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在我的 gephi 安装抱怨内存不足并尝试自行重置内存限制后,我遇到了巨大的不可靠性。这不起作用并且VM无法启动,所以我通过编辑通过我的开始菜单访问的配置文件手动将内存重置为1024,这不起作用,然后重置为512。

该系统现在非常不可靠。每次我尝试使用它时都会冻结和崩溃。我尝试放弃我的项目(不是很大 - 11k 个节点)以防项目文件损坏,并尝试往返检查点,从“以防万一发生灾难”csv 读取边缘和节点列表到空白项目我做了边缘和节点列表导出。它读取节点列表正常,但不会读取边缘列表并再次冻结。日志文件包含大量关于不推荐使用的 netbeans 使用的警告,然后是关于 java 数组索引超出范围的最终“严重”警告。这对我来说听起来不像是我可以做任何事情的事情......但希望永远存在。

除了将其全部清除并重新安装之外,是否有任何人可以提供任何实用技巧来帮助保持 gephi 快乐?

我在 XP SP3 上使用最新的 Java、双核和 2 gig 的 RAM。

我编辑的配置文件与日志文件消息位于不同的系统路径上。配置文件是一个通用路径,日志文件是特定于我作为用户的。从文档中我可以看出,我认为这应该是最远的——但这可能是可疑的。我想知道我的内存限额重置是否实际上没有正确生效。但我不知道如何检查这个,除非通过配置。

我真的真的很喜欢 Gephi - 当它工作正常时。(但要完成我今天需要做的事情,我需要回到 R...)

谢谢!

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当您绝对内存不足时的一些提示: - 尽量减少节点和边的属性数量。理想情况下,你没有。- 微调 Gephi RAM 设置。Gephi安装页面说:

在具有 2GB 内存的计算机上,您可以设置 -Xmx1400 以获得最大性能。

如果 1024 对您的机器来说太高,而 512 太低,试试中间值?当然,杀死你机器上运行的任何不必要的进程。

于 2014-04-30T20:19:31.590 回答