r - 在 R 中运行 glmnet 包，得到错误“需要 TRUE/FALSE 的缺失值”，可能是由于缺失值？

Question

我正在尝试使用glmnet包中的glmnet来运行 LASSO 回归。

我正在使用以下命令：

library(glmnet)
glmnet(a,b,family="binomial",alpha=1)

我得到了错误：

> Error in if (!all(o)) { : missing value where TRUE/FALSE needed

a是一个矩阵，有数值。 b是一个以因子为值的向量。

但是，b有一些缺失值。我怀疑这可能是导致错误的原因。NA但是，我在 glmnet 文档中没有看到排除 s 的选项。

Answer 1

由于glmnet不接受带有公式的完整数据框（因此没有 na.omit），但使用单独的响应和预测矩阵，您将必须找到其中b缺少哪些值，然后对预测矩阵进行子集化以排除这些行.

library(glmnet)

set.seed(123)
a <- matrix(rnorm(100*20),100,20)
b <- as.factor(sample(0:1,100,replace = TRUE))

b[10] <- NA

na_index <- is.na(b)
res <- glmnet(a[!na_index, ], b[!na_index], family = "binomial", alpha = 1)