mysql - MRREL 上的 NIH UMLS 数据模型

Question

我正在使用 MySQL 本地副本中的统一医学语言系统 (UMLS) 数据库。我目前正在尝试通过此网页了解数据结构：http ://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9685/

我正在尝试识别 CUI2 中的概念。但是，我对这个结果感到困惑：

SELECT y.* FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI;

正好 1 个结果。与其胡乱猜测——是不是我的 sql？这是桌子上的错误吗？我误解了模式吗？——我非常感谢 UMLS 社区的一些反馈。如何正确地将 MRREL.cui2 链接到数据库中的其他表？是否在某处发布了完整的数据模型？

谢谢！

Answer 1

布莱恩，

不知道您是如何创建子集的，我稍微修改了您的查询，并针对 2015AA 版本中的完整 Metathesaurus 子集运行它。 SELECT count(DISTINCT y.cui) FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI ; 我取回了 3074046 个独特的 CUI。也许您可以将您的 mmsys.log 文件发送给我，以确保您的子集正确完成？此外，您还可以在我们的网站上提供几个 ER 图和示例查询，以帮助理解 RRF 数据模型。另外，您的 MRREL 表中有多少行？