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我正在尝试使用 NetworkX 构建具有动态节点属性的网络。我尝试了以下方法：

但是，当使用nx.write_gexf(G, 'test.gexf')文件加载到 Gephi 中时写入很好，但没有显示时间线。

将动态节点属性输入到 networkx 节点以写入 gexf 文件的正确格式是什么？

这是我想要实现的一个例子。这很简单，一些 Gephi 专家可以帮助我。我希望节点大小增加到该节点的入度比例。正如您可能已经想到的，这显然是一个有向图。

我面临着让 Gephi（可视化软件）在我的 Mavericks 上运行的问题。正如您可能会问的，让我告诉您，我曾尝试从 Apple 网站安装 Java 6，但无济于事。要么软件没有启动，要么不显示图形，要么给出 nullpointerexception 错误。该软件在运行 Windows 8 的 VMWare 上运行良好，但这不是问题。问题是让 Gephi 在我的 Mac/Mavericks 中运行。

我有一个表，表示网络中的节点及其路径。所以它基本上是一个图表。

像这样的东西：

所以这意味着，要到达中国，你必须通过节点 13,16 和 1。路径由边表示。所以

现在，像 gephi 这样的图形软件可以轻松地将这些数据导入其应用程序以自动绘制图形。但无论如何，我的陈述并不符合他们所拥有的。要在 grephi 中构建图表，我需要一个名为

节点：包含节点列表（例如 13、16、1、13）

和

边缘：包含节点之间的连接，例如：

所以我的问题是，有什么更好的方法可以从我已经拥有的东西中获得这种表示？这是否意味着创建这两个表，如果是这样，我如何使用该模式自动化该过程？还是我应该提取数据然后将其解析为 gephi 图形格式？

我在 sigma.js JavaScript 库中使用 gexf 文件格式在 JSF 中绘制图形。

我以这种方式将 gexf 模板保存在 graph.xhtml 文件中的 ui:fragment 标记中：

sigma.js 库以这种方式使用 graph.xhtml：

parogram 使用 ManagedBean 以这种方式初始化 graph.xhtml 文件中的节点和边值：

一切正常，图表已绘制。我希望用户能够将 graph.xhtml 文件下载/保存为 XML 格式，以便能够在 Gephi 等其他实用软件中使用它。

我该怎么做才能将 xhtml 文件转换为 xml？

谢谢。

最近我遇到了问题。当我使用 Seadragon 插件从 Gephi 导出图表时，第一个缩放级别很远，在第一个缩放级别上它甚至不可见，在第 5 个缩放级别上，整个图表的直径约为 10 像素。PNG正在以适当的方式导出。昨天 Seadragon 出口工作正常。任何想法如何解决这个问题？

因此，例如对于大小为 200px 的图块，这是map_files/8（称为0_0.png） 中的唯一文件

图像是156 x 156. 所以你几乎看不到缩放级别 8 的图像（第一个缩放级别是 0）。

我是 Gephi 新手，想在 Gephi 中创建简单但特定的网络网络。

我将如何创建输入文件或绘制图形？是否有我可以用来执行此操作的 api (python)？

谢谢，

克里斯

所以我有大约 250 万个节点来自不同的来源，主要是系统发育树和来自数据库的其他数据。我正在尝试使用 sigmajs 实现来可视化网络地图，并开始使用脚本编写 xml。我无法理解的是如何计算 x 和 y 位置？les_miserable 可视化清楚地表明它是有序的，而 gexf 文档并没有详细说明我们应该如何计算 x 和 y 坐标。使用三个节点修补位置并没有对这个问题有太多了解，而且 gephi 网站似乎从我的角度来看。如果有人可以解释如何在涉及 4 或 5 个集群的复杂网络地图中计算 x 和 y 坐标，那将非常有帮助。

我有具有 nodeweight 的节点和具有edgeweight的边。我想用公式 edgeweight=(nodeweight * old_edgeweight) 覆盖 edgeweight。

我认为应该有一些方法可以使用控制台。控制台是唯一的方法吗？任何类似excel的公式呢？

谁能告诉我如何使用从 LinkedIn 下载的 csv 文件构建导入节点和边缘 csv 文件以在 Gephi 中创建网络图，我已经看过这个问题，但可以找到的很少。

谢谢