问题标签 [glmnet]

我正在使用 glmnet 运行 coxph 模型。以下是我正在使用的代码：

但是，我收到以下错误：

但我没有在我的数据中看到任何负面事件时间。

任何帮助是极大的赞赏！

我正在尝试使用glmnet包中的glmnet来运行 LASSO 回归。

我正在使用以下命令：

我得到了错误：

a是一个矩阵，有数值。 b是一个以因子为值的向量。

但是，b有一些缺失值。我怀疑这可能是导致错误的原因。NA但是，我在 glmnet 文档中没有看到排除 s 的选项。

我在我的 Mac（OS X 版本 10.9.4）上安装了 R 的glmnet包的 1.9-8 版本，并且我使用的是 RStudio 版本 0.98.1091。尝试运行该函数时，在导入glmnet后出现predict.cv.glmnet以下错误：library(glmnet)

但是，我确信glmnet包支持此功能，因为 1）它存在于帮助文件中，并且 2）它存在于包的参考手册中。

任何帮助将不胜感激！

我正在尝试计算auc但有一个奇怪的问题。当我运行这个脚本时：

我得到：

当我再添加一行并运行时：

我得到：

知道这里发生了什么吗？

我刚刚在 R 的 glmnet 中找到了一堆我想在 glmnet 中使用的天气数据。首先我一直在阅读和组织 R 中的数据，现在我只是想查看每个变量的原始数据. 不幸的是，每个变量都有很多数据，R 无法全部打印出来。有没有办法可以查看 R 中的所有原始数据或仅在文件本身中查看？我试过用excel打开文件没有成功。谢谢！

我正在尝试使用glmnet. 我的代码如下：

使用预测时，我不断收到此错误消息：

as.matrix(cbind2(1, newx) %*% nbeta) 中的错误：在为函数“as.matrix”选择方法时评估参数“x”时出错：t(.Call(Csparse_dense_crossprod, y, t) 中的错误(x)))：在为函数“t”选择方法时评估参数“x”时出错：错误：文件 ../MatrixOps/cholmod_sdmult.c 中的 Cholmod 错误“X 和/或 Y 尺寸错误”行90

我已经在“Hitters”数据集上尝试过这个，它工作得很好。

有谁知道我该如何解决这个问题？

在过去的几个月里，我参与了许多项目，我使用该glmnet软件包来拟合弹性网络模型。这很棒，但与大多数 R 建模功能相比，界面相当简单。特别是，您必须给出响应向量和预测矩阵，而不是指定公式和数据框。您还失去了常规界面提供的许多生活质量方面的东西，例如对因素的明智 (?) 处理、缺失值、将变量按正确顺序排列等。

所以我通常最终编写了自己的代码来重新创建公式/数据框接口。由于客户保密问题，我最终也留下了这段代码，不得不为下一个项目重新编写它。我想我不妨硬着头皮创建一个实际的包来做到这一点。但是，在我这样做之前有几个问题：

• 使用带有弹性网络模型的公式/数据框接口是否存在任何复杂的问题？（我知道标准化和虚拟变量，宽数据集可能需要稀疏模型矩阵。）
• 是否有任何现有的软件包可以做到这一点？

我有一组 R 脚本，它们定义了一个 S3 类，该类使用不同的方法、模型类型和成本函数搜索大型协变量空间。为了可视化搜索的进度，我定义了一些特定于类的绘图方法，并使用方法调度来确保类看到正确的函数。具体来说，我将绘图方法定义为plot.fs_forward_model等。我还有一个文件，其中方法调度函数定义为，例如，plot = function(x, ...) UseMethod('plot', x)

这一切都很好，我的一组课程以这种方式工作得很好。但是，当我使用 glmnet 并且想要创建套索结果图时，我收到了一个似乎源于我的方法调度行的错误。回溯看起来像这样：

第 1 行是我调用 glmnet 来绘制 glmnet 对象的调用，即llr=glmnet(x, y, family='gaussian')

非常感谢任何有关如何确保我的方法调度不会干扰其他包的提示。

可以对来自家庭的响应执行glm带有逻辑链接函数的模型拟合，binomial然后可以应用step函数来根据信息标准（如 AIC 或 BIC）提取解释特征的最佳子集。

cv.glmnet有没有人为函数或包glmnet的输出模型执行过这样的过程glmnet？您能否建议如何重现常规glm模型和cv.glmnet模型中使用的相同方法？

下面的这个看起来不起作用：

在下面的代码中，我试图创建一个矩阵来列出每个城市的 opt.lam。运行循环后，前两个城市总是工作，然后我得到任何城市的错误。

这是我得到的错误。（coefmatrix 工作正常，它只是产生此错误的 lambdamatrix）。

[<-( *tmp*, , i, value = c(0.577199381062121, 0.577199381062121, : 下标越界) 中的错误

这是我的代码：