问题标签 [lme4]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - 一张图中两个随机效应的点图

如果我制作一个具有两个随机效应的简单混合效应模型:

我可以像这样访问随机效果:

我没有设法将随机效应绘制在两个彼此相邻的单独点图中。以下代码确实绘制了两个图,但我不管理重新编码,以便我可以分别绘制每个图:

以下对我来说似乎是合乎逻辑的,但它是不正确的

感谢所有帮助,

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r - Error when trying to run lmer() in R

So here's my problem. I have a data set in R that I need to run a mixed effects model on. Here's the code:

When I try to run the script, it returns the following error:

I have tracked the error down to the "follows" parameter because when I just use stress_limit and word_position, it runs fine. If it helps, the data in "follows" are only 3 strings: n or l, consonant, vowel. I've tried replacing the spaces with _ but with no success. Is there something about the internal workings of the lmer() function that is preventing the use of "follows" in this case? Any help would be great!

For more info: intdiff contains numeric values, stress_limit is strings (Stressed or Unstressed) and word position is also strings (Word Medial or Word Initial).

EDIT: Here is a data sample that reproduces the error:

I tried the lme() function as well, but it returned this error:

The code in my original post is the exact code I'm using, minus the library(lme4) call, so I'm not leaving any information out I can think of.

My R version is 2.15.2

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r - 在 R 2.15.2 上安装 Ime4 和 ggplot2 时出现问题

我在安装 lme4 和 ggplot 包时遇到了困难

我尝试通过选择 CRAN 镜像(尝试了几个)然后选择软件包来安装它们,并且还尝试了以下方法;

但是我尝试调用这些包我收到警告消息

或者

对于安装这些软件包的问题,​​我能找到的唯一答案建议将 R 升级到最新版本,但我使用的是 2.15.2,我认为这是最新版本。

有没有其他人有这个问题?

任何帮助将不胜感激!!

谢谢。

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r - lme4/Matrix:未找到入口点 - 如何修复?

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r - 有没有办法将协方差矩阵(或类似的东西)输入到 R 中的 lme4 中?

我有一个从数据仓库中提取的非常大的数据集。将数据集下载到我要运行 lme4 的盒子需要很长时间。我想知道我是否可以将数据处理成协方差矩阵,下载该数据(要小得多),并将其用作 lme4 的数据输入。我已经为使用 SAS 的多个回归模型做了类似的事情,并希望我可以为 lme4 创建这种类型的输入。

谢谢。

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r - 评估线性混合模型中的似然函数(lme4)

我目前正在编写一个脚本来评估用于线性混合模型的(受限)对数似然函数。我需要它来计算模型的可能性,其中一些参数固定为任意值。也许这个脚本对你们中的一些人也有帮助!

我使用lmer()fromlme4logLik()检查我的脚本是否正常工作。看起来,事实并非如此!由于我的教育背景并不真正关心这个级别的统计数据,我有点迷失了发现错误。

接下来,您将找到一个使用 sleepstudy-data 的简短示例脚本:

也许这里有一些 LMM 专家可以提供帮助?无论如何,非常感谢您的建议!

编辑:顺便说一句,LMM 的似然函数可以在 Harville (1977) 中找到,(希望)可通过此链接访问: 方差分量估计和相关问题的最大似然方法

问候,西蒙

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r - 如何制作要在 R 的 for 循环中使用的 lmer 模型对象列表?

我正在尝试在 R 中编写一个 for 循环(我的第一个!),以便生成和保存使用 lme4 包中的函数 lmer 拟合的几个混合效果模型的诊断图。这是我迄今为止所做的,以 sleepstudy 数据为例:

输入 R consol 时收到以下错误消息:

我感觉问题与我创建的模型列表有关,而不是与 for 循环本身有关,我认为这可能与 S4 类的模型对象有关。有可能制作这样的清单吗?我也尝试制作如下列表,但没有任何改进(仍然收到相同的错误消息)

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r - 纵向数据

我一直在使用“nlme”包中的 R Orthodont 数据集。只是用来install.packages("nlme");library(nlme);head(Orthodont)看看。该数据集包含随时间推移在 27 名儿童中测量的垂体和翼上颌裂之间的距离。 在此处输入图像描述 使用 lme4 包,我可以使用逻辑曲线作为我的函数形式来拟合非线性混合效应模型。我可以选择将渐近线和中点作为随机效应输入

我真正想知道的是性别是否会改变这些参数。不幸的是,在线示例不包括主题和组示例。这甚至可以使用 lme4 包吗?

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r - 在 lmer 模型上运行时 anova 输出空白

我正在尝试使用 lme4 库运行方差分析模型。我没有任何真实数据,所以我只是从 MASS 中提取了 Cars93 数据。虽然我可以让 lmer(...) 工作,但我似乎无法让 anova 表打印。

这是发生的事情:

任何帮助或建议将不胜感激。

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r - 在 R 中模拟 lmer() 模型中的交互效果

是否有具有以下功能的 R 包:

(1) 模拟交互变量的不同值,(2) 绘制图表,展示交互中项的不同值对 Y 的影响,以及 (3) 与拟合 lmer( ) lme4 包的功能?

我查看了 arm、ez、coefplot2 和 fanovaGraph 包,但找不到我要找的东西。