问题标签 [gephi]

我正在尝试将 csv 转换为动态 gephi 图的 .gexf 格式文件。这个想法是让属性数据中包含所有平行边（具有相同源和目标但不同发布日期的边）。在示例中，属性中的所有日期都对应于 John 在在线课程的论坛中回答 Jan 的问题的发布日期。

如何获得如下所示的 csv：

变成如下格式：

我尝试过的方法效果不佳。我尝试创建两个列表，对于第一个列表中的每个条目，搜索以找到第二个列表中前两个条目的匹配项。如果匹配，那么我的脚本将删除第二个列表中的行并附加这对日期。每行代表提问者和回答者之间对应的完整数量，然后我会编写一个脚本来将该行转换为边缘/属性数据。我一直在使用它作为某种指南。

我有一个使用 Python 中的 networkx 包构建的图，该图具有与节点和边相关联的数据属性。这些属性本身就是带有嵌套字典的字典（或列表）。由于数据类型，我无法弄清楚如何将此图写入 .gexf 格式（或 .graphml 等）。

有没有办法让 write_gexf 将这些数据类型解析为 XML？还是有其他解决方法？

这是一个例子：

这给出了一个错误：

如果我已将文件导入容器，并且我想将另一个文件附加到前一个文件以使用 gephi 工具包生成更大的图形？

然后我想导入 graphmlFile1 来附加 graphmlFile，我该怎么做？

最近我在做一个网络可视化分析软件Gephi的项目，我用“.gephi”扩展名保存了它。但是，当我尝试重新打开文件时，它会给出以下错误消息：-

“无法打开项目文件。请检查文件是否具有 .gephi 扩展名。

我是 Gephi 的初学者，只是一个业余程序员。我不理解此错误消息，因此不知道如何解决它。我尝试将 Gephi 更新到最新版本。我还尝试从 Gephi 中打开文件。这些步骤都没有解决问题。任何人都可以帮我解决这个问题吗？

当我打开 Gephi 时，我收到以下错误消息：

我运行的是 Windows 8，我的显卡是 ATI Mobility Radeon HD 5000 系列（Microsoft Coporation -WDDM v1.20）。显然，此显卡支持 OpenGL 3.2（驱动程序信息）！为了解决这个问题，我用谷歌搜索并发现了这个：link1。这对我不是很有帮助，因为在我禁用驱动程序签名后，我不知道要下载哪个驱动程序！

1. 如何更新我的 OpenGL 版本（或真正导致问题的任何内容）以便 Gephi 工作？

如果您需要有关我的系统的更多信息，请告诉我！

我有一个 Neo4j 图表，我想使用 Gephi 进行可视化。我可以使用 Neo4j 插件导入整个图表，但我只想要查询返回的节点的视觉效果：

我已经研究过将图形导入 Gremlin，但是 groovysh_parse: 46: unexpected token: = @ line 46, column 6.当我尝试使用以下命令打开图形时，我会继续获取：$_g := neo4j:open('../gephiData/neo4j-community-1.9/data/graph.db')

我也尝试了遍历导入，但是当我尝试它时它永远不会显示任何内容。

我与 Gremlin 没有任何关系，但似乎无论如何都无法找到我想要进入 Gephi 的结果。

我有一个导入到 Gephi 的 Neo4j 数据库，但是当我单击“显示标签”时，它不显示任何文本，并且当我查看节点属性时，标签是空白的。

如何让 Gephi 将标签设置为我的节点属性之一？

我已经使用来自大型数据集的 R 创建了我的网络。我使用了一个较小的进行测试并编写了自己的绘图仪来显示我希望它如何显示，但我似乎无法正确显示它......

此图片显示了我的网络的外观。我尝试了数据的方阵 (36x36) 和导出为 CSV 的 1x36，但都没有给出我想要的结果。

忽略更大的圆圈，我希望网络显示在上图中。

版本 1 - 1x36 - https://www.dropbox.com/s/k4a7tc0kwlfqd0l/ABC.csv

版本 2 - 36x36 - https://www.dropbox.com/s/mmu7spix076bn6e/DEF.csv

结构如下。第 1 行和第 1 列 - 节点名称。所有数字决定是否存在边（0 或 1）。

当我尝试导入这些文件时，Gephi 会以一种不同寻常的方式解释它们。

有什么我做错了吗？

干杯

我有一些关于 Gephi 文件导出的问题（39 个节点和 38 个边的图）。导出（任何格式，png/pdf/svg）时，结果如下：

如何解决？

有什么方便的方法可以将 Neo4j 数据导出到 csv 或 GML（用于导入 Gephi）？我尝试通过以下命令使用 Gremlin：

但它返回“空”

我不确定到底发生了什么......我在 neo4j 数据库中有 200 万个节点和 500 万条边，顺便说一句。

我知道我可以使用 neo4j-plugin 将 Neo4j 完全导入 Gephi，但可能对于这种方式来说尺寸太大了.. Gephi 在导入大约 30 万个节点时会挂起..

如果有任何帮助，将不胜感激。谢谢。