饰符的约定。以下是迄今为止我的 Backus-Naur 表格，以及两个示例记录。仅针对前列腺切除术，我们正在研究超过一千个病例。
我使用 pyparsing 是因为我正在学习 python，并且对我对正则表达式写作的有限接触没有美好的回忆。
我的问题：如何在不解析可能出现在这些最终诊断中或可能不在这些最终诊断中的所有其他可选数据的情况下提取这些 Gleason 等级？
全面披露：我是一名从事研究的医生；这是我第一次真正使用 python 工作。我读过 Lutz 的 Learning Python，Shaw 的 Learning Python the Hard Way，并解决了各种问题集。我在这个论坛 pyparsing wiki 上查看了许多与 pyparsing 相关的问题，我购买并阅读了 McGuire 先生的 Pyparsing 入门。也许我在问一个问题，当我真的应该被告知我正站在“当你必须编写解析器时，这种沮丧的死亡螺旋很常见”（McGuire，17）？我不知道。到目前为止，我很高兴能够从事可能实际上是一个真正的项目。
php - HL7 - 触发 SIU 从 EMR 中提取信息
我正在寻找一种使用 HL7 从 EMR 中提取信息的方法。我需要从现有的 EMR 中获取调度信息。我需要的所有信息都在 SIU 消息中。但是，据我了解，这些只是通知并提供新信息的提要。我需要一种方法来为每个现有的调度记录触发 SIU-12，以便提取所有调度日期/时间。有没有办法用 HL7 实现这一点？
谢谢！
iphone - 是否可以使用医疗材料编写我自己的应用程序？
我目前正在医学实验室实习
他们想购买 Ipad 和与之相连的医疗设备
例如：糖尿病检测仪http://www.ibgstar.us/ 血压监测系统http://www.ihealth99.com/
我想知道我是否可以编写自己的应用程序来从医疗设备获取数据然后处理它？
谢谢你的回答
image - 从 Sirona Galileos 设备获取图像
我的任务是尝试获取由 Sirona Galileos 设备 http://www.sirona.com/en/products/imaging-systems/galileos/创建的图像，并将它们显示在移动设备上。移动设备部分不是问题，而是获取存储在此设备上的图像。
stackoverflow 上有没有人曾经开发过这样的东西？我真的有点超出我的深度，任何信息或评论将不胜感激！
dicom - 读取 DICOM 1.2.840.10008.1.2.4.70
读取 DICOM 文件时出现问题。这是格式 1.2.840.10008.1.2.4.70（具有一阶预测的过程 14（选择值 1）。我编写自己的软件。
这是我工作的结果。
我还给你一个.dcm 文件。
它有什么问题？只有 RadiAnt Dicom Viewer 可以正确打开它（我没有找到任何带有源代码的工作软件）。有人有关于它的教程吗？任何工作代码？
我将不胜感激！感谢帮助。
我告诉你我是怎么做的：
我必须在哪里分这 1000？
machine-learning - 疾病命名实体识别
我有一堆描述疾病的文本文件。这些文件在大多数情况下都很短，而且通常只包含一个句子。这里给出一个例子：
原发性肺动脉高压是一种进行性疾病，其中最小的肺动脉广泛闭塞导致肺血管阻力增加，随后导致右心室衰竭。
我需要的是一个工具，它可以在句子中找到所有疾病术语（例如，在这种情况下为“肺动脉高压”）并将它们映射到像MeSH这样的受控词汇表。
提前感谢您的回答！
parallel-processing - 如何并行化现有的可执行文件？
在实验室中，我们有一个用于 MRI 分析的软件，其中涉及大量数据处理。有没有办法在不编辑程序本身的情况下将程序生成的负载重新分配到多台计算机/GPU 上？
java - HL7 CDA Undefined clinical data
I recently started studying HL7 CDA r2 documents, because I have some clinical data that needs to be as HL7 standards demands.
My doubt is the data I have (Body Mass Index (BMI), Weight, Height,BMI State, Sex, Age, Name ) doesn't fit in any template that CDA has.
Question: So, how can I build a CDA document with the data I have??
python - 使用 numpy 从卷中提取并保存切片
我正在尝试使用 numpy 从卷中提取切片。体积是 512x512x132，我想要切片号 66。每个体素都是一个无符号的 16 位整数。
我的代码是：
代码很干净，但是当我用外部程序打开切片时，它不是切片数据而是垃圾。
我做错了什么？
谢谢
c - MISRA 等同于医疗行业？
就像标题一样，是否有与汽车行业的 MISRA 相同的医疗行业文件、标准或任何一套？
我在 C 领域工作，但任何与语言无关的东西也会很好