问题标签 [gephi]

我试图在我的 java 应用程序中嵌入 gephi-toolkit。从他们的 Toolkit 门户页面上的简单示例开始。但它在第一个示例 Headless Gephi 中失败了，这里是失败的地方：

它说：

我试图挖掘他们的源代码，似乎该类不可用，但检查了他们的 api，它在那里列出。太奇怪了。有人有同样的问题吗？我正在使用他们的最新版本 0.9-SNAPSHOT

我正在使用 opencv 拼接模块以 .DOT 语言格式保存图形。

我可以使用 gephi 绘制此图，但是如何在图的边缘绘制连接的置信度并在图的顶点绘制 img？

我正在尝试使用 networkX 自定义图形（用于 gexf 格式）。但我无法设置节点的形状。在此处使用示例

但我不能写文件

错误是：

我错过了什么吗？

我正在尝试在 Gephi 中导出过滤图的数据表。初始图有大约 50000 个节点和 70000 条边。我使用 K-core 过滤器对其进行过滤，并且我想对这个过滤后的图进行一些计算。但是，当我导出它对应的数据表时，我得到的文件与原始输入文件相同。这意味着边和节点不会从数据文件中过滤出来，只会隐藏在可视化中。

有没有办法从 gephi 获取 csv 文件中的过滤数据？

我有一个 GraphML 图形文件。这是一个大文件。当我尝试在 Gephi 软件中打开此文件时，出现错误消息“jvm 创建失败”。我已经通过编辑其配置文件将大小增加到 1400mb。但再次出现该错误消息！

我该如何解决这个问题？或者是否有任何软件可以打开 GraphML 图形文件？

我正在尝试从 NetLogo do *.gexf 文件中保存 GraphStream/NetStream。图形具有恒定数量的边和顶点。正在改变的是节点/“海龟”的参数。目前，每次打勾后，我使用以下命令将信息从 NetLogo 发送到 2012 端口上的 localhost：

我可以在 java 项目中接收 GraphStream：

创建 CumulativeGraphAnalyser 的实例

这是 CumulativeGraphAnalyser 类

'graph' 变量中有我需要的所有信息，但我不知道如何将 GraphStream 保存到文件 (*.gxef) 中，然后将其导入 Gephi。另一种选择是直接从 localhost:2012 读取 Gephi 中的 GraphStream。我找到了可以处理此任务的插件，但我不知道如何正确使用它。我已经搜索并阅读了有关此问题的大量信息，并且尝试实施一些解决方案，但没有一个没有解决。

我正在使用具有限制使用数据且无法连接到互联网的 mac 计算机。我需要在计算机上安装一个名为 rgexf 的 R 模块。当我尝试按照此处的说明在 R 上安装它时：

我收到此错误：

我不明白为什么该软件包不适用于最新版本的 R。

当我导入我的 .gexf 文件时，它会标记一堆平行边。我不知道什么是平行边以及为什么我的图有问题。我正在尝试创建一个动态 gephi 图。

我正在尝试在 gephi 中创建一个动态图，以显示来自在线课程的讨论论坛的交互。节点是学生，边从提出问题的学生指向回答的学生。

我的许多边都被删除了，因为它们是“平行边”，这意味着它们连接了相同的两个人，但时间间隔不同。根据我的阅读，如果将它们编码为“咒语”，似乎可以显示这些平行边缘。

我将在 R 中使用什么代码来编写咒语？

I am having a hard time dragging multiple nodes on the screen with Gephi. The multi-select button allows me to select multiple nodes but not move them on the screen. Could this be a system issue (running Ubuntu on Mac)? I have searched the web but to no avail. Is anyone else having this issue?