问题标签 [gephi]

我想用 python 在本地流式传输 JSON（以便另一个程序读取它）。是否有任何包以干净的方式流式传输本地地址中的 json？（因为我使用了 print 但不是终端，而是本地 url）。

谢谢

操作系统：Windows 7

我在将 Neo4j DB 导入 Gephi 时遇到问题。

完成完全导入后，我收到此错误“提取数据时发生错误”

这里问了同样的事情 http://grokbase.com/t/gg/neo4j/1327rse2nf/problem-importing-neo4j-db-into-gephi

有没有人看到或找到这方面的更新或解决方案？

谢谢j

更新：寻找日志我发现了这个http://wiki.gephi.org/index.php/HowTo_report_a_bug - 但它指向的目录不存在。

C:\Users\Bob\AppData\Roaming.gephi(gephi_version)dev\var\log\message.log

I imported the nodes and edges csv files into the Gephi tool and exported the DB, and copied that DB into Neo4j.

when i run the Cypher.

its throwing error, i had enabled auto indexing to true in neo4j.properties,how to resolve the problem?

我正在尝试在 POM.xml 文件中添加 Gephi 的依赖项（在 Eclipse 中）。这是POM文件：

您可能会注意到，依赖项是针对 Gephi。这是错误消息的一部分，如下所示：

谁能帮我解决这个问题？我不知道为什么 POM 不接受 Gephi 依赖项，但是我已经添加了一些其他依赖项，例如 openrdf 和 restfb。我还添加了 POM 文件中所示的 Gephi 存储库。非常感激你的帮助。

我正在将一个 .gml 文件导入 Gephi，我使用 python 模块 networkx 构建该文件。我所有的节点属性和标签都是作为字符串而不是浮点数导入的，这会弄乱几件事（使用节点属性进行视觉效果，并访问脚本控制台中的节点列表）。有没有办法以正确的方式导入数据？它会改变任何东西以作为不同的图形格式导入到 Gephi 吗？我这样做是为了以编程方式在 Gephi 中绘制图形。谢谢！

我用java生成了一些dot文件，但是Gephi 0.82只能正确打开一部分。对于某些文件，边数和节点数显示为 0，没有其他错误信息。事实上，Gvedit 可以正确打开它们。以下是失败的文件：

当我尝试将 Neo4j 数据库导入 Gephi 时收到此消息：

org.neo4j.kernel.impl.storemigration.UpgradeNotAllowedByConfigurationException：无法使用旧数据存储版本启动 Neo4j。要启用自动升级，请在 org.neo4j.kernel.impl.storemigration.StoreUpgrader.attemptUpgrade( StoreUpgrader.java:50) 在 org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.NeoStore.tryToUpgradeStores(NeoStore.java:170) 在 org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.NeoStore.checkVersion(NeoStore.java: 137) org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.CommonAbstractStore.(CommonAbstractStore.java:104) org.neo4j.kernel.impl.nioneo.store.AbstractStore.(AbstractStore.java:120) org.

奇怪的是，配置参数“allow_store_upgrade=true”已经设置为 true。我使用的是 neo4j-community-2.0.0-M06，Java 版本是：

java 版本“1.7.0_45”Java(TM) SE 运行时环境（构建 1.7.0_45-b18）Java HotSpot(TM) 64 位服务器 VM（构建 24.45-b08，混合模式）

我应该做些什么？Java版本是最新的，所以Neo4j ...

我正在编写从 gexf 格式读取图形、添加节点和边并将它们写回 gexf 的脚本。我的问题是 write_gexf 正在给我添加边缘 id 的边缘，这些边缘 id 已经存在于我读入的边缘中。

例如，假设我读到一个G只有一条边的图表。

然后我添加一条边并将图形写入 gexf：

现在，如果我读到“second.gexf”，我会得到两条边，“id”等于“0”。

有没有办法避免这种情况？

我想在 gephi 中布局一个网络图，在许多情况下，它看起来像下面的那个。什么是我的布局的好选择？

在我的 gephi 安装抱怨内存不足并尝试自行重置内存限制后，我遇到了巨大的不可靠性。这不起作用并且VM无法启动，所以我通过编辑通过我的开始菜单访问的配置文件手动将内存重置为1024，这不起作用，然后重置为512。

该系统现在非常不可靠。每次我尝试使用它时都会冻结和崩溃。我尝试放弃我的项目（不是很大 - 11k 个节点）以防项目文件损坏，并尝试往返检查点，从“以防万一发生灾难”csv 读取边缘和节点列表到空白项目我做了边缘和节点列表导出。它读取节点列表正常，但不会读取边缘列表并再次冻结。日志文件包含大量关于不推荐使用的 netbeans 使用的警告，然后是关于 java 数组索引超出范围的最终“严重”警告。这对我来说听起来不像是我可以做任何事情的事情......但希望永远存在。

除了将其全部清除并重新安装之外，是否有任何人可以提供任何实用技巧来帮助保持 gephi 快乐？

我在 XP SP3 上使用最新的 Java、双核和 2 gig 的 RAM。

我编辑的配置文件与日志文件消息位于不同的系统路径上。配置文件是一个通用路径，日志文件是特定于我作为用户的。从文档中我可以看出，我认为这应该是最远的——但这可能是可疑的。我想知道我的内存限额重置是否实际上没有正确生效。但我不知道如何检查这个，除非通过配置。

我真的真的很喜欢 Gephi - 当它工作正常时。（但要完成我今天需要做的事情，我需要回到 R...）

谢谢！