问题标签 [density-plot]

我正在将一个三列表导入 Mathematica 并使用它来制作密度图。但是，除非您以小增量拥有大量数据，否则密度图看起来是不连贯的，并且显然不连续。

有没有办法或功能来平滑我的情节？

谢谢，本

我正在 Mathematica 中制作一些密度和等高线图。这些图有非常高的峰，颜色饱和，阻止我看到峰的差异。有没有办法可以降低色阶，使我的峰不仅仅是白色斑点？

尝试其他配色方案没有成功。

干杯，本

在下图中，您看到的都是紫色和白色，但白色区域的高度有所不同，但由于颜色饱和，因此看不到。ColorFunctionScale -> False，只会将所有东西变成两种颜色。

（对不起，如果我的英语不完美...... :-s）

我的问题与本主题几乎相同： 使用列表中的数据创建填充等高线图

但是，不同之处在于我想绘制与我的 (x,y) 坐标相对应的密度，仅在 1 个方向上！我解释一下：我有一个这样的data.frame：

X 表示 x 坐标，Y 表示 y 坐标，Z 表示仅在 Y 方向上的百分比密度。对于每个 x 坐标，我计算了 Y 方向的密度。结果在 Z 向量中。您可以看到它不是（x，y）中的常规网格。我想绘制密度 Z 的“等高线图”，但到目前为止，我没有成功......我尝试了这个命令：

但它绘制了 x 和 y 方向的密度，我只想要 Y 方向。当我尝试命令时：

它不尊重 (x,y) 坐标。并且不可能实现：

经过一些研究，我发现了这个主题，我的问题是一样的： 当数据不在常规网格上时如何绘制等高线图？

但答案并不对应：解决方案是（x，y）中的“常规网格”，这不是我所拥有的！有人可以帮忙吗？

谢谢 ！

我喜欢使用瓦片密度图来表示概率密度。我经常使用第二个（y）维度来说明因子之间的密度比较，但是我在引入第三个维度时遇到了麻烦。我想用颜色来表示第三维。我怎样才能做到这一点？（我尝试在下面的示例中插入aes引用，Type但它们似乎与..density..美学相冲突。）

从下面的情节开始，

我想要的是以下的组合。对于A: 和B:

从几年前开始，我使用 matlab 绘制我的图（主要是密度图），但现在我想改用 matplotlib。我在试图弄清楚如何在 matplotlib 中获得类似图时遇到问题。我必须代表一个二维数组。在matlab中我曾经使用surf函数，然后更改为view（2）（az = 0和el = 90）。一个例子：

在matplotlib中我尝试了一些功能，但我没有同样的感觉。m3plot 是一个计算成本很高的工具包，它与使用 surf 不同。imshow 不允许在他的参数中使用日志函数（如示例），并且日志值对我来说是强制性的。然后是 pcolor，但我找不到类似“FaceColor”的选项来平滑边缘。我想知道是否有人知道matplotlib中最好的等价物。感谢您的时间！

我正在尝试覆盖多个密度图，并希望它们都是不同的颜色。当我使用这个命令时：

情节（密度（Punta.Ona，na.rm=TRUE））

它没有问题，但是当我添加

col="矢车菊蓝"

我收到这条消息：

警告消息：在 density.default(Punta.Ona, na.rm = TRUE, col = "cornflowerblue") 中：不匹配的进一步参数被忽略

谢谢你的帮助！

我有一系列数据表明某种类型的 DNA 元素在多久以前在基因组中是活跃的。它可能看起来像这样：

因此，大约 10 年前存在三个活跃的“1 型”元素和 20 年前活跃的三个 2 型元素。

我使用 ggplot2 创建了一个堆叠密度图，以获取每个元素何时处于活动状态的分布，如下所示：

我有这些元素的相对丰度的信息，我想将每个元素密度的高度乘以该数字。这最终会给我这些元素在基因组中的实际活动丰度，而不仅仅是它们活动的分布。

所以我的问题归结为：如何根据组将每个元素类型的密度的高度转换/乘以某个因子？例如，如果我在基因组中有 1000 个 1 型元素，而只有 3 个 2 型元素，那么堆积密度图将由 1 型主导，您几乎看不到与 2 型相关的曲线。

我希望这是有道理的。提前致谢！

我正在尝试使用 ggplot 在 R 中制作密度图。我能够绘制轴和点，但没有密度。作为旁注，我对ggplot相当不熟悉。但是我的 z 轴只是一个值列表，当我绘制它时显示的只是一个点图。如何合并密度？

弹出的错误说有“矩阵的负范围”。我试过搜索这个，但没有运气。

这是我的代码：

我试图在下图的背景上有 2 个“阴影”。这些阴影应该分别代表橙色和蓝色点的密度。是否有意义？

这是要改进的ggplot：

df这是我用来创建此图的代码和数据（矩阵）：

Let's say we observed two species of beetles. We want to compare their size using geom_violin() as done below:

Knowing that the expected size range is [0.8,1.8] for species_a and [1.2, 1.8] for species_b...

How can we easily add this range (with a grey shape for example) on the graph?