python - 在 Python 中将 nx.write_gexf 用于在节点和边上具有 dict 数据的图

Question

我有一个使用 Python 中的 networkx 包构建的图，该图具有与节点和边相关联的数据属性。这些属性本身就是带有嵌套字典的字典（或列表）。由于数据类型，我无法弄清楚如何将此图写入 .gexf 格式（或 .graphml 等）。

有没有办法让 write_gexf 将这些数据类型解析为 XML？还是有其他解决方法？

这是一个例子：

1 import networkx as nx
2
3 G = nx.graph()
4 G.add_node(0, attr1 = { 'name1' : 'Alice', 'name2' : 'Bob' }, attr2 = 5)
5 G.add_node(0, attr1 = { 'name1' : 'Calvin', 'name2' : 'Hobbes' }, attr2 = 6)
6 G.add_edge(0,1, likes = ['milk', 'oj'])
7
8 nx.write_gefx(G,"test.gefx")

这给出了一个错误：

Traceback (most recent call last):
File "so_write_gefx.py", line 8, in <module>
nx.write_gexf(G,"test.gexf")
...
line 378, in add_attributes
for val,start,end in v:
ValueError: too many values to unpack

Answer 1

GEXF 格式仅指定一组相当简单的数据类型。在您的示例中，您将边缘数据属性“喜欢”设置为列表

G.add_edge(0,1, likes = ['milk', 'oj'])

这不是由 GEXF 作家处理的。

如果您坚持使用字符串、数字等，那么您将不会遇到此问题。